RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533557.5

BBS1-222, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 1,043 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-222	ENST00000533557	SDHAF1	A6NFY7	115 aa		7.11	□□□□□ -1.27
BBS1-222	ENST00000533557	TRGC1	P0CF51	173 aa		7.11	□□□□□ -1.27
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF25	P17030	456 aa	Predicted RBP	7.11	□□□□□ -1.27
BBS1-222	ENST00000533557	SS18	Q15532	418 aa		7.11	□□□□□ -1.27
BBS1-222	ENST00000533557	C10orf25	Q5T742	122 aa		7.11	□□□□□ -1.27
BBS1-222	ENST00000533557	C2orf48	Q96LS8	159 aa		7.11	□□□□□ -1.27
BBS1-222	ENST00000533557	CARHSP1	Q9Y2V2	147 aa	Known RBP	7.11	□□□□□ -1.27
BBS1-222	ENST00000533557		F2Z2F3	143 aa		7.1	□□□□□ -1.27
BBS1-222	ENST00000533557	TSHB	P01222	138 aa		7.1	□□□□□ -1.27
BBS1-222	ENST00000533557	FAM19A5	Q7Z5A7	132 aa	Predicted RBP	7.1	□□□□□ -1.27
BBS1-222	ENST00000533557	C5orf38	Q86SI9	138 aa		7.1	□□□□□ -1.27
BBS1-222	ENST00000533557	C9orf62	Q8N4C0	152 aa		7.1	□□□□□ -1.27
BBS1-222	ENST00000533557	MBD3L1	Q8WWY6	194 aa		7.1	□□□□□ -1.27
BBS1-222	ENST00000533557	RAB19	A4D1S5	217 aa		7.09	□□□□□ -1.27
BBS1-222	ENST00000533557	RPS20	P60866	119 aa	Known RBP	7.09	□□□□□ -1.27
BBS1-222	ENST00000533557	CENPW	Q5EE01	88 aa		7.09	□□□□□ -1.27
BBS1-222	ENST00000533557	RNASE13	Q5GAN3	156 aa	Known RBP	7.09	□□□□□ -1.27
BBS1-222	ENST00000533557	SFT2D1	Q8WV19	159 aa		7.09	□□□□□ -1.27
BBS1-222	ENST00000533557	KRTAP4-1	Q9BYQ7	146 aa		7.09	□□□□□ -1.27
BBS1-222	ENST00000533557	RNASE7	Q9H1E1	156 aa	Known RBP	7.09	□□□□□ -1.27
BBS1-222	ENST00000533557		G3V3Q6	166 aa		7.08	□□□□□ -1.28
BBS1-222	ENST00000533557	COX7A2L	O14548	114 aa		7.08	□□□□□ -1.28
BBS1-222	ENST00000533557	MAL	P21145	153 aa		7.08	□□□□□ -1.28
BBS1-222	ENST00000533557	CTRL	P40313	264 aa		7.08	□□□□□ -1.28
BBS1-222	ENST00000533557	TWIST1	Q15672	202 aa		7.08	□□□□□ -1.28
BBS1-222	ENST00000533557	RNF151	Q2KHN1	245 aa		7.08	□□□□□ -1.28
BBS1-222	ENST00000533557	MRPL52	Q86TS9	123 aa	Known RBP	7.08	□□□□□ -1.28
BBS1-222	ENST00000533557	TMEM101	Q96IK0	257 aa		7.08	□□□□□ -1.28
BBS1-222	ENST00000533557	BTF3L4	Q96K17	158 aa		7.08	□□□□□ -1.28
BBS1-222	ENST00000533557	CNFN	Q9BYD5	112 aa		7.08	□□□□□ -1.28
BBS1-222	ENST00000533557	TMEM242	Q9NWH2	141 aa		7.08	□□□□□ -1.28
BBS1-222	ENST00000533557	FXYD6-FXYD2	A0A087WZ82	144 aa		7.07	□□□□□ -1.28
BBS1-222	ENST00000533557		I3L3M4	83 aa		7.07	□□□□□ -1.28
BBS1-222	ENST00000533557	IFNA1	P01562	189 aa		7.07	□□□□□ -1.28
BBS1-222	ENST00000533557	PMCH	P20382	165 aa		7.07	□□□□□ -1.28
BBS1-222	ENST00000533557	CCL20	P78556	96 aa		7.07	□□□□□ -1.28
BBS1-222	ENST00000533557	EIF5AL1	Q6IS14	154 aa	Known RBP	7.07	□□□□□ -1.28
BBS1-222	ENST00000533557	TRBV20OR9-2	A0A075B6H5	130 aa		7.06	□□□□□ -1.28
BBS1-222	ENST00000533557	SPAG11B	Q08648	103 aa		7.06	□□□□□ -1.28
BBS1-222	ENST00000533557	UNQ6190/PRO20217	Q6UXQ8	127 aa		7.06	□□□□□ -1.28
BBS1-222	ENST00000533557	KCNRG	Q8N5I3	272 aa		7.06	□□□□□ -1.28
BBS1-222	ENST00000533557	C11orf52	Q96A22	123 aa		7.06	□□□□□ -1.28
BBS1-222	ENST00000533557	TRBV6-5	A0A0K0K1A5	114 aa		7.05	□□□□□ -1.28
BBS1-222	ENST00000533557	C1orf196	B1AJZ1	125 aa		7.05	□□□□□ -1.28
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF861P	O60384	105 aa		7.05	□□□□□ -1.28
BBS1-222	ENST00000533557	PFDN1	O60925	122 aa		7.05	□□□□□ -1.28
BBS1-222	ENST00000533557	GAGE2E	Q4V326	116 aa		7.05	□□□□□ -1.28
BBS1-222	ENST00000533557	NUDT10	Q8NFP7	164 aa		7.05	□□□□□ -1.28
BBS1-222	ENST00000533557	FAM213B	Q8TBF2	198 aa		7.05	□□□□□ -1.28
BBS1-222	ENST00000533557	NUDT11	Q96G61	164 aa		7.05	□□□□□ -1.28
BBS1-222	ENST00000533557	CDIP1	Q9H305	208 aa		7.05	□□□□□ -1.28
BBS1-222	ENST00000533557	ANAPC11	Q9NYG5	84 aa		7.05	□□□□□ -1.28
BBS1-222	ENST00000533557	MRPL35	Q9NZE8	188 aa	Known RBP	7.05	□□□□□ -1.28
BBS1-222	ENST00000533557	C6orf48	Q9UBA6	75 aa		7.05	□□□□□ -1.28
BBS1-222	ENST00000533557	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		7.05	□□□□□ -1.28
BBS1-222	ENST00000533557	TRAV13-1	A0A0B4J241	112 aa		7.04	□□□□□ -1.28
BBS1-222	ENST00000533557		M0QXV9	152 aa		7.04	□□□□□ -1.28
BBS1-222	ENST00000533557	POLR2K	P53803	58 aa	Known RBP	7.04	□□□□□ -1.28
BBS1-222	ENST00000533557	TPRXL	Q17RH7	258 aa		7.04	□□□□□ -1.28
BBS1-222	ENST00000533557	TSKU	Q8WUA8	353 aa		7.04	□□□□□ -1.28
BBS1-222	ENST00000533557	MRAP2	Q96G30	205 aa		7.04	□□□□□ -1.28
BBS1-222	ENST00000533557	GIP	P09681	153 aa	Predicted RBP	7.03	□□□□□ -1.28
BBS1-222	ENST00000533557	TLX1NB	P0CAT3	122 aa		7.03	□□□□□ -1.28
BBS1-222	ENST00000533557	UBE2B	P63146	152 aa		7.03	□□□□□ -1.28
BBS1-222	ENST00000533557	KRTAP13-2	Q52LG2	175 aa		7.03	□□□□□ -1.28
BBS1-222	ENST00000533557	C9orf129	Q5T035	196 aa	Known RBP	7.03	□□□□□ -1.28
BBS1-222	ENST00000533557	FAM104A	Q969W3	186 aa		7.03	□□□□□ -1.28
BBS1-222	ENST00000533557	TYMSOS	Q8TAI1	123 aa		7.02	□□□□□ -1.29
BBS1-222	ENST00000533557	IMMP2L	Q96T52	175 aa		7.02	□□□□□ -1.29
BBS1-222	ENST00000533557	SMDT1	Q9H4I9	107 aa		7.02	□□□□□ -1.29
BBS1-222	ENST00000533557	IGLV7-46	A0A075B6I9	117 aa		7.01	□□□□□ -1.29
BBS1-222	ENST00000533557	XKRY2	A2RUG3	117 aa		7.01	□□□□□ -1.29
BBS1-222	ENST00000533557		Q6ZUT4	128 aa		7.01	□□□□□ -1.29
BBS1-222	ENST00000533557	UBE2D4	Q9Y2X8	147 aa		7.01	□□□□□ -1.29
BBS1-222	ENST00000533557	C7orf77	A4D0Y5	90 aa		7	□□□□□ -1.29
BBS1-222	ENST00000533557	GNG4	P50150	75 aa		7	□□□□□ -1.29
BBS1-222	ENST00000533557	ORAOV1	Q8WV07	137 aa		7	□□□□□ -1.29
BBS1-222	ENST00000533557	GNG13	Q9P2W3	67 aa		7	□□□□□ -1.29
BBS1-222	ENST00000533557	IGHV3OR16-9	A0A0B4J2B5	98 aa		6.99	□□□□□ -1.29
BBS1-222	ENST00000533557	TRBV27	A0A0K0K1C4	114 aa		6.99	□□□□□ -1.29
BBS1-222	ENST00000533557		K7EN84	100 aa		6.99	□□□□□ -1.29
BBS1-222	ENST00000533557	ARPC5	O15511	151 aa		6.99	□□□□□ -1.29
BBS1-222	ENST00000533557	H2AFB1	P0C5Y9	115 aa		6.99	□□□□□ -1.29
BBS1-222	ENST00000533557	LINC01547	P58512	204 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
BBS1-222	ENST00000533557	SRSF3	P84103	164 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
BBS1-222	ENST00000533557	KIAA0087	Q14695	138 aa		6.99	□□□□□ -1.29
BBS1-222	ENST00000533557	OR10D4P	Q8NGN7	298 aa		6.99	□□□□□ -1.29
BBS1-222	ENST00000533557	ST20	Q9HBF5	79 aa		6.99	□□□□□ -1.29
BBS1-222	ENST00000533557	CSDC2	Q9Y534	153 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
BBS1-222	ENST00000533557	NDUFA1	O15239	70 aa		6.98	□□□□□ -1.29
BBS1-222	ENST00000533557	CRYGA	P11844	174 aa		6.98	□□□□□ -1.29
BBS1-222	ENST00000533557	LCE2C	Q5TA81	110 aa		6.98	□□□□□ -1.29
BBS1-222	ENST00000533557	TEX261	Q6UWH6	196 aa		6.98	□□□□□ -1.29
BBS1-222	ENST00000533557	CTDSP1	Q9GZU7	261 aa		6.98	□□□□□ -1.29
BBS1-222	ENST00000533557	SMLR1	H3BR10	107 aa		6.97	□□□□□ -1.29
BBS1-222	ENST00000533557	TMEM241	Q24JQ0	296 aa		6.97	□□□□□ -1.29
BBS1-222	ENST00000533557	SMIM12	Q96EX1	92 aa		6.97	□□□□□ -1.29
BBS1-222	ENST00000533557	UMAD1	C9J7I0	102 aa		6.96	□□□□□ -1.3
BBS1-222	ENST00000533557	SMKR1	H3BMG3	65 aa		6.96	□□□□□ -1.3
BBS1-222	ENST00000533557	C2orf82	Q6UX34	121 aa		6.96	□□□□□ -1.3

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms