RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398621.3

PGGT1BP2-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 2, humanhuman

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Gene PGGT1BP2, Length 1,028 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MT-ND6P03923 174 aa10.19□□□□□ -0.78
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMEM18Q96B42 140 aa10.19□□□□□ -0.78
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 REG3AQ06141 175 aa10.18□□□□□ -0.78
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMEM101Q96IK0 257 aa10.18□□□□□ -0.78
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MAP1LC3AQ9H492 121 aa10.18□□□□□ -0.78
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR5A1Q8NGJ0 315 aa10.16□□□□□ -0.78
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SPATA12Q7Z6I5 190 aa10.15□□□□□ -0.78
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa10.15□□□□□ -0.78
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TIMM21Q9BVV7 248 aa10.15□□□□□ -0.78
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa10.13□□□□□ -0.79
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa10.13□□□□□ -0.79
PGGT1BP2-201ENST00000398621 Q8N8P6 123 aa10.13□□□□□ -0.79
PGGT1BP2-201ENST00000398621 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa10.13□□□□□ -0.79
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa10.11□□□□□ -0.79
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa10.1□□□□□ -0.79
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 YPEL4Q96NS1 127 aa10.09□□□□□ -0.79
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 WFDC2Q14508 124 aa10.08□□□□□ -0.8
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 PKHD1P08F94 4074 aa10.07□□□□□ -0.8
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 RPL39P62891 51 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SS18Q15532 418 aa10.07□□□□□ -0.8
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa10.07□□□□□ -0.8
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CYSLTR1Q9Y271 337 aa10.07□□□□□ -0.8
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LINC01549A6NIU2 74 aa10.06□□□□□ -0.8
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C1orf196B1AJZ1 125 aa10.06□□□□□ -0.8
PGGT1BP2-201ENST00000398621 USP17L23D6RBM5 183 aa10.06□□□□□ -0.8
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 LINC01546A6NGU7 62 aa10.05□□□□□ -0.8
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 CBLN2Q8IUK8 224 aa10.05□□□□□ -0.8
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 TOMM6Q96B49 74 aa10.01□□□□□ -0.81
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMEM141Q96I45 108 aa10.01□□□□□ -0.81
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa10□□□□□ -0.81
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IGIPA6NJ69 53 aa10□□□□□ -0.81
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PRSS1P07477 247 aa10□□□□□ -0.81
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RAB5BP61020 215 aa10□□□□□ -0.81
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C18orf32Q8TCD1 76 aa10□□□□□ -0.81
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TIMM17AQ99595 171 aa10□□□□□ -0.81
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DNAH5Q8TE73 4624 aa10□□□□□ -0.81
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IFITM10A6NMD0 228 aa9.99□□□□□ -0.81
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP9.99□□□□□ -0.81
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TEX43Q6ZNM6 134 aa9.99□□□□□ -0.81
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C2orf88Q9BSF0 95 aa9.99□□□□□ -0.81
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa9.98□□□□□ -0.81
PGGT1BP2-201ENST00000398621 COX7A2LO14548 114 aa9.98□□□□□ -0.81
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