RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534348.5

NEDD8-MDP1-202, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NEDD8-MDP1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LYRM1O43325 122 aa5.75□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RPL28P46779 137 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa5.75□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa5.75□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ALG5Q9Y673 324 aa5.75□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa5.74□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa5.74□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 G3V3Q6 166 aa5.74□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NCR2O95944 276 aa5.74□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MBP02144 154 aa5.74□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CST9LP1Q5W188 147 aa5.74□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GATD1Q8NB37 220 aa5.74□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 STOML3Q8TAV4 291 aa5.74□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SMDT1Q9H4I9 107 aa5.74□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C6orf48Q9UBA6 75 aa5.74□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa5.73□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C1orf196B1AJZ1 125 aa5.73□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NDUFA1O15239 70 aa5.73□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NUPR1O60356 82 aa5.73□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MPC2O95563 127 aa5.73□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PMCHP20382 165 aa5.73□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF726P1Q15940 193 aa5.73□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ORAOV1Q8WV07 137 aa5.73□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TLX1NBP0CAT3 122 aa5.72□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 H2BFSP57053 126 aa5.72□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BAGE2Q86Y30 109 aa5.72□□□□□ -1.49
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SDHAF1A6NFY7 115 aa5.71□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRGC1P0CF51 173 aa5.71□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM241Q24JQ0 296 aa5.71□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MRAP2Q96G30 205 aa5.71□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C22orf24Q9Y442 160 aa5.71□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BCE1O60756 84 aa5.7□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IGLC6P0CF74 106 aa5.7□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PET100P0DJ07 73 aa5.7□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SERF2P84101 59 aa5.7□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MZT2BQ6NZ67 158 aa5.7□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR10D4PQ8NGN7 298 aa5.7□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM242Q9NWH2 141 aa5.7□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TNFSF18Q9UNG2 199 aa5.7□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa5.7□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa5.69□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 I3L3M4 83 aa5.69□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CTRLP40313 264 aa5.69□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM229BQ4G0N7 80 aa5.69□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LYZL1Q6UWQ5 148 aa5.69□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa5.68□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TWIST1Q15672 202 aa5.68□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C3orf22Q8N5N4 141 aa5.68□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LINC00469Q8N7U9 141 aa5.68□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 A0A1B0GVG6 124 aa5.67□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SCO2A0A1W2PP80 73 aa5.67□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RPL37AP8A6NKH3 93 aa5.67□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa5.66□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa5.66□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PAGE4O60829 102 aa5.66□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UBE2AP49459 152 aa5.66□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C2orf82Q6UX34 121 aa5.66□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MARVELD1Q9BSK0 173 aa5.66□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CCDC32Q9BV29 185 aa5.66□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa5.65□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 F2Z2F3 143 aa5.65□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 F8WDY8 70 aa5.65□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 S100A9P06702 114 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RPS20P60866 119 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CTAG1AP78358 180 aa5.65□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C4orf48Q5BLP8 95 aa5.65□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DAND5Q8N907 189 aa5.65□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TCEAL7Q9BRU2 100 aa5.65□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa5.65□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 XAGE1AQ9HD64 81 aa5.65□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C7orf77A4D0Y5 90 aa5.64□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IFNA1P01562 189 aa5.64□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FHITP49789 147 aa5.64□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 XP32Q5T750 250 aa5.64□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 A0A1B0GV50 99 aa5.63□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GAGE10A6NGK3 116 aa5.63□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SSNA1O43805 119 aa5.63□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PCOTHQ58A44 107 aa5.63□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SPAG11AQ6PDA7 123 aa5.63□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 Q6ZUT4 128 aa5.63□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMUB2Q71RG4 321 aa5.63□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CYTL1Q9NRR1 136 aa5.63□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa5.62□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 COX6B2Q6YFQ2 88 aa5.62□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa5.62□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
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