RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486204.5

SSR4-211, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, humanhuman

TSL 3

Gene SSR4, Length 658 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4-211ENST00000486204 RMI2Q96E14 147 aa8.53□□□□□ -1.04
SSR4-211ENST00000486204 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa8.53□□□□□ -1.04
SSR4-211ENST00000486204 PRSS47A8MTI9 375 aa8.52□□□□□ -1.05
SSR4-211ENST00000486204 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa8.52□□□□□ -1.05
SSR4-211ENST00000486204 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
SSR4-211ENST00000486204 KIR2DL4Q99706 377 aa8.52□□□□□ -1.05
SSR4-211ENST00000486204 COX11Q9Y6N1 276 aa8.52□□□□□ -1.05
SSR4-211ENST00000486204 HLA-DQA1P01909 254 aa8.51□□□□□ -1.05
SSR4-211ENST00000486204 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
SSR4-211ENST00000486204 FCER1GP30273 86 aa8.51□□□□□ -1.05
SSR4-211ENST00000486204 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP8.51□□□□□ -1.05
SSR4-211ENST00000486204 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa8.51□□□□□ -1.05
SSR4-211ENST00000486204 C1orf43Q9BWL3 253 aa8.51□□□□□ -1.05
SSR4-211ENST00000486204 GNB1LQ9BYB4 327 aa8.51□□□□□ -1.05
SSR4-211ENST00000486204 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa8.5□□□□□ -1.05
SSR4-211ENST00000486204 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
SSR4-211ENST00000486204 KIAA1644Q3SXP7 199 aa8.5□□□□□ -1.05
SSR4-211ENST00000486204 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
SSR4-211ENST00000486204 Q8N814 137 aa8.5□□□□□ -1.05
SSR4-211ENST00000486204 YPEL4Q96NS1 127 aa8.5□□□□□ -1.05
SSR4-211ENST00000486204 EREGO14944 169 aa8.49□□□□□ -1.05
SSR4-211ENST00000486204 LECT2O14960 151 aa8.49□□□□□ -1.05
SSR4-211ENST00000486204 TCAPO15273 167 aa8.49□□□□□ -1.05
SSR4-211ENST00000486204 COX19Q49B96 90 aa8.49□□□□□ -1.05
SSR4-211ENST00000486204 BAALCQ8WXS3 180 aa8.49□□□□□ -1.05
SSR4-211ENST00000486204 MAP1LC3AQ9H492 121 aa8.49□□□□□ -1.05
SSR4-211ENST00000486204 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa8.49□□□□□ -1.05
SSR4-211ENST00000486204 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa8.49□□□□□ -1.05
SSR4-211ENST00000486204 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa8.48□□□□□ -1.05
SSR4-211ENST00000486204 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa8.48□□□□□ -1.05
SSR4-211ENST00000486204 FAM229AH3BQW9 127 aa8.48□□□□□ -1.05
SSR4-211ENST00000486204 MT-ND6P03923 174 aa8.48□□□□□ -1.05
SSR4-211ENST00000486204 CDPF1Q6NVV7 123 aa8.48□□□□□ -1.05
SSR4-211ENST00000486204 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa8.48□□□□□ -1.05
SSR4-211ENST00000486204 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
SSR4-211ENST00000486204 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa8.47□□□□□ -1.05
SSR4-211ENST00000486204 RPL39P62891 51 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
SSR4-211ENST00000486204 Q8N8P6 123 aa8.47□□□□□ -1.05
SSR4-211ENST00000486204 OR5A1Q8NGJ0 315 aa8.47□□□□□ -1.05
SSR4-211ENST00000486204 FAM104AQ969W3 186 aa8.47□□□□□ -1.05
SSR4-211ENST00000486204 TIMM21Q9BVV7 248 aa8.47□□□□□ -1.05
SSR4-211ENST00000486204 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
SSR4-211ENST00000486204 TMEM101Q96IK0 257 aa8.46□□□□□ -1.06
SSR4-211ENST00000486204 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
SSR4-211ENST00000486204 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa8.45□□□□□ -1.06
SSR4-211ENST00000486204 Q6ZUT4 128 aa8.45□□□□□ -1.06
SSR4-211ENST00000486204 CBLN2Q8IUK8 224 aa8.45□□□□□ -1.06
SSR4-211ENST00000486204 ZNF664Q8N3J9 261 aa8.45□□□□□ -1.06
SSR4-211ENST00000486204 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
SSR4-211ENST00000486204 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa8.44□□□□□ -1.06
SSR4-211ENST00000486204 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
SSR4-211ENST00000486204 USP17L23D6RBM5 183 aa8.44□□□□□ -1.06
SSR4-211ENST00000486204 RAB5AP20339 215 aa8.44□□□□□ -1.06
SSR4-211ENST00000486204 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
SSR4-211ENST00000486204 TMEM18Q96B42 140 aa8.44□□□□□ -1.06
SSR4-211ENST00000486204 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
SSR4-211ENST00000486204 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa8.44□□□□□ -1.06
SSR4-211ENST00000486204 K7EMI3 77 aa8.43□□□□□ -1.06
SSR4-211ENST00000486204 SMAGPQ0VAQ4 97 aa8.43□□□□□ -1.06
SSR4-211ENST00000486204 FABP9Q0Z7S8 132 aa8.43□□□□□ -1.06
SSR4-211ENST00000486204 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
SSR4-211ENST00000486204 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa8.43□□□□□ -1.06
SSR4-211ENST00000486204 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
SSR4-211ENST00000486204 SPANXA1Q9NS26 97 aa8.43□□□□□ -1.06
SSR4-211ENST00000486204 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
SSR4-211ENST00000486204 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa8.42□□□□□ -1.06
SSR4-211ENST00000486204 GAGE12HA6NDE8 117 aa8.42□□□□□ -1.06
SSR4-211ENST00000486204 LINC01546A6NGU7 62 aa8.42□□□□□ -1.06
SSR4-211ENST00000486204 KRTAP10-1P60331 282 aa8.42□□□□□ -1.06
SSR4-211ENST00000486204 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
SSR4-211ENST00000486204 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa8.42□□□□□ -1.06
SSR4-211ENST00000486204 CCL25O15444 150 aa8.41□□□□□ -1.06
SSR4-211ENST00000486204 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
SSR4-211ENST00000486204 FOXI1Q12951 378 aa8.41□□□□□ -1.06
SSR4-211ENST00000486204 ORMDL2Q53FV1 153 aa8.41□□□□□ -1.06
SSR4-211ENST00000486204 C2orf66Q6UXQ4 117 aa8.41□□□□□ -1.06
SSR4-211ENST00000486204 C15orf56Q8N910 161 aa8.41□□□□□ -1.06
SSR4-211ENST00000486204 SMCO4Q9NRQ5 59 aa8.41□□□□□ -1.06
SSR4-211ENST00000486204 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa8.41□□□□□ -1.06
SSR4-211ENST00000486204 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa8.4□□□□□ -1.06
SSR4-211ENST00000486204 PRSS1P07477 247 aa8.4□□□□□ -1.06
SSR4-211ENST00000486204 C14orf177Q52M58 125 aa8.4□□□□□ -1.06
SSR4-211ENST00000486204 CYSLTR1Q9Y271 337 aa8.4□□□□□ -1.06
SSR4-211ENST00000486204 GCSHP23434 173 aa8.39□□□□□ -1.07
SSR4-211ENST00000486204 XCL1P47992 114 aa8.39□□□□□ -1.07
SSR4-211ENST00000486204 SS18Q15532 418 aa8.39□□□□□ -1.07
SSR4-211ENST00000486204 C18orf32Q8TCD1 76 aa8.39□□□□□ -1.07
SSR4-211ENST00000486204 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa8.39□□□□□ -1.07
SSR4-211ENST00000486204 HAMPP81172 84 aa8.38□□□□□ -1.07
SSR4-211ENST00000486204 CD164L2Q6UWJ8 174 aa8.38□□□□□ -1.07
SSR4-211ENST00000486204 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa8.38□□□□□ -1.07
SSR4-211ENST00000486204 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa8.37□□□□□ -1.07
SSR4-211ENST00000486204 IGIPA6NJ69 53 aa8.37□□□□□ -1.07
SSR4-211ENST00000486204 C1orf196B1AJZ1 125 aa8.37□□□□□ -1.07
SSR4-211ENST00000486204 LINC01620Q4KN68 170 aa8.37□□□□□ -1.07
SSR4-211ENST00000486204 LINC00173Q6ZV60 143 aa8.37□□□□□ -1.07
SSR4-211ENST00000486204 TOMM6Q96B49 74 aa8.37□□□□□ -1.07
SSR4-211ENST00000486204 TMEM141Q96I45 108 aa8.36□□□□□ -1.07
SSR4-211ENST00000486204 DNAH8Q96JB1 4490 aa8.36□□□□□ -1.07
SSR4-211ENST00000486204 A0A096LNJ9 63 aa8.35□□□□□ -1.07
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