RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423693.5

HDLBP-210, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-210ENST00000423693 CDPF1Q6NVV7 123 aa8.59□□□□□ -1.03
HDLBP-210ENST00000423693 ZNF664Q8N3J9 261 aa8.59□□□□□ -1.03
HDLBP-210ENST00000423693 YPEL4Q96NS1 127 aa8.59□□□□□ -1.03
HDLBP-210ENST00000423693 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
HDLBP-210ENST00000423693 SPANXA1Q9NS26 97 aa8.59□□□□□ -1.03
HDLBP-210ENST00000423693 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa8.59□□□□□ -1.03
HDLBP-210ENST00000423693 CLPSL2Q6UWE3 100 aa8.58□□□□□ -1.04
HDLBP-210ENST00000423693 SPATA12Q7Z6I5 190 aa8.58□□□□□ -1.04
HDLBP-210ENST00000423693 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa8.58□□□□□ -1.04
HDLBP-210ENST00000423693 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
HDLBP-210ENST00000423693 CCL25O15444 150 aa8.57□□□□□ -1.04
HDLBP-210ENST00000423693 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
HDLBP-210ENST00000423693 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa8.57□□□□□ -1.04
HDLBP-210ENST00000423693 Q8N814 137 aa8.57□□□□□ -1.04
HDLBP-210ENST00000423693 LINC01546A6NGU7 62 aa8.56□□□□□ -1.04
HDLBP-210ENST00000423693 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
HDLBP-210ENST00000423693 C14orf177Q52M58 125 aa8.56□□□□□ -1.04
HDLBP-210ENST00000423693 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa8.56□□□□□ -1.04
HDLBP-210ENST00000423693 BAALCQ8WXS3 180 aa8.56□□□□□ -1.04
HDLBP-210ENST00000423693 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa8.56□□□□□ -1.04
HDLBP-210ENST00000423693 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa8.55□□□□□ -1.04
HDLBP-210ENST00000423693 LINC01549A6NIU2 74 aa8.55□□□□□ -1.04
HDLBP-210ENST00000423693 NPSP0C0P6 89 aa8.55□□□□□ -1.04
HDLBP-210ENST00000423693 RPL39P62891 51 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
HDLBP-210ENST00000423693 CBLN2Q8IUK8 224 aa8.55□□□□□ -1.04
HDLBP-210ENST00000423693 CYSLTR1Q9Y271 337 aa8.55□□□□□ -1.04
HDLBP-210ENST00000423693 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
HDLBP-210ENST00000423693 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa8.54□□□□□ -1.04
HDLBP-210ENST00000423693 KRTAP10-2P60368 255 aa8.54□□□□□ -1.04
HDLBP-210ENST00000423693 SS18Q15532 418 aa8.54□□□□□ -1.04
HDLBP-210ENST00000423693 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
HDLBP-210ENST00000423693 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa8.53□□□□□ -1.04
HDLBP-210ENST00000423693 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa8.53□□□□□ -1.04
HDLBP-210ENST00000423693 C16orf90A8MZG2 172 aa8.53□□□□□ -1.04
HDLBP-210ENST00000423693 C1orf196B1AJZ1 125 aa8.53□□□□□ -1.04
HDLBP-210ENST00000423693 C2orf66Q6UXQ4 117 aa8.53□□□□□ -1.04
HDLBP-210ENST00000423693 WFDC2Q14508 124 aa8.52□□□□□ -1.05
HDLBP-210ENST00000423693 CFAP161Q6P656 301 aa8.52□□□□□ -1.05
HDLBP-210ENST00000423693 FA2HQ7L5A8 372 aa8.52□□□□□ -1.05
HDLBP-210ENST00000423693 PKD1P98161 4303 aa8.52□□□□□ -1.05
HDLBP-210ENST00000423693 GAGE12HA6NDE8 117 aa8.51□□□□□ -1.05
HDLBP-210ENST00000423693 USP17L23D6RBM5 183 aa8.51□□□□□ -1.05
HDLBP-210ENST00000423693 LECT2O14960 151 aa8.51□□□□□ -1.05
HDLBP-210ENST00000423693 RAB5BP61020 215 aa8.51□□□□□ -1.05
HDLBP-210ENST00000423693 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa8.51□□□□□ -1.05
HDLBP-210ENST00000423693 CD164L2Q6UWJ8 174 aa8.51□□□□□ -1.05
HDLBP-210ENST00000423693 Q6ZUT4 128 aa8.51□□□□□ -1.05
HDLBP-210ENST00000423693 C18orf32Q8TCD1 76 aa8.51□□□□□ -1.05
HDLBP-210ENST00000423693 FAM104AQ969W3 186 aa8.51□□□□□ -1.05
HDLBP-210ENST00000423693 TOMM6Q96B49 74 aa8.51□□□□□ -1.05
HDLBP-210ENST00000423693 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa8.5□□□□□ -1.05
HDLBP-210ENST00000423693 IGIPA6NJ69 53 aa8.5□□□□□ -1.05
HDLBP-210ENST00000423693 TMEM141Q96I45 108 aa8.5□□□□□ -1.05
HDLBP-210ENST00000423693 AP5S1Q9NUS5 200 aa8.5□□□□□ -1.05
HDLBP-210ENST00000423693 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-210ENST00000423693 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-210ENST00000423693 COLCA2A8K830 154 aa8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-210ENST00000423693 LINC00614P0C842 121 aa8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-210ENST00000423693 XCL1P47992 114 aa8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-210ENST00000423693 FOXI1Q12951 378 aa8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-210ENST00000423693 Q6ZN92 141 aa8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-210ENST00000423693 TIMM17AQ99595 171 aa8.49□□□□□ -1.05
HDLBP-210ENST00000423693 GCSHP23434 173 aa8.48□□□□□ -1.05
HDLBP-210ENST00000423693 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
HDLBP-210ENST00000423693 TEX43Q6ZNM6 134 aa8.48□□□□□ -1.05
HDLBP-210ENST00000423693 ERASQ7Z444 233 aa8.48□□□□□ -1.05
HDLBP-210ENST00000423693 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
HDLBP-210ENST00000423693 IFITM10A6NMD0 228 aa8.47□□□□□ -1.05
HDLBP-210ENST00000423693 PRSS1P07477 247 aa8.47□□□□□ -1.05
HDLBP-210ENST00000423693 AMELXQ99217 191 aa8.47□□□□□ -1.05
HDLBP-210ENST00000423693 C2orf88Q9BSF0 95 aa8.47□□□□□ -1.05
HDLBP-210ENST00000423693 VCX2Q9H322 139 aa8.47□□□□□ -1.05
HDLBP-210ENST00000423693 DNAH11Q96DT5 4516 aa8.46□□□□□ -1.05
HDLBP-210ENST00000423693 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
HDLBP-210ENST00000423693 TRGC2P03986 189 aa8.46□□□□□ -1.06
HDLBP-210ENST00000423693 S100A1P23297 94 aa8.46□□□□□ -1.06
HDLBP-210ENST00000423693 SCGB3A1Q96QR1 104 aa8.46□□□□□ -1.06
HDLBP-210ENST00000423693 BIRC6Q9NR09 4857 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-210ENST00000423693 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-210ENST00000423693 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-210ENST00000423693 hDV102S1A0JD36 115 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-210ENST00000423693 COX7A2LO14548 114 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-210ENST00000423693 CNBPP62633 177 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-210ENST00000423693 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-210ENST00000423693 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa8.45□□□□□ -1.06
HDLBP-210ENST00000423693 CDK2AP2O75956 126 aa8.44□□□□□ -1.06
HDLBP-210ENST00000423693 MALP21145 153 aa8.44□□□□□ -1.06
HDLBP-210ENST00000423693 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP8.44□□□□□ -1.069e-8■□□□□ 11.3
HDLBP-210ENST00000423693 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa8.44□□□□□ -1.06
HDLBP-210ENST00000423693 C15orf56Q8N910 161 aa8.44□□□□□ -1.06
HDLBP-210ENST00000423693 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
HDLBP-210ENST00000423693 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa8.43□□□□□ -1.06
HDLBP-210ENST00000423693 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
HDLBP-210ENST00000423693 SCO1O75880 301 aa8.43□□□□□ -1.06
HDLBP-210ENST00000423693 APOMO95445 188 aa8.43□□□□□ -1.06
HDLBP-210ENST00000423693 HBDP02042 147 aa8.43□□□□□ -1.06
HDLBP-210ENST00000423693 UBE2D1P51668 147 aa8.43□□□□□ -1.06
HDLBP-210ENST00000423693 KRTAP10-1P60331 282 aa8.43□□□□□ -1.06
HDLBP-210ENST00000423693 SEC11AP67812 179 aa8.43□□□□□ -1.06
HDLBP-210ENST00000423693 LINC00242Q5T6M2 205 aa8.43□□□□□ -1.06
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