RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412640.6

SOX9-AS1-201, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 635 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GAGE12FP0CL80 117 aa6.61□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GAGE12GP0CL81 117 aa6.61□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GAGE12IP0CL82 117 aa6.61□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MIFP14174 115 aa6.61□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ODF1Q14990 250 aa6.61□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SPATA45Q537H7 98 aa6.61□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-201ENST00000412640 Q8NAQ8 132 aa6.61□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-201ENST00000412640 C20orf203Q8NBC4 194 aa6.61□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TMEM141Q96I45 108 aa6.61□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SCGB3A1Q96QR1 104 aa6.61□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TIMM17AQ99595 171 aa6.61□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-201ENST00000412640 Q9UF83 564 aa6.61□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RNF213Q63HN8 5207 aa6.61□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa6.6□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TRGV2A0A075B6R0 118 aa6.6□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-201ENST00000412640 A0A087WX48 190 aa6.6□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PRSS1P07477 247 aa6.6□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NPSP0C0P6 89 aa6.6□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FHL2Q14192 279 aa6.6□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-201ENST00000412640 C6orf223Q8N319 242 aa6.6□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SLC25A29Q8N8R3 303 aa6.6□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PRO1933Q9H354 126 aa6.6□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PAM16Q9Y3D7 125 aa6.6□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa6.6□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-201ENST00000412640 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa6.59□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DDTP30046 118 aa6.59□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-201ENST00000412640 UBE2D3P61077 147 aa6.59□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-201ENST00000412640 UBE2D2P62837 147 aa6.59□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-201ENST00000412640 Q6ZN92 141 aa6.59□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ATOH7Q8N100 152 aa6.59□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-201ENST00000412640 BAALCQ8WXS3 180 aa6.59□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LINC00587B1AMM8 73 aa6.58□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-201ENST00000412640 H0Y8G0 127 aa6.58□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LINC00694P0DN24 101 aa6.58□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-201ENST00000412640 IGLC3P0DOY3 106 aa6.58□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CRYBA4P53673 196 aa6.58□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-201ENST00000412640 C12orf74Q32Q52 190 aa6.58□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MAJINQ3KP22 176 aa6.58□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PMCHL2Q9BQD1 86 aa6.58□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MIEN1Q9BRT3 115 aa6.58□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CHCHD7Q9BUK0 85 aa6.58□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DKK2Q9UBU2 259 aa6.58□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CELA1Q9UNI1 258 aa6.58□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa6.57□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-201ENST00000412640 hDV102S1A0JD36 115 aa6.57□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HSBP1L1C9JCN9 74 aa6.57□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-201ENST00000412640 F8VRH5 84 aa6.57□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DPM2O94777 84 aa6.57□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-201ENST00000412640 IGKCP01834 107 aa6.57□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PLNP26678 52 aa6.57□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-201ENST00000412640 EMP1P54849 157 aa6.57□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RPL39P62891 51 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-201ENST00000412640 COTL1Q14019 142 aa6.57□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FAM222AQ5U5X8 452 aa6.57□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZNRF2Q8NHG8 242 aa6.57□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TIMM21Q9BVV7 248 aa6.57□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GTSF1LQ9H1H1 148 aa6.57□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HHLA3Q9XRX5 114 aa6.57□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa6.56□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP6.56□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PMVKQ15126 192 aa6.56□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PRADC1Q9BSG0 188 aa6.56□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CST9LQ9H4G1 147 aa6.56□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SPANXA1Q9NS26 97 aa6.56□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-201ENST00000412640 UQCR10Q9UDW1 63 aa6.56□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-201ENST00000412640 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DEFB130BP0DP73 79 aa6.55□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DEFB130AP0DP74 79 aa6.55□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa6.55□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FAM104AQ969W3 186 aa6.55□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PRO0255Q9UI72 69 aa6.55□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-201ENST00000412640 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GAGE12JA6NER3 117 aa6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FAM229AH3BQW9 127 aa6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-201ENST00000412640 H7C423 109 aa6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SPART-AS1P0CW21 52 aa6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GAGE1Q13065 139 aa6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GAGE4Q13068 117 aa6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GAGE5Q13069 117 aa6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GAGE13Q4V321 117 aa6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ANKRD39Q53RE8 183 aa6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TMEM97Q5BJF2 176 aa6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-201ENST00000412640 AMELXQ99217 191 aa6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-201ENST00000412640 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-201ENST00000412640 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa6.53□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-201ENST00000412640 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa6.53□□□□□ -1.36
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