RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531473.5

TSTA3-214, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSTA3, Length 2,220 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-214ENST00000531473 ODF3Q96PU9 254 aa14.81□□□□□ -0.04
TSTA3-214ENST00000531473 NXPH4O95158 308 aa14.8□□□□□ -0.04
TSTA3-214ENST00000531473 ZNF876PQ49A33 203 aa14.8□□□□□ -0.04
TSTA3-214ENST00000531473 DYNLRB2Q8TF09 96 aa14.8□□□□□ -0.04
TSTA3-214ENST00000531473 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa14.79□□□□□ -0.04
TSTA3-214ENST00000531473 SHISA2Q6UWI4 295 aa14.79□□□□□ -0.04
TSTA3-214ENST00000531473 C15orf53Q8NAA6 179 aa14.79□□□□□ -0.04
TSTA3-214ENST00000531473 LEPROTO15243 131 aa14.78□□□□□ -0.04
TSTA3-214ENST00000531473 VCYO14598 125 aa14.78□□□□□ -0.04
TSTA3-214ENST00000531473 SMIM20Q8N5G0 67 aa14.78□□□□□ -0.04
TSTA3-214ENST00000531473 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa14.77□□□□□ -0.04
TSTA3-214ENST00000531473 KNCNA6PVL3 124 aa14.77□□□□□ -0.04
TSTA3-214ENST00000531473 H3BMM0 161 aa14.77□□□□□ -0.04
TSTA3-214ENST00000531473 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
TSTA3-214ENST00000531473 EMP1P54849 157 aa14.77□□□□□ -0.04
TSTA3-214ENST00000531473 ZNRF2Q8NHG8 242 aa14.77□□□□□ -0.04
TSTA3-214ENST00000531473 UBE2WQ96B02 151 aa14.77□□□□□ -0.04
TSTA3-214ENST00000531473 A0A0J9YX75 114 aa14.77□□□□□ -0.05
TSTA3-214ENST00000531473 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
TSTA3-214ENST00000531473 MDFICQ9P1T7 246 aa14.77□□□□□ -0.05
TSTA3-214ENST00000531473 DEFB131AP59861 70 aa14.76□□□□□ -0.05
TSTA3-214ENST00000531473 TRAV2A0A0B4J234 112 aa14.74□□□□□ -0.05
TSTA3-214ENST00000531473 MUSTN1Q8IVN3 82 aa14.74□□□□□ -0.05
TSTA3-214ENST00000531473 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
TSTA3-214ENST00000531473 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa14.74□□□□□ -0.05
TSTA3-214ENST00000531473 STAB1Q9NY15 2570 aa14.74□□□□□ -0.05
TSTA3-214ENST00000531473 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa14.74□□□□□ -0.05
TSTA3-214ENST00000531473 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa14.74□□□□□ -0.05
TSTA3-214ENST00000531473 Q1RN00 199 aa14.74□□□□□ -0.05
TSTA3-214ENST00000531473 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa14.73□□□□□ -0.05
TSTA3-214ENST00000531473 TMEM223A0PJW6 202 aa14.73□□□□□ -0.05
TSTA3-214ENST00000531473 SDHAF1A6NFY7 115 aa14.73□□□□□ -0.05
TSTA3-214ENST00000531473 LINC00315P59091 139 aa14.73□□□□□ -0.05
TSTA3-214ENST00000531473 TMEM126AQ9H061 195 aa14.73□□□□□ -0.05
TSTA3-214ENST00000531473 H3BT86 120 aa14.72□□□□□ -0.05
TSTA3-214ENST00000531473 M0R2P5 195 aa14.72□□□□□ -0.05
TSTA3-214ENST00000531473 JPT2Q9H910 190 aa14.72□□□□□ -0.05
TSTA3-214ENST00000531473 MUC4Q99102 2169 aa14.72□□□□□ -0.05
TSTA3-214ENST00000531473 H7C2G1 150 aa14.72□□□□□ -0.05
TSTA3-214ENST00000531473 MEIG1Q5JSS6 88 aa14.72□□□□□ -0.05
TSTA3-214ENST00000531473 RPL39P62891 51 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
TSTA3-214ENST00000531473 SPINK13Q1W4C9 94 aa14.71□□□□□ -0.05
TSTA3-214ENST00000531473 MAP6D1Q9H9H5 199 aa14.71□□□□□ -0.05
TSTA3-214ENST00000531473 A0A087WWL8 130 aa14.7□□□□□ -0.06
TSTA3-214ENST00000531473 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa14.7□□□□□ -0.06
TSTA3-214ENST00000531473 SUMO4Q6EEV6 95 aa14.7□□□□□ -0.06
TSTA3-214ENST00000531473 C2orf82Q6UX34 121 aa14.7□□□□□ -0.06
TSTA3-214ENST00000531473 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa14.7□□□□□ -0.06
TSTA3-214ENST00000531473 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
TSTA3-214ENST00000531473 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
TSTA3-214ENST00000531473 F5H697 171 aa14.7□□□□□ -0.06
TSTA3-214ENST00000531473 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
TSTA3-214ENST00000531473 DEFB121Q5J5C9 76 aa14.7□□□□□ -0.06
TSTA3-214ENST00000531473 C9orf85Q96MD7 179 aa14.7□□□□□ -0.06
TSTA3-214ENST00000531473 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa14.69□□□□□ -0.06
TSTA3-214ENST00000531473 ODF3L2Q3SX64 289 aa14.69□□□□□ -0.06
TSTA3-214ENST00000531473 WFDC10AQ9H1F0 79 aa14.69□□□□□ -0.06
TSTA3-214ENST00000531473 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa14.69□□□□□ -0.06
TSTA3-214ENST00000531473 PF4P02776 101 aa14.69□□□□□ -0.06
TSTA3-214ENST00000531473 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa14.69□□□□□ -0.06
TSTA3-214ENST00000531473 SPANXDQ9BXN6 97 aa14.69□□□□□ -0.06
TSTA3-214ENST00000531473 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa14.68□□□□□ -0.06
TSTA3-214ENST00000531473 TRIAP1O43715 76 aa14.68□□□□□ -0.06
TSTA3-214ENST00000531473 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa14.68□□□□□ -0.06
TSTA3-214ENST00000531473 LINC00482Q8N8I6 264 aa14.68□□□□□ -0.06
TSTA3-214ENST00000531473 COX6CP09669 75 aa14.67□□□□□ -0.06
TSTA3-214ENST00000531473 RHOHQ15669 191 aa14.67□□□□□ -0.06
TSTA3-214ENST00000531473 FAM74A4Q5TZK3 123 aa14.67□□□□□ -0.06
TSTA3-214ENST00000531473 PRIMA1Q86XR5 153 aa14.67□□□□□ -0.06
TSTA3-214ENST00000531473 H7C423 109 aa14.66□□□□□ -0.06
TSTA3-214ENST00000531473 PRM2P04554 102 aa14.66□□□□□ -0.06
TSTA3-214ENST00000531473 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TSTA3-214ENST00000531473 RBMY1CP0DJD4 496 aa14.65□□□□□ -0.06
TSTA3-214ENST00000531473 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TSTA3-214ENST00000531473 IGLV1-51P01701 117 aa14.65□□□□□ -0.06
TSTA3-214ENST00000531473 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
TSTA3-214ENST00000531473 ICOSQ9Y6W8 199 aa14.65□□□□□ -0.06
TSTA3-214ENST00000531473 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa14.64□□□□□ -0.07
TSTA3-214ENST00000531473 A0A0J9YXY3 114 aa14.64□□□□□ -0.07
TSTA3-214ENST00000531473 COL6A5A8TX70 2615 aa14.64□□□□□ -0.07
TSTA3-214ENST00000531473 CMYA5Q8N3K9 4069 aa14.64□□□□□ -0.07
TSTA3-214ENST00000531473 ZNF56Q15929 161 aa14.64□□□□□ -0.07
TSTA3-214ENST00000531473 IMUPQ9GZP8 106 aa14.63□□□□□ -0.07
TSTA3-214ENST00000531473 TRGV11A0A075B6L2 103 aa14.62□□□□□ -0.07
TSTA3-214ENST00000531473 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa14.61□□□□□ -0.07
TSTA3-214ENST00000531473 TMEM101Q96IK0 257 aa14.61□□□□□ -0.07
TSTA3-214ENST00000531473 SPANXCQ9NY87 97 aa14.61□□□□□ -0.07
TSTA3-214ENST00000531473 ACYP1P07311 99 aa14.61□□□□□ -0.07
TSTA3-214ENST00000531473 TRAV25A0A0B4J276 109 aa14.6□□□□□ -0.07
TSTA3-214ENST00000531473 LINC01587Q99440 93 aa14.6□□□□□ -0.07
TSTA3-214ENST00000531473 LITAFQ99732 161 aa14.6□□□□□ -0.07
TSTA3-214ENST00000531473 M0QY20 66 aa14.59□□□□□ -0.07
TSTA3-214ENST00000531473 LST1O00453 97 aa14.59□□□□□ -0.07
TSTA3-214ENST00000531473 CHCHD5Q9BSY4 110 aa14.59□□□□□ -0.07
TSTA3-214ENST00000531473 HTN1P15515 57 aa14.58□□□□□ -0.08
TSTA3-214ENST00000531473 C19orf73Q9NVV2 129 aa14.58□□□□□ -0.08
TSTA3-214ENST00000531473 C20orf203Q8NBC4 194 aa14.57□□□□□ -0.08
TSTA3-214ENST00000531473 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa14.56□□□□□ -0.08
TSTA3-214ENST00000531473 A8MTW9 85 aa14.56□□□□□ -0.08
TSTA3-214ENST00000531473 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.3 ms