RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530565.5

CTSF-208, Transcript of cathepsin F, humanhuman

TSL 5

Gene CTSF, Length 555 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSF-208ENST00000530565 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa5.83□□□□□ -1.48
CTSF-208ENST00000530565 ATP5LO75964 103 aa5.83□□□□□ -1.48
CTSF-208ENST00000530565 DNAH10OSP0CZ25 163 aa5.83□□□□□ -1.48
CTSF-208ENST00000530565 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
CTSF-208ENST00000530565 Q6ZR54 194 aa5.83□□□□□ -1.48
CTSF-208ENST00000530565 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa5.83□□□□□ -1.48
CTSF-208ENST00000530565 SPATA12Q7Z6I5 190 aa5.83□□□□□ -1.48
CTSF-208ENST00000530565 TOMM6Q96B49 74 aa5.83□□□□□ -1.48
CTSF-208ENST00000530565 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa5.83□□□□□ -1.48
CTSF-208ENST00000530565 TSHBP01222 138 aa5.82□□□□□ -1.48
CTSF-208ENST00000530565 NPSP0C0P6 89 aa5.82□□□□□ -1.48
CTSF-208ENST00000530565 BTF3P20290 206 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
CTSF-208ENST00000530565 SMAGPQ0VAQ4 97 aa5.82□□□□□ -1.48
CTSF-208ENST00000530565 COTL1Q14019 142 aa5.82□□□□□ -1.48
CTSF-208ENST00000530565 PMCHL1Q16048 86 aa5.82□□□□□ -1.48
CTSF-208ENST00000530565 TTC32Q5I0X7 151 aa5.82□□□□□ -1.48
CTSF-208ENST00000530565 LINC01556Q5JQF7 62 aa5.82□□□□□ -1.48
CTSF-208ENST00000530565 PET117Q6UWS5 81 aa5.82□□□□□ -1.48
CTSF-208ENST00000530565 ERASQ7Z444 233 aa5.82□□□□□ -1.48
CTSF-208ENST00000530565 C20orf203Q8NBC4 194 aa5.82□□□□□ -1.48
CTSF-208ENST00000530565 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa5.82□□□□□ -1.48
CTSF-208ENST00000530565 CYSLTR1Q9Y271 337 aa5.82□□□□□ -1.48
CTSF-208ENST00000530565 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa5.81□□□□□ -1.48
CTSF-208ENST00000530565 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa5.81□□□□□ -1.48
CTSF-208ENST00000530565 H7C423 109 aa5.81□□□□□ -1.48
CTSF-208ENST00000530565 C3orf79P0CE67 100 aa5.81□□□□□ -1.48
CTSF-208ENST00000530565 SMIM6P0DI80 62 aa5.81□□□□□ -1.48
CTSF-208ENST00000530565 C2orf66Q6UXQ4 117 aa5.81□□□□□ -1.48
CTSF-208ENST00000530565 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa5.81□□□□□ -1.48
CTSF-208ENST00000530565 TMEM141Q96I45 108 aa5.81□□□□□ -1.48
CTSF-208ENST00000530565 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa5.81□□□□□ -1.48
CTSF-208ENST00000530565 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
CTSF-208ENST00000530565 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa5.8□□□□□ -1.48
CTSF-208ENST00000530565 K7EP13 123 aa5.8□□□□□ -1.48
CTSF-208ENST00000530565 IGHV3-30P01768 117 aa5.8□□□□□ -1.48
CTSF-208ENST00000530565 IGHV3-33P01772 117 aa5.8□□□□□ -1.48
CTSF-208ENST00000530565 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa5.8□□□□□ -1.48
CTSF-208ENST00000530565 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa5.8□□□□□ -1.48
CTSF-208ENST00000530565 KRTDAPP60985 99 aa5.8□□□□□ -1.48
CTSF-208ENST00000530565 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa5.8□□□□□ -1.48
CTSF-208ENST00000530565 Q8N3U1 123 aa5.8□□□□□ -1.48
CTSF-208ENST00000530565 C10orf126Q8N4M7 172 aa5.8□□□□□ -1.48
CTSF-208ENST00000530565 IFI27L1Q96BM0 104 aa5.8□□□□□ -1.48
CTSF-208ENST00000530565 SCGB3A1Q96QR1 104 aa5.8□□□□□ -1.48
CTSF-208ENST00000530565 TIMM17AQ99595 171 aa5.8□□□□□ -1.48
CTSF-208ENST00000530565 CHCHD5Q9BSY4 110 aa5.8□□□□□ -1.48
CTSF-208ENST00000530565 A0A087WX48 190 aa5.79□□□□□ -1.48
CTSF-208ENST00000530565 C20orf202A1L168 122 aa5.79□□□□□ -1.48
CTSF-208ENST00000530565 IGIPA6NJ69 53 aa5.79□□□□□ -1.48
CTSF-208ENST00000530565 TMEM262E9PQX1 116 aa5.79□□□□□ -1.48
CTSF-208ENST00000530565 SCGB1D1O95968 90 aa5.79□□□□□ -1.48
CTSF-208ENST00000530565 PKIAP61925 76 aa5.79□□□□□ -1.48
CTSF-208ENST00000530565 PYY3Q5JQD4 70 aa5.79□□□□□ -1.48
CTSF-208ENST00000530565 C1orf134Q5TEV5 83 aa5.79□□□□□ -1.48
CTSF-208ENST00000530565 C6orf223Q8N319 242 aa5.79□□□□□ -1.48
CTSF-208ENST00000530565 TMEM243Q9BU79 118 aa5.79□□□□□ -1.48
CTSF-208ENST00000530565 CHCHD7Q9BUK0 85 aa5.79□□□□□ -1.48
CTSF-208ENST00000530565 TIMM21Q9BVV7 248 aa5.79□□□□□ -1.48
CTSF-208ENST00000530565 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
CTSF-208ENST00000530565 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa5.78□□□□□ -1.48
CTSF-208ENST00000530565 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa5.78□□□□□ -1.48
CTSF-208ENST00000530565 PRSS1P07477 247 aa5.78□□□□□ -1.48
CTSF-208ENST00000530565 GAGE6Q13070 117 aa5.78□□□□□ -1.48
CTSF-208ENST00000530565 MPV17L2Q567V2 206 aa5.78□□□□□ -1.48
CTSF-208ENST00000530565 Q6ZN92 141 aa5.78□□□□□ -1.48
CTSF-208ENST00000530565 LINC00173Q6ZV60 143 aa5.78□□□□□ -1.48
CTSF-208ENST00000530565 LINC00518Q8N0U6 118 aa5.78□□□□□ -1.48
CTSF-208ENST00000530565 SPANXA1Q9NS26 97 aa5.78□□□□□ -1.48
CTSF-208ENST00000530565 UBE2L6O14933 153 aa5.77□□□□□ -1.49
CTSF-208ENST00000530565 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
CTSF-208ENST00000530565 LINC01545Q5VT33 79 aa5.77□□□□□ -1.49
CTSF-208ENST00000530565 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
CTSF-208ENST00000530565 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa5.77□□□□□ -1.49
CTSF-208ENST00000530565 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
CTSF-208ENST00000530565 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
CTSF-208ENST00000530565 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
CTSF-208ENST00000530565 RBX1P62877 108 aa5.76□□□□□ -1.49
CTSF-208ENST00000530565 RPL39P62891 51 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
CTSF-208ENST00000530565 S100A12P80511 92 aa5.76□□□□□ -1.49
CTSF-208ENST00000530565 PMVKQ15126 192 aa5.76□□□□□ -1.49
CTSF-208ENST00000530565 NFE4Q86UQ8 179 aa5.76□□□□□ -1.49
CTSF-208ENST00000530565 Q8N976 141 aa5.76□□□□□ -1.49
CTSF-208ENST00000530565 KLK12Q9UKR0 248 aa5.76□□□□□ -1.49
CTSF-208ENST00000530565 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa5.76□□□□□ -1.49
CTSF-208ENST00000530565 FAT1Q14517 4588 aa5.75□□□□□ -1.49
CTSF-208ENST00000530565 A0A1B0GUV1 79 aa5.75□□□□□ -1.49
CTSF-208ENST00000530565 CDK2AP2O75956 126 aa5.75□□□□□ -1.49
CTSF-208ENST00000530565 ANGP03950 147 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
CTSF-208ENST00000530565 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa5.75□□□□□ -1.49
CTSF-208ENST00000530565 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
CTSF-208ENST00000530565 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa5.75□□□□□ -1.49
CTSF-208ENST00000530565 BAALCQ8WXS3 180 aa5.75□□□□□ -1.49
CTSF-208ENST00000530565 C12orf57Q99622 126 aa5.75□□□□□ -1.49
CTSF-208ENST00000530565 VCX2Q9H322 139 aa5.75□□□□□ -1.49
CTSF-208ENST00000530565 CST9LQ9H4G1 147 aa5.75□□□□□ -1.49
CTSF-208ENST00000530565 Q9HAA7 133 aa5.75□□□□□ -1.49
CTSF-208ENST00000530565 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa5.74□□□□□ -1.49
CTSF-208ENST00000530565 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa5.74□□□□□ -1.49
CTSF-208ENST00000530565 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa5.74□□□□□ -1.49
CTSF-208ENST00000530565 FGF6P10767 208 aa5.74□□□□□ -1.49
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