RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533677.1

PAFAH1B2-208, Transcript of platelet activating factor acetylhydrolase 1b catalytic subunit 2, human

TSL 3

Gene PAFAH1B2, Length 756 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	FER1L6-AS1	Q8NA97	138 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	ISOC2	Q96AB3	205 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	SMIM12	Q96EX1	92 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	MRPS16	Q9Y3D3	137 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PAFAH1B2-208	ENST00000533677		V9GYV3	84 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PAFAH1B2-208	ENST00000533677		A0A1B0GWB2	263 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAFAH1B2-208	ENST00000533677		A8MWV9	139 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	EVI2A	P22794	236 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	SRI	P30626	198 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	RHOH	Q15669	191 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	ADIRF	Q15847	76 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	SPANXN1	Q5VSR9	72 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	FAM231D	Q6ZW35	169 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	UPK3B	Q9BT76	320 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	ABCA13	Q86UQ4	5058 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	TRAV26-2	A0A0B4J265	109 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	NBDY	A0A0U1RRE5	68 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	TRBV6-4	A0A1B0GX49	114 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	GATC	O43716	136 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	NDUFS6	O75380	124 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	MGP	P08493	103 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	ZNF56	Q15929	161 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	ZFP2	Q6ZN57	461 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	PGLYRP4	Q96LB8	373 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	DNAJC30	Q96LL9	226 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	CNFN	Q9BYD5	112 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAFAH1B2-208	ENST00000533677		A0A0J9YXY3	114 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	NTF3	P20783	257 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	FUS	P35637	526 aa	Known RBP eCLIP	4.63	□□□□□ -1.67
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	CCL18	P55774	89 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	RPS20	P60866	119 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	MRPL23	Q16540	153 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	NEGR1	Q7Z3B1	354 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	TMEM101	Q96IK0	257 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	AP1S3	Q96PC3	154 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	NAT8	Q9UHE5	227 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	LY96	Q9Y6Y9	160 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	HIGD1C	A8MV81	97 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	UBE2D3	P61077	147 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	UBE2D2	P62837	147 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	SLA	Q13239	276 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	PEA15	Q15121	130 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PAFAH1B2-208	ENST00000533677		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	NTM-AS1	Q6ZSK4	140 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	COMMD7	Q86VX2	200 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	MTURN	Q8N3F0	131 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	NUP35	Q8NFH5	326 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	RPL39L	Q96EH5	51 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	OSTC	Q9NRP0	149 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	PRO0461	Q9UI25	63 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	PCLO	Q9Y6V0	5065 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	SMKR1	H3BMG3	65 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAFAH1B2-208	ENST00000533677		M0QY20	66 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	SIVA1	O15304	175 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	TMEM241	Q24JQ0	296 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	SOHLH1	Q5JUK2	328 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	GATD1	Q8NB37	220 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	TSKU	Q8WUA8	353 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	RNF185	Q96GF1	192 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	PRADC1	Q9BSG0	188 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	SMIM27	A0A1W2PRY6	76 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	NCR2	O95944	276 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	IGHV3-30	P01768	117 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	IGHV3-33	P01772	117 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	IGHV3-30-3	P0DP02	117 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	IGHV3-30-5	P0DP03	117 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	RPS10	P46783	165 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	RAB4B	P61018	213 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	RAB14	P61106	215 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	CACNG7	P62955	275 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	AMN1	Q8IY45	258 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	GTSF1L	Q9H1H1	148 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	DPH3P1	Q9H4G8	78 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	BIN3	Q9NQY0	253 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	DAZ3	Q9NR90	486 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	TRBV7-3	A0A075B6L6	115 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	XKRY2	A2RUG3	117 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PAFAH1B2-208	ENST00000533677		A8MWL6	223 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PAFAH1B2-208	ENST00000533677		F2Z2F3	143 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	OR10J3	Q5JRS4	329 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	LELP1	Q5T871	98 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	MRPL54	Q6P161	138 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	DAZ4	Q86SG3	579 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	C6orf223	Q8N319	242 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	SMDT1	Q9H4I9	107 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	FAT1	Q14517	4588 aa		4.59	□□□□□ -1.68
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	TRBV10-1	A0A0K0K1A3	114 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAFAH1B2-208	ENST00000533677		A0A1B0GXF2	115 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	TMEM218	A2RU14	115 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	LINC00862	A6NCI5	91 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	TRGC1	P0CF51	173 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	SMIM17	P0DL12	118 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	WFDC2	Q14508	124 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	MPV17L2	Q567V2	206 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	C1orf134	Q5TEV5	83 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	C20orf203	Q8NBC4	194 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAFAH1B2-208	ENST00000533677	PKHD1L1	Q86WI1	4243 aa		4.57	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 308.5 ms