RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438888.5

PRAME-208, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 4

Gene PRAME, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-208ENST00000438888 PMCHL1Q16048 86 aa8.43□□□□□ -1.06
PRAME-208ENST00000438888 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
PRAME-208ENST00000438888 EPM2AB3EWF7 344 aa8.42□□□□□ -1.06
PRAME-208ENST00000438888 UBE2L6O14933 153 aa8.42□□□□□ -1.06
PRAME-208ENST00000438888 HBDP02042 147 aa8.42□□□□□ -1.06
PRAME-208ENST00000438888 C2orf66Q6UXQ4 117 aa8.42□□□□□ -1.06
PRAME-208ENST00000438888 C20orf203Q8NBC4 194 aa8.42□□□□□ -1.06
PRAME-208ENST00000438888 TMEM18Q96B42 140 aa8.42□□□□□ -1.06
PRAME-208ENST00000438888 CHCHD5Q9BSY4 110 aa8.42□□□□□ -1.06
PRAME-208ENST00000438888 CYSLTR1Q9Y271 337 aa8.42□□□□□ -1.06
PRAME-208ENST00000438888 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
PRAME-208ENST00000438888 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa8.41□□□□□ -1.06
PRAME-208ENST00000438888 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
PRAME-208ENST00000438888 EREGO14944 169 aa8.41□□□□□ -1.06
PRAME-208ENST00000438888 DNAH10OSP0CZ25 163 aa8.41□□□□□ -1.06
PRAME-208ENST00000438888 FAM19A2Q8N3H0 131 aa8.41□□□□□ -1.06
PRAME-208ENST00000438888 A0A096LNJ9 63 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAME-208ENST00000438888 LINC01549A6NIU2 74 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAME-208ENST00000438888 H7C423 109 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAME-208ENST00000438888 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
PRAME-208ENST00000438888 RPL39P62891 51 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
PRAME-208ENST00000438888 GAGE6Q13070 117 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAME-208ENST00000438888 TOMM6Q96B49 74 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAME-208ENST00000438888 C5orf52A6NGY3 159 aa8.39□□□□□ -1.07
PRAME-208ENST00000438888 FGF6P10767 208 aa8.39□□□□□ -1.07
PRAME-208ENST00000438888 PKIAP61925 76 aa8.39□□□□□ -1.07
PRAME-208ENST00000438888 SMAGPQ0VAQ4 97 aa8.39□□□□□ -1.07
PRAME-208ENST00000438888 PDZD11Q5EBL8 140 aa8.39□□□□□ -1.07
PRAME-208ENST00000438888 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
PRAME-208ENST00000438888 TMEM262E9PQX1 116 aa8.38□□□□□ -1.07
PRAME-208ENST00000438888 S100A2P29034 98 aa8.38□□□□□ -1.07
PRAME-208ENST00000438888 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa8.38□□□□□ -1.07
PRAME-208ENST00000438888 WFDC10BQ8IUB3 73 aa8.38□□□□□ -1.07
PRAME-208ENST00000438888 HIST3H2BBQ8N257 126 aa8.38□□□□□ -1.07
PRAME-208ENST00000438888 SCGB3A1Q96QR1 104 aa8.38□□□□□ -1.07
PRAME-208ENST00000438888 TIMM21Q9BVV7 248 aa8.38□□□□□ -1.07
PRAME-208ENST00000438888 SPANXA1Q9NS26 97 aa8.38□□□□□ -1.07
PRAME-208ENST00000438888 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa8.38□□□□□ -1.07
PRAME-208ENST00000438888 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa8.38□□□□□ -1.07
PRAME-208ENST00000438888 INAFM2P0DMQ5 153 aa8.37□□□□□ -1.07
PRAME-208ENST00000438888 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
PRAME-208ENST00000438888 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
PRAME-208ENST00000438888 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa8.37□□□□□ -1.07
PRAME-208ENST00000438888 HERC1Q15751 4861 aa8.37□□□□□ -1.07
PRAME-208ENST00000438888 A0A087WTM6 91 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-208ENST00000438888 A0A087WX48 190 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-208ENST00000438888 IGIPA6NJ69 53 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-208ENST00000438888 ATP5LO75964 103 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-208ENST00000438888 LEPROTL1O95214 131 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-208ENST00000438888 XGP55808 180 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-208ENST00000438888 KRTAP10-1P60331 282 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-208ENST00000438888 MPV17L2Q567V2 206 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-208ENST00000438888 Q5VSD8 79 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-208ENST00000438888 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-208ENST00000438888 ERASQ7Z444 233 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-208ENST00000438888 NFE4Q86UQ8 179 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-208ENST00000438888 OR5A1Q8NGJ0 315 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-208ENST00000438888 TMEM101Q96IK0 257 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-208ENST00000438888 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
PRAME-208ENST00000438888 TIMM17AQ99595 171 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-208ENST00000438888 HSPB8Q9UJY1 196 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-208ENST00000438888 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
PRAME-208ENST00000438888 FAT1Q14517 4588 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-208ENST00000438888 A0A1B0GUV1 79 aa8.35□□□□□ -1.07
PRAME-208ENST00000438888 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
PRAME-208ENST00000438888 FABP4P15090 132 aa8.35□□□□□ -1.07
PRAME-208ENST00000438888 RBX1P62877 108 aa8.35□□□□□ -1.07
PRAME-208ENST00000438888 HAMPP81172 84 aa8.35□□□□□ -1.07
PRAME-208ENST00000438888 CDPF1Q6NVV7 123 aa8.35□□□□□ -1.07
PRAME-208ENST00000438888 TMEM141Q96I45 108 aa8.35□□□□□ -1.07
PRAME-208ENST00000438888 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa8.34□□□□□ -1.07
PRAME-208ENST00000438888 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
PRAME-208ENST00000438888 NPSP0C0P6 89 aa8.34□□□□□ -1.07
PRAME-208ENST00000438888 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
PRAME-208ENST00000438888 LINC01556Q5JQF7 62 aa8.34□□□□□ -1.07
PRAME-208ENST00000438888 LINC00173Q6ZV60 143 aa8.34□□□□□ -1.07
PRAME-208ENST00000438888 Q8N3U1 123 aa8.34□□□□□ -1.07
PRAME-208ENST00000438888 Q8N976 141 aa8.34□□□□□ -1.07
PRAME-208ENST00000438888 IFI27L1Q96BM0 104 aa8.34□□□□□ -1.07
PRAME-208ENST00000438888 HIST1H2BLQ99880 126 aa8.34□□□□□ -1.07
PRAME-208ENST00000438888 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa8.33□□□□□ -1.08
PRAME-208ENST00000438888 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa8.33□□□□□ -1.08
PRAME-208ENST00000438888 IFITM10A6NMD0 228 aa8.33□□□□□ -1.08
PRAME-208ENST00000438888 IGHV3-30P01768 117 aa8.33□□□□□ -1.08
PRAME-208ENST00000438888 IGHV3-33P01772 117 aa8.33□□□□□ -1.08
PRAME-208ENST00000438888 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa8.33□□□□□ -1.08
PRAME-208ENST00000438888 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa8.33□□□□□ -1.08
PRAME-208ENST00000438888 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa8.33□□□□□ -1.08
PRAME-208ENST00000438888 Q6ZN92 141 aa8.33□□□□□ -1.08
PRAME-208ENST00000438888 Q6ZUT4 128 aa8.33□□□□□ -1.08
PRAME-208ENST00000438888 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
PRAME-208ENST00000438888 ANGP03950 147 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PRAME-208ENST00000438888 ZNF664Q8N3J9 261 aa8.32□□□□□ -1.08
PRAME-208ENST00000438888 FAM104AQ969W3 186 aa8.32□□□□□ -1.08
PRAME-208ENST00000438888 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa8.32□□□□□ -1.08
PRAME-208ENST00000438888 GCSHP23434 173 aa8.31□□□□□ -1.08
PRAME-208ENST00000438888 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PRAME-208ENST00000438888 TEX43Q6ZNM6 134 aa8.31□□□□□ -1.08
PRAME-208ENST00000438888 BAALCQ8WXS3 180 aa8.31□□□□□ -1.08
PRAME-208ENST00000438888 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa8.31□□□□□ -1.08
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