RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444658.7

CCNDBP1-202, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 1,479 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-202ENST00000444658 SPANXA1Q9NS26 97 aa6.5□□□□□ -1.37
CCNDBP1-202ENST00000444658 PTTG1IPP53801 180 aa6.49□□□□□ -1.37
CCNDBP1-202ENST00000444658 UBE2V1Q13404 147 aa6.49□□□□□ -1.37
CCNDBP1-202ENST00000444658 C2orf91Q6ZV80 131 aa6.49□□□□□ -1.37
CCNDBP1-202ENST00000444658 NFE4Q86UQ8 179 aa6.49□□□□□ -1.37
CCNDBP1-202ENST00000444658 GAGE12JA6NER3 117 aa6.48□□□□□ -1.37
CCNDBP1-202ENST00000444658 E9PLD3 99 aa6.48□□□□□ -1.37
CCNDBP1-202ENST00000444658 PAX4O43316 350 aa6.48□□□□□ -1.37
CCNDBP1-202ENST00000444658 NMUP48645 174 aa6.48□□□□□ -1.37
CCNDBP1-202ENST00000444658 RPL39P62891 51 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CCNDBP1-202ENST00000444658 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CCNDBP1-202ENST00000444658 GAGE4Q13068 117 aa6.48□□□□□ -1.37
CCNDBP1-202ENST00000444658 GAGE5Q13069 117 aa6.48□□□□□ -1.37
CCNDBP1-202ENST00000444658 GAGE13Q4V321 117 aa6.48□□□□□ -1.37
CCNDBP1-202ENST00000444658 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa6.48□□□□□ -1.37
CCNDBP1-202ENST00000444658 C11orf86A6NJI1 115 aa6.47□□□□□ -1.37
CCNDBP1-202ENST00000444658 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CCNDBP1-202ENST00000444658 HERVK_113P61574 105 aa6.47□□□□□ -1.37
CCNDBP1-202ENST00000444658 SEC11AP67812 179 aa6.47□□□□□ -1.37
CCNDBP1-202ENST00000444658 HSD52Q0P140 79 aa6.47□□□□□ -1.37
CCNDBP1-202ENST00000444658 C12orf74Q32Q52 190 aa6.47□□□□□ -1.37
CCNDBP1-202ENST00000444658 MPV17L2Q567V2 206 aa6.47□□□□□ -1.37
CCNDBP1-202ENST00000444658 DEFB121Q5J5C9 76 aa6.47□□□□□ -1.37
CCNDBP1-202ENST00000444658 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa6.47□□□□□ -1.37
CCNDBP1-202ENST00000444658 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa6.47□□□□□ -1.37
CCNDBP1-202ENST00000444658 AMELXQ99217 191 aa6.47□□□□□ -1.37
CCNDBP1-202ENST00000444658 CELA1Q9UNI1 258 aa6.47□□□□□ -1.37
CCNDBP1-202ENST00000444658 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa6.47□□□□□ -1.37
CCNDBP1-202ENST00000444658 COX11Q9Y6N1 276 aa6.47□□□□□ -1.37
CCNDBP1-202ENST00000444658 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa6.47□□□□□ -1.37
CCNDBP1-202ENST00000444658 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa6.47□□□□□ -1.37
CCNDBP1-202ENST00000444658 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa6.47□□□□□ -1.37
CCNDBP1-202ENST00000444658 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa6.47□□□□□ -1.37
CCNDBP1-202ENST00000444658 DEFB4AO15263 64 aa6.47□□□□□ -1.37
CCNDBP1-202ENST00000444658 BATFQ16520 125 aa6.47□□□□□ -1.37
CCNDBP1-202ENST00000444658 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
CCNDBP1-202ENST00000444658 TAL2Q16559 108 aa6.47□□□□□ -1.37
CCNDBP1-202ENST00000444658 PCP2Q8IVA1 136 aa6.47□□□□□ -1.37
CCNDBP1-202ENST00000444658 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa6.47□□□□□ -1.37
CCNDBP1-202ENST00000444658 VSIG2Q96IQ7 327 aa6.47□□□□□ -1.37
CCNDBP1-202ENST00000444658 VCX2Q9H322 139 aa6.47□□□□□ -1.37
CCNDBP1-202ENST00000444658 NACAE9PAV3 2078 aa6.46□□□□□ -1.37
CCNDBP1-202ENST00000444658 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa6.46□□□□□ -1.38
CCNDBP1-202ENST00000444658 GYPEP15421 78 aa6.46□□□□□ -1.38
CCNDBP1-202ENST00000444658 TIRAPP58753 221 aa6.46□□□□□ -1.38
CCNDBP1-202ENST00000444658 RBX1P62877 108 aa6.46□□□□□ -1.38
CCNDBP1-202ENST00000444658 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
CCNDBP1-202ENST00000444658 FAM104AQ969W3 186 aa6.46□□□□□ -1.38
CCNDBP1-202ENST00000444658 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa6.45□□□□□ -1.38
CCNDBP1-202ENST00000444658 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa6.45□□□□□ -1.38
CCNDBP1-202ENST00000444658 TMEM243Q9BU79 118 aa6.45□□□□□ -1.38
CCNDBP1-202ENST00000444658 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa6.44□□□□□ -1.38
CCNDBP1-202ENST00000444658 A0A1B0GUV1 79 aa6.44□□□□□ -1.38
CCNDBP1-202ENST00000444658 F5H768 121 aa6.44□□□□□ -1.38
CCNDBP1-202ENST00000444658 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
CCNDBP1-202ENST00000444658 C11orf45Q8TAV5 145 aa6.44□□□□□ -1.38
CCNDBP1-202ENST00000444658 B9D2Q9BPU9 175 aa6.44□□□□□ -1.38
CCNDBP1-202ENST00000444658 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa6.43□□□□□ -1.38
CCNDBP1-202ENST00000444658 A0A0J9YWU9 116 aa6.43□□□□□ -1.38
CCNDBP1-202ENST00000444658 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa6.43□□□□□ -1.38
CCNDBP1-202ENST00000444658 A6NDN8 102 aa6.43□□□□□ -1.38
CCNDBP1-202ENST00000444658 CCL25O15444 150 aa6.43□□□□□ -1.38
CCNDBP1-202ENST00000444658 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa6.43□□□□□ -1.38
CCNDBP1-202ENST00000444658 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa6.43□□□□□ -1.38
CCNDBP1-202ENST00000444658 TM2D2Q9BX73 214 aa6.43□□□□□ -1.38
CCNDBP1-202ENST00000444658 RETNQ9HD89 108 aa6.43□□□□□ -1.38
CCNDBP1-202ENST00000444658 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa6.43□□□□□ -1.38
CCNDBP1-202ENST00000444658 ICOSQ9Y6W8 199 aa6.43□□□□□ -1.38
CCNDBP1-202ENST00000444658 MGAM2Q2M2H8 2515 aa6.43□□□□□ -1.38
CCNDBP1-202ENST00000444658 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
CCNDBP1-202ENST00000444658 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa6.42□□□□□ -1.38
CCNDBP1-202ENST00000444658 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa6.42□□□□□ -1.38
CCNDBP1-202ENST00000444658 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
CCNDBP1-202ENST00000444658 UBE2L6O14933 153 aa6.42□□□□□ -1.38
CCNDBP1-202ENST00000444658 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
CCNDBP1-202ENST00000444658 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa6.42□□□□□ -1.38
CCNDBP1-202ENST00000444658 TMEM101Q96IK0 257 aa6.42□□□□□ -1.38
CCNDBP1-202ENST00000444658 CHAC1Q9BUX1 264 aa6.42□□□□□ -1.38
CCNDBP1-202ENST00000444658 TP73-AS1Q9UF72 201 aa6.42□□□□□ -1.38
CCNDBP1-202ENST00000444658 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
CCNDBP1-202ENST00000444658 TMEM223A0PJW6 202 aa6.41□□□□□ -1.38
CCNDBP1-202ENST00000444658 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
CCNDBP1-202ENST00000444658 TMEM170BQ5T4T1 132 aa6.41□□□□□ -1.38
CCNDBP1-202ENST00000444658 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa6.41□□□□□ -1.38
CCNDBP1-202ENST00000444658 A0A096LPF7 62 aa6.41□□□□□ -1.38
CCNDBP1-202ENST00000444658 LEPROTO15243 131 aa6.41□□□□□ -1.38
CCNDBP1-202ENST00000444658 LELP1Q5T871 98 aa6.41□□□□□ -1.38
CCNDBP1-202ENST00000444658 Q6ZTC4 211 aa6.41□□□□□ -1.38
CCNDBP1-202ENST00000444658 OR5A1Q8NGJ0 315 aa6.41□□□□□ -1.38
CCNDBP1-202ENST00000444658 MRAPQ8TCY5 172 aa6.41□□□□□ -1.38
CCNDBP1-202ENST00000444658 PLEKHB2Q96CS7 222 aa6.41□□□□□ -1.38
CCNDBP1-202ENST00000444658 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
CCNDBP1-202ENST00000444658 NOTCH1P46531 2555 aa6.4□□□□□ -1.39
CCNDBP1-202ENST00000444658 DNAH9Q9NYC9 4486 aa6.4□□□□□ -1.39
CCNDBP1-202ENST00000444658 TRAV10A0A0B4J240 114 aa6.4□□□□□ -1.39
CCNDBP1-202ENST00000444658 A0A0J9YY99 117 aa6.4□□□□□ -1.39
CCNDBP1-202ENST00000444658 H3BRM9 83 aa6.4□□□□□ -1.39
CCNDBP1-202ENST00000444658 K7ERU9 68 aa6.4□□□□□ -1.39
CCNDBP1-202ENST00000444658 TAX1BP3O14907 124 aa6.4□□□□□ -1.39
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 89.8 ms