RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486964.5

POLR1A-208, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 5

Gene POLR1A, Length 1,427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-208ENST00000486964 FAM231AP0DMU4 169 aa6.98□□□□□ -1.29
POLR1A-208ENST00000486964 FAM231CP0DMU5 169 aa6.98□□□□□ -1.29
POLR1A-208ENST00000486964 INSL3P51460 131 aa6.98□□□□□ -1.29
POLR1A-208ENST00000486964 SH2D6Q7Z4S9 175 aa6.98□□□□□ -1.29
POLR1A-208ENST00000486964 SBSPONQ8IVN8 264 aa6.98□□□□□ -1.29
POLR1A-208ENST00000486964 ZNRF2Q8NHG8 242 aa6.98□□□□□ -1.29
POLR1A-208ENST00000486964 GTSF1LQ9H1H1 148 aa6.98□□□□□ -1.29
POLR1A-208ENST00000486964 SPANXA1Q9NS26 97 aa6.98□□□□□ -1.29
POLR1A-208ENST00000486964 TMEM262E9PQX1 116 aa6.97□□□□□ -1.29
POLR1A-208ENST00000486964 RHODO00212 210 aa6.97□□□□□ -1.29
POLR1A-208ENST00000486964 WIPF1O43516 503 aa6.97□□□□□ -1.29
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF415Q09FC8 603 aa6.97□□□□□ -1.29
POLR1A-208ENST00000486964 AMELXQ99217 191 aa6.97□□□□□ -1.29
POLR1A-208ENST00000486964 JPT2Q9H910 190 aa6.97□□□□□ -1.29
POLR1A-208ENST00000486964 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa6.96□□□□□ -1.3
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POLR1A-208ENST00000486964 CFC1P0CG37 223 aa6.96□□□□□ -1.3
POLR1A-208ENST00000486964 SCGB1C2P0DMR2 95 aa6.96□□□□□ -1.3
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
POLR1A-208ENST00000486964 TSPEAR-AS2P59090 65 aa6.96□□□□□ -1.3
POLR1A-208ENST00000486964 SMAGPQ0VAQ4 97 aa6.96□□□□□ -1.3
POLR1A-208ENST00000486964 SPINK13Q1W4C9 94 aa6.96□□□□□ -1.3
POLR1A-208ENST00000486964 LINC00467Q9BRT7 94 aa6.96□□□□□ -1.3
POLR1A-208ENST00000486964 ERG28Q9UKR5 140 aa6.96□□□□□ -1.3
POLR1A-208ENST00000486964 WNK1Q9H4A3 2382 aa6.96□□□□□ -1.3
POLR1A-208ENST00000486964 M0R2P5 195 aa6.95□□□□□ -1.3
POLR1A-208ENST00000486964 IGKV3-20P01619 116 aa6.95□□□□□ -1.3
POLR1A-208ENST00000486964 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
POLR1A-208ENST00000486964 RBMY1CP0DJD4 496 aa6.95□□□□□ -1.3
POLR1A-208ENST00000486964 EMP1P54849 157 aa6.95□□□□□ -1.3
POLR1A-208ENST00000486964 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
POLR1A-208ENST00000486964 C9orf66Q5T8R8 295 aa6.95□□□□□ -1.3
POLR1A-208ENST00000486964 DNAJC30Q96LL9 226 aa6.95□□□□□ -1.3
POLR1A-208ENST00000486964 TIMM21Q9BVV7 248 aa6.95□□□□□ -1.3
POLR1A-208ENST00000486964 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa6.94□□□□□ -1.3
POLR1A-208ENST00000486964 TCL1BO95988 128 aa6.94□□□□□ -1.3
POLR1A-208ENST00000486964 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
POLR1A-208ENST00000486964 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
POLR1A-208ENST00000486964 TNP2Q05952 138 aa6.94□□□□□ -1.3
POLR1A-208ENST00000486964 ATXN8Q156A1 80 aa6.94□□□□□ -1.3
POLR1A-208ENST00000486964 RNF183Q96D59 192 aa6.94□□□□□ -1.3
POLR1A-208ENST00000486964 SPANXDQ9BXN6 97 aa6.94□□□□□ -1.3
POLR1A-208ENST00000486964 SPANXCQ9NY87 97 aa6.94□□□□□ -1.3
POLR1A-208ENST00000486964 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa6.94□□□□□ -1.3
POLR1A-208ENST00000486964 SORL1Q92673 2214 aa6.94□□□□□ -1.3
POLR1A-208ENST00000486964 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa6.93□□□□□ -1.3
POLR1A-208ENST00000486964 A4D1N5 150 aa6.93□□□□□ -1.3
POLR1A-208ENST00000486964 TIMM17BO60830 172 aa6.93□□□□□ -1.3
POLR1A-208ENST00000486964 IGHV3-33P01772 117 aa6.93□□□□□ -1.3
POLR1A-208ENST00000486964 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
POLR1A-208ENST00000486964 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
POLR1A-208ENST00000486964 LINC01600Q96MT4 127 aa6.93□□□□□ -1.3
POLR1A-208ENST00000486964 SPXQ9BT56 116 aa6.93□□□□□ -1.3
POLR1A-208ENST00000486964 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
POLR1A-208ENST00000486964 SHISA2Q6UWI4 295 aa6.93□□□□□ -1.3
POLR1A-208ENST00000486964 COPS9Q8WXC6 57 aa6.93□□□□□ -1.3
POLR1A-208ENST00000486964 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa6.92□□□□□ -1.3
POLR1A-208ENST00000486964 A0A0J9YXY3 114 aa6.92□□□□□ -1.3
POLR1A-208ENST00000486964 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa6.92□□□□□ -1.3
POLR1A-208ENST00000486964 SLC25A20O43772 301 aa6.92□□□□□ -1.3
POLR1A-208ENST00000486964 COX6CP09669 75 aa6.92□□□□□ -1.3
POLR1A-208ENST00000486964 IFITM1P13164 125 aa6.92□□□□□ -1.3
POLR1A-208ENST00000486964 Q1RN00 199 aa6.92□□□□□ -1.3
POLR1A-208ENST00000486964 STHQ8IWL8 128 aa6.92□□□□□ -1.3
POLR1A-208ENST00000486964 A0A0J9YXV3 536 aa6.91□□□□□ -1.3
POLR1A-208ENST00000486964 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa6.91□□□□□ -1.3
POLR1A-208ENST00000486964 MIAQ16674 131 aa6.91□□□□□ -1.3
POLR1A-208ENST00000486964 C1orf158Q8N1D5 194 aa6.91□□□□□ -1.3
POLR1A-208ENST00000486964 ANKRD29Q8N6D5 301 aa6.91□□□□□ -1.3
POLR1A-208ENST00000486964 INSP01308 110 aa6.9□□□□□ -1.31
POLR1A-208ENST00000486964 MUSTN1Q8IVN3 82 aa6.9□□□□□ -1.31
POLR1A-208ENST00000486964 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa6.9□□□□□ -1.31
POLR1A-208ENST00000486964 WFDC10AQ9H1F0 79 aa6.9□□□□□ -1.31
POLR1A-208ENST00000486964 CDIP1Q9H305 208 aa6.9□□□□□ -1.31
POLR1A-208ENST00000486964 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
POLR1A-208ENST00000486964 NDUFA12Q9UI09 145 aa6.9□□□□□ -1.31
POLR1A-208ENST00000486964 AGRNO00468 2067 aa6.89□□□□□ -1.31
POLR1A-208ENST00000486964 C9JAW5 83 aa6.89□□□□□ -1.31
POLR1A-208ENST00000486964 IGHV3-53P01767 116 aa6.89□□□□□ -1.31
POLR1A-208ENST00000486964 SPINK8P0C7L1 97 aa6.89□□□□□ -1.31
POLR1A-208ENST00000486964 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
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POLR1A-208ENST00000486964 Q6ZUT4 128 aa6.89□□□□□ -1.31
POLR1A-208ENST00000486964 C3orf56Q8N813 242 aa6.89□□□□□ -1.31
POLR1A-208ENST00000486964 C11orf72Q8NBR9 251 aa6.89□□□□□ -1.31
POLR1A-208ENST00000486964 VSIG2Q96IQ7 327 aa6.89□□□□□ -1.31
POLR1A-208ENST00000486964 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa6.88□□□□□ -1.31
POLR1A-208ENST00000486964 H3BT86 120 aa6.88□□□□□ -1.31
POLR1A-208ENST00000486964 TIRAPP58753 221 aa6.88□□□□□ -1.31
POLR1A-208ENST00000486964 CKS1BP61024 79 aa6.88□□□□□ -1.31
POLR1A-208ENST00000486964 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
POLR1A-208ENST00000486964 LINC01620Q4KN68 170 aa6.88□□□□□ -1.31
POLR1A-208ENST00000486964 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
POLR1A-208ENST00000486964 XCL2Q9UBD3 114 aa6.88□□□□□ -1.31
POLR1A-208ENST00000486964 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa6.88□□□□□ -1.31
POLR1A-208ENST00000486964 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa6.88□□□□□ -1.31
POLR1A-208ENST00000486964 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa6.87□□□□□ -1.31
POLR1A-208ENST00000486964 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa6.87□□□□□ -1.31
POLR1A-208ENST00000486964 RS1O15537 224 aa6.87□□□□□ -1.31
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