RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-209ENST00000442510 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-209ENST00000442510 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-209ENST00000442510 Q6ZPA2 131 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRC-209ENST00000442510 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-209ENST00000442510 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-209ENST00000442510 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-209ENST00000442510 C1orf134Q5TEV5 83 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-209ENST00000442510 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-209ENST00000442510 C16orf95Q9H693 158 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-209ENST00000442510 COL6A6A6NMZ7 2263 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-209ENST00000442510 ABCA4P78363 2273 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-209ENST00000442510 NOTCH3Q9UM47 2321 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-209ENST00000442510 LINC01546A6NGU7 62 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-209ENST00000442510 Q6ZTI0 123 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-209ENST00000442510 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-209ENST00000442510 CTSZQ9UBR2 303 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-209ENST00000442510 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-209ENST00000442510 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-209ENST00000442510 NUP98P52948 1817 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-209ENST00000442510 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-209ENST00000442510 PRAC2D3DTV9 90 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-209ENST00000442510 PRAC1Q96KF2 57 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRC-209ENST00000442510 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-209ENST00000442510 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-209ENST00000442510 FAM229BQ4G0N7 80 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-209ENST00000442510 GGNQ86UU5 652 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF843Q8N446 348 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-209ENST00000442510 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-209ENST00000442510 PLXNA2O75051 1894 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-209ENST00000442510 H0Y9P7 68 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-209ENST00000442510 LINC00467Q9BRT7 94 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-209ENST00000442510 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-209ENST00000442510 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-209ENST00000442510 IGHV3-53P01767 116 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-209ENST00000442510 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-209ENST00000442510 SMIM29Q86T20 159 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-209ENST00000442510 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-209ENST00000442510 F5P12259 2224 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-209ENST00000442510 C16orf90A8MZG2 172 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-209ENST00000442510 PLA2G2AP14555 144 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-209ENST00000442510 BRWD1-AS2P59051 145 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-209ENST00000442510 KIAA0087Q14695 138 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-209ENST00000442510 SPINK14Q6IE38 97 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-209ENST00000442510 WDR90Q96KV7 1748 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-209ENST00000442510 CREBBPQ92793 2442 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-209ENST00000442510 SPINK13Q1W4C9 94 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-209ENST00000442510 ZNRD1Q9P1U0 126 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-209ENST00000442510 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-209ENST00000442510 A0A1B0GU69 56 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-209ENST00000442510 FAM218AQ96MZ4 157 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-209ENST00000442510 PTPRSQ13332 1948 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-209ENST00000442510 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-209ENST00000442510 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-209ENST00000442510 MUC7Q8TAX7 377 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-209ENST00000442510 I3L2K1 104 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-209ENST00000442510 C17orf58Q2M2W7 97 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-209ENST00000442510 MINOS1Q5TGZ0 78 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-209ENST00000442510 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-209ENST00000442510 Q6ZRP5 223 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-209ENST00000442510 IGHV3-11P01762 117 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-209ENST00000442510 CCL18P55774 89 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-209ENST00000442510 IGFL3Q6UXB1 125 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-209ENST00000442510 Q8N2B8 174 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-209ENST00000442510 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF580Q9UK33 172 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRC-209ENST00000442510 LINC00575Q6W349 94 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-209ENST00000442510 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-209ENST00000442510 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-209ENST00000442510 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-209ENST00000442510 C10orf25Q5T742 122 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-209ENST00000442510 CRIP3Q6Q6R5 217 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-209ENST00000442510 MUC4Q99102 2169 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-209ENST00000442510 SBF1O95248 1867 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-209ENST00000442510 NAV3Q8IVL0 2385 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-209ENST00000442510 PCOTHQ58A44 107 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-209ENST00000442510 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa4□□□□□ -1.77
PTPRC-209ENST00000442510 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
PTPRC-209ENST00000442510 H3BPC8 53 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-209ENST00000442510 IGHV1-46P01743 117 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-209ENST00000442510 CLPSP04118 112 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-209ENST00000442510 PRSS33Q8NF86 280 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-209ENST00000442510 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-209ENST00000442510 K7EIM0 57 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-209ENST00000442510 Q75L30 129 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-209ENST00000442510 MAP6D1Q9H9H5 199 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-209ENST00000442510 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-209ENST00000442510 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-209ENST00000442510 TTTY12Q9BZ98 90 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRC-209ENST00000442510 TSHBP01222 138 aa3.98□□□□□ -1.77
PTPRC-209ENST00000442510 MSMBP08118 114 aa3.98□□□□□ -1.77
PTPRC-209ENST00000442510 XAGE1AQ9HD64 81 aa3.98□□□□□ -1.77
PTPRC-209ENST00000442510 M0QY20 66 aa3.98□□□□□ -1.77
PTPRC-209ENST00000442510 Q6ZQT0 140 aa3.98□□□□□ -1.77
PTPRC-209ENST00000442510 COA5Q86WW8 74 aa3.98□□□□□ -1.77
PTPRC-209ENST00000442510 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
PTPRC-209ENST00000442510 A0A1B0GW54 56 aa3.98□□□□□ -1.77
PTPRC-209ENST00000442510 LHBP01229 141 aa3.98□□□□□ -1.77
PTPRC-209ENST00000442510 KAAG1Q9UBP8 84 aa3.98□□□□□ -1.77
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