RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497210.5

CTPS1-211, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 463 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-211ENST00000497210 H7C423 109 aa6.71□□□□□ -1.34
CTPS1-211ENST00000497210 SERF1AO75920 110 aa6.71□□□□□ -1.34
CTPS1-211ENST00000497210 HBDP02042 147 aa6.71□□□□□ -1.34
CTPS1-211ENST00000497210 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
CTPS1-211ENST00000497210 ZFAND6Q6FIF0 208 aa6.71□□□□□ -1.34
CTPS1-211ENST00000497210 NIT1Q86X76 327 aa6.71□□□□□ -1.34
CTPS1-211ENST00000497210 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa6.71□□□□□ -1.34
CTPS1-211ENST00000497210 Q9UF83 564 aa6.71□□□□□ -1.34
CTPS1-211ENST00000497210 CYSLTR1Q9Y271 337 aa6.71□□□□□ -1.34
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CTPS1-211ENST00000497210 NDUFA6P56556 154 aa6.7□□□□□ -1.34
CTPS1-211ENST00000497210 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.7□□□□□ -1.34
CTPS1-211ENST00000497210 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa6.7□□□□□ -1.34
CTPS1-211ENST00000497210 CHCHD5Q9BSY4 110 aa6.7□□□□□ -1.34
CTPS1-211ENST00000497210 CHCHD7Q9BUK0 85 aa6.7□□□□□ -1.34
CTPS1-211ENST00000497210 S100A2P29034 98 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-211ENST00000497210 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-211ENST00000497210 LYPD5Q6UWN5 251 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-211ENST00000497210 C20orf203Q8NBC4 194 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-211ENST00000497210 TMEM101Q96IK0 257 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-211ENST00000497210 SPANXA1Q9NS26 97 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-211ENST00000497210 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-211ENST00000497210 TGP01266 2768 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-211ENST00000497210 A0A087WX48 190 aa6.68□□□□□ -1.34
CTPS1-211ENST00000497210 ESDP10768 282 aa6.68□□□□□ -1.34
CTPS1-211ENST00000497210 C2orf66Q6UXQ4 117 aa6.68□□□□□ -1.34
CTPS1-211ENST00000497210 Q6ZN92 141 aa6.68□□□□□ -1.34
CTPS1-211ENST00000497210 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CTPS1-211ENST00000497210 UPK3BQ9BT76 320 aa6.68□□□□□ -1.34
CTPS1-211ENST00000497210 TM2D2Q9BX73 214 aa6.68□□□□□ -1.34
CTPS1-211ENST00000497210 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa6.68□□□□□ -1.34
CTPS1-211ENST00000497210 HSPB8Q9UJY1 196 aa6.68□□□□□ -1.34
CTPS1-211ENST00000497210 APLNQ9ULZ1 77 aa6.68□□□□□ -1.34
CTPS1-211ENST00000497210 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-211ENST00000497210 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-211ENST00000497210 TMEM262E9PQX1 116 aa6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-211ENST00000497210 ATP5LO75964 103 aa6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-211ENST00000497210 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-211ENST00000497210 TOMM6Q96B49 74 aa6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-211ENST00000497210 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-211ENST00000497210 TIMM21Q9BVV7 248 aa6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-211ENST00000497210 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-211ENST00000497210 STARD9Q9P2P6 4700 aa6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-211ENST00000497210 CSMD3Q7Z407 3707 aa6.66□□□□□ -1.34
CTPS1-211ENST00000497210 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
CTPS1-211ENST00000497210 LEPROTL1O95214 131 aa6.66□□□□□ -1.34
CTPS1-211ENST00000497210 FGF6P10767 208 aa6.66□□□□□ -1.34
CTPS1-211ENST00000497210 ESRGQ1W209 222 aa6.66□□□□□ -1.34
CTPS1-211ENST00000497210 CASC10Q5T4H9 136 aa6.66□□□□□ -1.34
CTPS1-211ENST00000497210 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
CTPS1-211ENST00000497210 OR5A1Q8NGJ0 315 aa6.66□□□□□ -1.34
CTPS1-211ENST00000497210 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa6.66□□□□□ -1.34
CTPS1-211ENST00000497210 TMEM141Q96I45 108 aa6.66□□□□□ -1.34
CTPS1-211ENST00000497210 TIMM17AQ99595 171 aa6.66□□□□□ -1.34
CTPS1-211ENST00000497210 COX11Q9Y6N1 276 aa6.66□□□□□ -1.34
CTPS1-211ENST00000497210 K7EP13 123 aa6.65□□□□□ -1.34
CTPS1-211ENST00000497210 SIVA1O15304 175 aa6.65□□□□□ -1.34
CTPS1-211ENST00000497210 GAGE6Q13070 117 aa6.65□□□□□ -1.34
CTPS1-211ENST00000497210 PMCHL1Q16048 86 aa6.65□□□□□ -1.34
CTPS1-211ENST00000497210 ERASQ7Z444 233 aa6.65□□□□□ -1.34
CTPS1-211ENST00000497210 C10orf126Q8N4M7 172 aa6.65□□□□□ -1.34
CTPS1-211ENST00000497210 SCGB3A1Q96QR1 104 aa6.65□□□□□ -1.34
CTPS1-211ENST00000497210 C2orf88Q9BSF0 95 aa6.65□□□□□ -1.34
CTPS1-211ENST00000497210 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa6.65□□□□□ -1.34
CTPS1-211ENST00000497210 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa6.65□□□□□ -1.34
CTPS1-211ENST00000497210 LINC00588Q9Y4M8 146 aa6.65□□□□□ -1.34
CTPS1-211ENST00000497210 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CTPS1-211ENST00000497210 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa6.64□□□□□ -1.35
CTPS1-211ENST00000497210 A0A1B0GUV1 79 aa6.64□□□□□ -1.35
CTPS1-211ENST00000497210 CRPP02741 224 aa6.64□□□□□ -1.35
CTPS1-211ENST00000497210 RPL39P62891 51 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CTPS1-211ENST00000497210 MPV17L2Q567V2 206 aa6.64□□□□□ -1.35
CTPS1-211ENST00000497210 PDZD11Q5EBL8 140 aa6.64□□□□□ -1.35
CTPS1-211ENST00000497210 TTC32Q5I0X7 151 aa6.64□□□□□ -1.35
CTPS1-211ENST00000497210 LINC01556Q5JQF7 62 aa6.64□□□□□ -1.35
CTPS1-211ENST00000497210 WFDC10BQ8IUB3 73 aa6.64□□□□□ -1.35
CTPS1-211ENST00000497210 FAM19A2Q8N3H0 131 aa6.64□□□□□ -1.35
CTPS1-211ENST00000497210 A0A096LNJ9 63 aa6.63□□□□□ -1.35
CTPS1-211ENST00000497210 DNAH10OSP0CZ25 163 aa6.63□□□□□ -1.35
CTPS1-211ENST00000497210 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CTPS1-211ENST00000497210 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CTPS1-211ENST00000497210 LGALS9CQ6DKI2 356 aa6.63□□□□□ -1.35
CTPS1-211ENST00000497210 TEX43Q6ZNM6 134 aa6.63□□□□□ -1.35
CTPS1-211ENST00000497210 HIST3H2BBQ8N257 126 aa6.63□□□□□ -1.35
CTPS1-211ENST00000497210 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa6.63□□□□□ -1.35
CTPS1-211ENST00000497210 C5orf52A6NGY3 159 aa6.62□□□□□ -1.35
CTPS1-211ENST00000497210 ANGP03950 147 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
CTPS1-211ENST00000497210 RBX1P62877 108 aa6.62□□□□□ -1.35
CTPS1-211ENST00000497210 Q6ZUT4 128 aa6.62□□□□□ -1.35
CTPS1-211ENST00000497210 IFI27L1Q96BM0 104 aa6.62□□□□□ -1.35
CTPS1-211ENST00000497210 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
CTPS1-211ENST00000497210 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa6.61□□□□□ -1.35
CTPS1-211ENST00000497210 C20orf202A1L168 122 aa6.61□□□□□ -1.35
CTPS1-211ENST00000497210 IGIPA6NJ69 53 aa6.61□□□□□ -1.35
CTPS1-211ENST00000497210 IFITM10A6NMD0 228 aa6.61□□□□□ -1.35
CTPS1-211ENST00000497210 NUPR1O60356 82 aa6.61□□□□□ -1.35
CTPS1-211ENST00000497210 IGHV3-30P01768 117 aa6.61□□□□□ -1.35
CTPS1-211ENST00000497210 IGHV3-33P01772 117 aa6.61□□□□□ -1.35
CTPS1-211ENST00000497210 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa6.61□□□□□ -1.35
CTPS1-211ENST00000497210 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa6.61□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.1 ms