RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475302.1

ITGA6-210, Transcript of integrin subunit alpha 6, humanhuman

TSL 3

Gene ITGA6, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6-210ENST00000475302 VSIG2Q96IQ7 327 aa6.75□□□□□ -1.33
ITGA6-210ENST00000475302 TIMM21Q9BVV7 248 aa6.75□□□□□ -1.33
ITGA6-210ENST00000475302 RETNQ9HD89 108 aa6.75□□□□□ -1.33
ITGA6-210ENST00000475302 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa6.75□□□□□ -1.33
ITGA6-210ENST00000475302 DPM2O94777 84 aa6.74□□□□□ -1.33
ITGA6-210ENST00000475302 IGKCP01834 107 aa6.74□□□□□ -1.33
ITGA6-210ENST00000475302 SPART-AS1P0CW21 52 aa6.74□□□□□ -1.33
ITGA6-210ENST00000475302 FGF6P10767 208 aa6.74□□□□□ -1.33
ITGA6-210ENST00000475302 C12orf74Q32Q52 190 aa6.74□□□□□ -1.33
ITGA6-210ENST00000475302 Q6ZN92 141 aa6.74□□□□□ -1.33
ITGA6-210ENST00000475302 STPG4Q8N801 248 aa6.74□□□□□ -1.33
ITGA6-210ENST00000475302 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa6.74□□□□□ -1.33
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ITGA6-210ENST00000475302 COTL1Q14019 142 aa6.73□□□□□ -1.33
ITGA6-210ENST00000475302 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
ITGA6-210ENST00000475302 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
ITGA6-210ENST00000475302 LURAP1LQ8IV03 231 aa6.73□□□□□ -1.33
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ITGA6-210ENST00000475302 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
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ITGA6-210ENST00000475302 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
ITGA6-210ENST00000475302 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
ITGA6-210ENST00000475302 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa6.72□□□□□ -1.33
ITGA6-210ENST00000475302 NFE4Q86UQ8 179 aa6.72□□□□□ -1.33
ITGA6-210ENST00000475302 C14orf144Q96I85 54 aa6.72□□□□□ -1.33
ITGA6-210ENST00000475302 TM2D3Q9BRN9 247 aa6.72□□□□□ -1.33
ITGA6-210ENST00000475302 UQCR10Q9UDW1 63 aa6.72□□□□□ -1.33
ITGA6-210ENST00000475302 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
ITGA6-210ENST00000475302 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
ITGA6-210ENST00000475302 C11orf86A6NJI1 115 aa6.71□□□□□ -1.34
ITGA6-210ENST00000475302 DLEU1O43261 78 aa6.71□□□□□ -1.34
ITGA6-210ENST00000475302 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
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ITGA6-210ENST00000475302 PLNP26678 52 aa6.71□□□□□ -1.34
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ITGA6-210ENST00000475302 BOD1L2Q8IYS8 172 aa6.71□□□□□ -1.34
ITGA6-210ENST00000475302 TP73-AS1Q9UF72 201 aa6.71□□□□□ -1.34
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ITGA6-210ENST00000475302 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa6.7□□□□□ -1.34
ITGA6-210ENST00000475302 H7C423 109 aa6.7□□□□□ -1.34
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ITGA6-210ENST00000475302 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa6.69□□□□□ -1.34
ITGA6-210ENST00000475302 HSBP1L1C9JCN9 74 aa6.69□□□□□ -1.34
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ITGA6-210ENST00000475302 Q6ZUT4 128 aa6.69□□□□□ -1.34
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ITGA6-210ENST00000475302 PCP2Q8IVA1 136 aa6.69□□□□□ -1.34
ITGA6-210ENST00000475302 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa6.69□□□□□ -1.34
ITGA6-210ENST00000475302 VCX2Q9H322 139 aa6.69□□□□□ -1.34
ITGA6-210ENST00000475302 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
ITGA6-210ENST00000475302 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa6.68□□□□□ -1.34
ITGA6-210ENST00000475302 A0A0J9YXV3 536 aa6.68□□□□□ -1.34
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ITGA6-210ENST00000475302 TMEM97Q5BJF2 176 aa6.68□□□□□ -1.34
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ITGA6-210ENST00000475302 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa6.68□□□□□ -1.34
ITGA6-210ENST00000475302 TMEM243Q9BU79 118 aa6.68□□□□□ -1.34
ITGA6-210ENST00000475302 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa6.68□□□□□ -1.34
ITGA6-210ENST00000475302 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa6.68□□□□□ -1.34
ITGA6-210ENST00000475302 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa6.67□□□□□ -1.34
ITGA6-210ENST00000475302 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa6.67□□□□□ -1.34
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ITGA6-210ENST00000475302 UBE2D1P51668 147 aa6.67□□□□□ -1.34
ITGA6-210ENST00000475302 SLC25A34Q6PIV7 304 aa6.67□□□□□ -1.34
ITGA6-210ENST00000475302 A0A096LPF7 62 aa6.66□□□□□ -1.34
ITGA6-210ENST00000475302 A0A0J9YWU9 116 aa6.66□□□□□ -1.34
ITGA6-210ENST00000475302 A0A0J9YY99 117 aa6.66□□□□□ -1.34
ITGA6-210ENST00000475302 F5H768 121 aa6.66□□□□□ -1.34
ITGA6-210ENST00000475302 SIVA1O15304 175 aa6.66□□□□□ -1.34
ITGA6-210ENST00000475302 TIRAPP58753 221 aa6.66□□□□□ -1.34
ITGA6-210ENST00000475302 CTAG1AP78358 180 aa6.66□□□□□ -1.34
ITGA6-210ENST00000475302 DEFA6Q01524 100 aa6.66□□□□□ -1.34
ITGA6-210ENST00000475302 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa6.66□□□□□ -1.34
ITGA6-210ENST00000475302 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
ITGA6-210ENST00000475302 SNHG12Q9BXW3 62 aa6.66□□□□□ -1.34
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ITGA6-210ENST00000475302 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa6.65□□□□□ -1.34
ITGA6-210ENST00000475302 TMEM223A0PJW6 202 aa6.65□□□□□ -1.34
ITGA6-210ENST00000475302 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
ITGA6-210ENST00000475302 LINC00242Q5T6M2 205 aa6.65□□□□□ -1.34
ITGA6-210ENST00000475302 CHAC1Q9BUX1 264 aa6.65□□□□□ -1.34
ITGA6-210ENST00000475302 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa6.64□□□□□ -1.35
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ITGA6-210ENST00000475302 TCTAP57738 103 aa6.64□□□□□ -1.35
ITGA6-210ENST00000475302 GAGE6Q13070 117 aa6.64□□□□□ -1.35
ITGA6-210ENST00000475302 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
ITGA6-210ENST00000475302 Q6ZTC4 211 aa6.64□□□□□ -1.35
ITGA6-210ENST00000475302 HIGD1BQ9P298 99 aa6.64□□□□□ -1.35
ITGA6-210ENST00000475302 TENM3Q9P273 2699 aa6.63□□□□□ -1.35
ITGA6-210ENST00000475302 NMUP48645 174 aa6.63□□□□□ -1.35
ITGA6-210ENST00000475302 TSPEAR-AS2P59090 65 aa6.63□□□□□ -1.35
ITGA6-210ENST00000475302 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
ITGA6-210ENST00000475302 COX6A2Q02221 97 aa6.63□□□□□ -1.35
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