RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511313.5

POLR2J3-215, Transcript of RNA polymerase II subunit J3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene POLR2J3, Length 4,630 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J3-215ENST00000511313 FRYLO94915 3013 aa6.86□□□□□ -1.31
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POLR2J3-215ENST00000511313 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
POLR2J3-215ENST00000511313 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa6.85□□□□□ -1.31
POLR2J3-215ENST00000511313 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa6.85□□□□□ -1.31
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POLR2J3-215ENST00000511313 VPS13AQ96RL7 3174 aa6.85□□□□□ -1.31
POLR2J3-215ENST00000511313 A4D1N5 150 aa6.85□□□□□ -1.31
POLR2J3-215ENST00000511313 TSPAN13O95857 204 aa6.85□□□□□ -1.31
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POLR2J3-215ENST00000511313 CFAP54Q96N23 3096 aa6.84□□□□□ -1.31
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POLR2J3-215ENST00000511313 SCRT2Q9NQ03 307 aa6.84□□□□□ -1.31
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POLR2J3-215ENST00000511313 TAL2Q16559 108 aa6.83□□□□□ -1.32
POLR2J3-215ENST00000511313 GATD1Q8NB37 220 aa6.83□□□□□ -1.32
POLR2J3-215ENST00000511313 TOMM6Q96B49 74 aa6.82□□□□□ -1.32
POLR2J3-215ENST00000511313 APLNQ9ULZ1 77 aa6.82□□□□□ -1.32
POLR2J3-215ENST00000511313 RNF151Q2KHN1 245 aa6.82□□□□□ -1.32
POLR2J3-215ENST00000511313 A0A087WZ39 114 aa6.82□□□□□ -1.32
POLR2J3-215ENST00000511313 FAM19A4Q96LR4 140 aa6.82□□□□□ -1.32
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POLR2J3-215ENST00000511313 SMKR1H3BMG3 65 aa6.81□□□□□ -1.32
POLR2J3-215ENST00000511313 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
POLR2J3-215ENST00000511313 C11orf72Q8NBR9 251 aa6.81□□□□□ -1.32
POLR2J3-215ENST00000511313 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
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POLR2J3-215ENST00000511313 USP17L23D6RBM5 183 aa6.8□□□□□ -1.32
POLR2J3-215ENST00000511313 ADCYAP1P18509 176 aa6.8□□□□□ -1.32
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POLR2J3-215ENST00000511313 SNHG12Q9BXW3 62 aa6.8□□□□□ -1.32
POLR2J3-215ENST00000511313 GAGE2DQ9UEU5 116 aa6.8□□□□□ -1.32
POLR2J3-215ENST00000511313 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa6.8□□□□□ -1.32
POLR2J3-215ENST00000511313 TNCP24821 2201 aa6.8□□□□□ -1.32
POLR2J3-215ENST00000511313 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa6.8□□□□□ -1.32
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POLR2J3-215ENST00000511313 C10orf91Q5T1B1 145 aa6.79□□□□□ -1.32
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POLR2J3-215ENST00000511313 IGLV2-11P01706 119 aa6.78□□□□□ -1.32
POLR2J3-215ENST00000511313 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa6.78□□□□□ -1.32
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POLR2J3-215ENST00000511313 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa6.74□□□□□ -1.33
POLR2J3-215ENST00000511313 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa6.74□□□□□ -1.33
POLR2J3-215ENST00000511313 Q6ZRP5 223 aa6.74□□□□□ -1.33
POLR2J3-215ENST00000511313 SMIM6P0DI80 62 aa6.73□□□□□ -1.33
POLR2J3-215ENST00000511313 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa6.73□□□□□ -1.33
POLR2J3-215ENST00000511313 SS18L2Q9UHA2 77 aa6.73□□□□□ -1.33
POLR2J3-215ENST00000511313 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa6.73□□□□□ -1.33
POLR2J3-215ENST00000511313 WFDC10BQ8IUB3 73 aa6.73□□□□□ -1.33
POLR2J3-215ENST00000511313 CYSRT1A8MQ03 144 aa6.73□□□□□ -1.33
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