RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480525.5

HDAC6-223, Transcript of histone deacetylase 6, human

TSL 3

Gene HDAC6, Length 412 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC6-223	ENST00000480525	DNAH11	Q96DT5	4516 aa		3.38	□□□□□ -1.87
HDAC6-223	ENST00000480525	BIRC6	Q9NR09	4857 aa		3.37	□□□□□ -1.87
HDAC6-223	ENST00000480525	TMEM262	E9PQX1	116 aa		3.37	□□□□□ -1.87
HDAC6-223	ENST00000480525		M0R2N4	97 aa		3.37	□□□□□ -1.87
HDAC6-223	ENST00000480525	PSCA	O43653	123 aa		3.37	□□□□□ -1.87
HDAC6-223	ENST00000480525	IGHV3-30	P01768	117 aa		3.37	□□□□□ -1.87
HDAC6-223	ENST00000480525	IGHV3-33	P01772	117 aa		3.37	□□□□□ -1.87
HDAC6-223	ENST00000480525	IGHV3-30-3	P0DP02	117 aa		3.37	□□□□□ -1.87
HDAC6-223	ENST00000480525	IGHV3-30-5	P0DP03	117 aa		3.37	□□□□□ -1.87
HDAC6-223	ENST00000480525	IFI27	P40305	119 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
HDAC6-223	ENST00000480525	RAB5B	P61020	215 aa		3.37	□□□□□ -1.87
HDAC6-223	ENST00000480525	CNBP	P62633	177 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
HDAC6-223	ENST00000480525	SEC11A	P67812	179 aa		3.37	□□□□□ -1.87
HDAC6-223	ENST00000480525	TNP2	Q05952	138 aa		3.37	□□□□□ -1.87
HDAC6-223	ENST00000480525	AMMECR1L	Q6DCA0	310 aa		3.37	□□□□□ -1.87
HDAC6-223	ENST00000480525	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		3.37	□□□□□ -1.87
HDAC6-223	ENST00000480525		Q8N814	137 aa		3.37	□□□□□ -1.87
HDAC6-223	ENST00000480525	CYSLTR1	Q9Y271	337 aa		3.37	□□□□□ -1.87
HDAC6-223	ENST00000480525	IGLV4-60	A0A075B6I1	120 aa		3.36	□□□□□ -1.87
HDAC6-223	ENST00000480525	GVQW2	A0A096LPI5	108 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
HDAC6-223	ENST00000480525	IGIP	A6NJ69	53 aa		3.36	□□□□□ -1.87
HDAC6-223	ENST00000480525	GAGE6	Q13070	117 aa		3.36	□□□□□ -1.87
HDAC6-223	ENST00000480525	CFAP161	Q6P656	301 aa		3.36	□□□□□ -1.87
HDAC6-223	ENST00000480525	CD164L2	Q6UWJ8	174 aa		3.36	□□□□□ -1.87
HDAC6-223	ENST00000480525	ERAS	Q7Z444	233 aa		3.36	□□□□□ -1.87
HDAC6-223	ENST00000480525	UBE2W	Q96B02	151 aa		3.36	□□□□□ -1.87
HDAC6-223	ENST00000480525	TOMM6	Q96B49	74 aa		3.36	□□□□□ -1.87
HDAC6-223	ENST00000480525	TMEM141	Q96I45	108 aa		3.36	□□□□□ -1.87
HDAC6-223	ENST00000480525	AMELX	Q99217	191 aa		3.36	□□□□□ -1.87
HDAC6-223	ENST00000480525	MRPL18	Q9H0U6	180 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
HDAC6-223	ENST00000480525	AP5S1	Q9NUS5	200 aa		3.36	□□□□□ -1.87
HDAC6-223	ENST00000480525	IGKV2D-24	A0A075B6R9	120 aa		3.35	□□□□□ -1.87
HDAC6-223	ENST00000480525	LINC00959	A0A1B0GUT2	108 aa		3.35	□□□□□ -1.87
HDAC6-223	ENST00000480525	SMKR1	H3BMG3	65 aa		3.35	□□□□□ -1.87
HDAC6-223	ENST00000480525	S100A1	P23297	94 aa		3.35	□□□□□ -1.87
HDAC6-223	ENST00000480525	SS18	Q15532	418 aa		3.35	□□□□□ -1.87
HDAC6-223	ENST00000480525	C2orf66	Q6UXQ4	117 aa		3.35	□□□□□ -1.87
HDAC6-223	ENST00000480525		Q6ZSA8	131 aa		3.35	□□□□□ -1.87
HDAC6-223	ENST00000480525		Q8N3U1	123 aa		3.35	□□□□□ -1.87
HDAC6-223	ENST00000480525	MAPKAPK5-AS1	Q8N8E1	139 aa		3.35	□□□□□ -1.87
HDAC6-223	ENST00000480525	OR10D4P	Q8NGN7	298 aa		3.35	□□□□□ -1.87
HDAC6-223	ENST00000480525	C18orf32	Q8TCD1	76 aa		3.35	□□□□□ -1.87
HDAC6-223	ENST00000480525	FAM104A	Q969W3	186 aa		3.35	□□□□□ -1.87
HDAC6-223	ENST00000480525	CHCHD1	Q96BP2	118 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
HDAC6-223	ENST00000480525	PACRG	Q96M98	296 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
HDAC6-223	ENST00000480525	TRAPPC1	Q9Y5R8	145 aa		3.35	□□□□□ -1.87
HDAC6-223	ENST00000480525	DYNC1H1	Q14204	4646 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
HDAC6-223	ENST00000480525	IGLV4-3	A0A075B6K6	122 aa		3.34	□□□□□ -1.87
HDAC6-223	ENST00000480525	IGKV2D-29	A0A075B6S2	120 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
HDAC6-223	ENST00000480525	IGLV5-45	A0A087WSX0	123 aa		3.34	□□□□□ -1.87
HDAC6-223	ENST00000480525	TGIF2-C20orf24	A0A0A6YYL0	155 aa		3.34	□□□□□ -1.87
HDAC6-223	ENST00000480525	IGHV3OR16-9	A0A0B4J2B5	98 aa		3.34	□□□□□ -1.87
HDAC6-223	ENST00000480525	IGKV2-29	A2NJV5	120 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
HDAC6-223	ENST00000480525	FABP9	Q0Z7S8	132 aa		3.34	□□□□□ -1.87
HDAC6-223	ENST00000480525	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
HDAC6-223	ENST00000480525	RNF151	Q2KHN1	245 aa		3.34	□□□□□ -1.87
HDAC6-223	ENST00000480525	RNASEK	Q6P5S7	137 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
HDAC6-223	ENST00000480525		Q6ZN92	141 aa		3.34	□□□□□ -1.87
HDAC6-223	ENST00000480525	TEX43	Q6ZNM6	134 aa		3.34	□□□□□ -1.87
HDAC6-223	ENST00000480525	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		3.34	□□□□□ -1.87
HDAC6-223	ENST00000480525	C2orf88	Q9BSF0	95 aa		3.34	□□□□□ -1.87
HDAC6-223	ENST00000480525		Q9HAA7	133 aa		3.34	□□□□□ -1.87
HDAC6-223	ENST00000480525	DNAH5	Q8TE73	4624 aa		3.34	□□□□□ -1.88
HDAC6-223	ENST00000480525	LRP1B	Q9NZR2	4599 aa		3.33	□□□□□ -1.88
HDAC6-223	ENST00000480525		A0A087WZ39	114 aa		3.33	□□□□□ -1.88
HDAC6-223	ENST00000480525	TRAV16	A0A0A6YYK6	109 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
HDAC6-223	ENST00000480525	IGHV1-58	A0A0C4DH39	117 aa		3.33	□□□□□ -1.88
HDAC6-223	ENST00000480525	COLCA2	A8K830	154 aa		3.33	□□□□□ -1.88
HDAC6-223	ENST00000480525	USP17L23	D6RBM5	183 aa		3.33	□□□□□ -1.88
HDAC6-223	ENST00000480525	ATP6V1G1	O75348	118 aa		3.33	□□□□□ -1.88
HDAC6-223	ENST00000480525	ATP5L	O75964	103 aa		3.33	□□□□□ -1.88
HDAC6-223	ENST00000480525	APOM	O95445	188 aa		3.33	□□□□□ -1.88
HDAC6-223	ENST00000480525	LINC00614	P0C842	121 aa		3.33	□□□□□ -1.88
HDAC6-223	ENST00000480525	HERVK_113	P63121	156 aa		3.33	□□□□□ -1.88
HDAC6-223	ENST00000480525	FOXI1	Q12951	378 aa		3.33	□□□□□ -1.88
HDAC6-223	ENST00000480525	SFTA2	Q6UW10	78 aa		3.33	□□□□□ -1.88
HDAC6-223	ENST00000480525	FA2H	Q7L5A8	372 aa		3.33	□□□□□ -1.88
HDAC6-223	ENST00000480525	SPATA12	Q7Z6I5	190 aa		3.33	□□□□□ -1.88
HDAC6-223	ENST00000480525	SLC7A5P1	Q8MH63	180 aa		3.33	□□□□□ -1.88
HDAC6-223	ENST00000480525	C9orf163	Q8N9P6	203 aa		3.33	□□□□□ -1.88
HDAC6-223	ENST00000480525	CHCHD10	Q8WYQ3	142 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
HDAC6-223	ENST00000480525	C2orf48	Q96LS8	159 aa		3.33	□□□□□ -1.88
HDAC6-223	ENST00000480525	KIAA1109	Q2LD37	5005 aa		3.32	□□□□□ -1.88
HDAC6-223	ENST00000480525	IGLV10-54	A0A075B6I4	117 aa		3.32	□□□□□ -1.88
HDAC6-223	ENST00000480525	IGLV5-52	A0A0A0MRZ9	124 aa		3.32	□□□□□ -1.88
HDAC6-223	ENST00000480525	C16orf90	A8MZG2	172 aa		3.32	□□□□□ -1.88
HDAC6-223	ENST00000480525	BORCS8-MEF2B	H3BNR1	382 aa	Predicted RBP	3.32	□□□□□ -1.88
HDAC6-223	ENST00000480525	COX7A2L	O14548	114 aa		3.32	□□□□□ -1.88
HDAC6-223	ENST00000480525	HBD	P02042	147 aa		3.32	□□□□□ -1.88
HDAC6-223	ENST00000480525	GCSH	P23434	173 aa		3.32	□□□□□ -1.88
HDAC6-223	ENST00000480525	UBE2D1	P51668	147 aa		3.32	□□□□□ -1.88
HDAC6-223	ENST00000480525	KRTAP10-2	P60368	255 aa		3.32	□□□□□ -1.88
HDAC6-223	ENST00000480525	RPL39	P62891	51 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
HDAC6-223	ENST00000480525	PDZD11	Q5EBL8	140 aa		3.32	□□□□□ -1.88
HDAC6-223	ENST00000480525	COA6	Q5JTJ3	125 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
HDAC6-223	ENST00000480525		Q6ZUT4	128 aa		3.32	□□□□□ -1.88
HDAC6-223	ENST00000480525	LINC00173	Q6ZV60	143 aa		3.32	□□□□□ -1.88
HDAC6-223	ENST00000480525	CBLN2	Q8IUK8	224 aa		3.32	□□□□□ -1.88
HDAC6-223	ENST00000480525	C15orf56	Q8N910	161 aa		3.32	□□□□□ -1.88
HDAC6-223	ENST00000480525	VCX2	Q9H322	139 aa		3.32	□□□□□ -1.88

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