RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512427.5

HOXC-AS1-202, HOXC cluster antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene HOXC-AS1, Length 290 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS1-202ENST00000512427 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
HOXC-AS1-202ENST00000512427 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
HOXC-AS1-202ENST00000512427 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CAMK2N2Q96S95 79 aa5.66□□□□□ -1.5
HOXC-AS1-202ENST00000512427 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa5.65□□□□□ -1.5
HOXC-AS1-202ENST00000512427 A0A1W2PNN7 141 aa5.65□□□□□ -1.5
HOXC-AS1-202ENST00000512427 RAB19A4D1S5 217 aa5.65□□□□□ -1.5
HOXC-AS1-202ENST00000512427 C1orf196B1AJZ1 125 aa5.65□□□□□ -1.5
HOXC-AS1-202ENST00000512427 BCL2P10415 239 aa5.65□□□□□ -1.5
HOXC-AS1-202ENST00000512427 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
HOXC-AS1-202ENST00000512427 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PRR26Q8N8Z3 221 aa5.65□□□□□ -1.5
HOXC-AS1-202ENST00000512427 NUP35Q8NFH5 326 aa5.65□□□□□ -1.5
HOXC-AS1-202ENST00000512427 C2orf48Q96LS8 159 aa5.65□□□□□ -1.5
HOXC-AS1-202ENST00000512427 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa5.64□□□□□ -1.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa5.64□□□□□ -1.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 G3V3Q6 166 aa5.64□□□□□ -1.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ESDP10768 282 aa5.64□□□□□ -1.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 UBE2D1P51668 147 aa5.64□□□□□ -1.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PRR4Q16378 134 aa5.64□□□□□ -1.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 NUDT10Q8NFP7 164 aa5.64□□□□□ -1.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 NUDT11Q96G61 164 aa5.64□□□□□ -1.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ST20Q9HBF5 79 aa5.64□□□□□ -1.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa5.64□□□□□ -1.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 MED9Q9NWA0 146 aa5.64□□□□□ -1.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 LPAP08519 4548 aa5.64□□□□□ -1.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 C7orf77A4D0Y5 90 aa5.63□□□□□ -1.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 H0Y9J4 135 aa5.63□□□□□ -1.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 BCL2L11O43521 198 aa5.63□□□□□ -1.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 IGLV7-43P04211 117 aa5.63□□□□□ -1.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 RNF151Q2KHN1 245 aa5.63□□□□□ -1.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 BORCS7Q96B45 105 aa5.63□□□□□ -1.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa5.63□□□□□ -1.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa5.62□□□□□ -1.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 A0A087WZ39 114 aa5.62□□□□□ -1.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 HMSDA8MTL9 139 aa5.62□□□□□ -1.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 F8WDY8 70 aa5.62□□□□□ -1.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TSHBP01222 138 aa5.62□□□□□ -1.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 IMMP2LQ96T52 175 aa5.62□□□□□ -1.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TMEM242Q9NWH2 141 aa5.62□□□□□ -1.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 A8MWL6 223 aa5.61□□□□□ -1.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 FCER1GP30273 86 aa5.61□□□□□ -1.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SPAG11BQ08648 103 aa5.61□□□□□ -1.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 OR10D4PQ8NGN7 298 aa5.61□□□□□ -1.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa5.6□□□□□ -1.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TMEM18Q96B42 140 aa5.6□□□□□ -1.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa5.59□□□□□ -1.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SMLR1H3BR10 107 aa5.59□□□□□ -1.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 NDUFA1O15239 70 aa5.59□□□□□ -1.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 GATCO43716 136 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PPP1R17O96001 155 aa5.59□□□□□ -1.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 C5orf38Q86SI9 138 aa5.59□□□□□ -1.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 KIR2DL4Q99706 377 aa5.59□□□□□ -1.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
HOXC-AS1-202ENST00000512427 VCYO14598 125 aa5.58□□□□□ -1.52
HOXC-AS1-202ENST00000512427 UBE2BP63146 152 aa5.58□□□□□ -1.52
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TMEM241Q24JQ0 296 aa5.58□□□□□ -1.52
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
HOXC-AS1-202ENST00000512427 K7EN84 100 aa5.57□□□□□ -1.52
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TLX1NBP0CAT3 122 aa5.57□□□□□ -1.52
HOXC-AS1-202ENST00000512427 RGS21Q2M5E4 152 aa5.57□□□□□ -1.52
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CT83Q5H943 113 aa5.57□□□□□ -1.52
HOXC-AS1-202ENST00000512427 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
HOXC-AS1-202ENST00000512427 OCC1Q8TAD7 63 aa5.57□□□□□ -1.52
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ORAOV1Q8WV07 137 aa5.57□□□□□ -1.52
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TIMM21Q9BVV7 248 aa5.57□□□□□ -1.52
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TMEM191AQ9H0A3 160 aa5.57□□□□□ -1.52
HOXC-AS1-202ENST00000512427 BATF3Q9NR55 127 aa5.57□□□□□ -1.52
HOXC-AS1-202ENST00000512427 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa5.57□□□□□ -1.52
HOXC-AS1-202ENST00000512427 A0A1B0GUT8 65 aa5.56□□□□□ -1.52
HOXC-AS1-202ENST00000512427 M0QXV9 152 aa5.56□□□□□ -1.52
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PPP1R2P9O14990 202 aa5.56□□□□□ -1.52
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TCAPO15273 167 aa5.56□□□□□ -1.52
HOXC-AS1-202ENST00000512427 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa5.56□□□□□ -1.52
HOXC-AS1-202ENST00000512427 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
HOXC-AS1-202ENST00000512427 FAM231DQ6ZW35 169 aa5.56□□□□□ -1.52
HOXC-AS1-202ENST00000512427 RAB4AP20338 218 aa5.55□□□□□ -1.52
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
HOXC-AS1-202ENST00000512427 Q6ZUT4 128 aa5.55□□□□□ -1.52
HOXC-AS1-202ENST00000512427 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa5.54□□□□□ -1.52
HOXC-AS1-202ENST00000512427 FAM168BA1KXE4 195 aa5.54□□□□□ -1.52
HOXC-AS1-202ENST00000512427 HIGD1CA8MV81 97 aa5.54□□□□□ -1.52
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TMEM250H0YL14 139 aa5.54□□□□□ -1.52
HOXC-AS1-202ENST00000512427 GAGE2EQ4V326 116 aa5.54□□□□□ -1.52
HOXC-AS1-202ENST00000512427 AMN1Q8IY45 258 aa5.54□□□□□ -1.52
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SMDT1Q9H4I9 107 aa5.54□□□□□ -1.52
HOXC-AS1-202ENST00000512427 GAGE2DQ9UEU5 116 aa5.54□□□□□ -1.52
HOXC-AS1-202ENST00000512427 MUC2Q02817 5179 aa5.54□□□□□ -1.52
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa5.53□□□□□ -1.52
HOXC-AS1-202ENST00000512427 RIGQ13278 110 aa5.53□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.6 ms