RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384664.1

RNU6-1060P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1060, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1060P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1060P-201ENST00000384664 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa-0.97□□□□□ -2.56
RNU6-1060P-201ENST00000384664 COX6B1P14854 86 aa-0.97□□□□□ -2.56
RNU6-1060P-201ENST00000384664 TMEM170BQ5T4T1 132 aa-0.97□□□□□ -2.56
RNU6-1060P-201ENST00000384664 Q6JHZ5 121 aa-0.97□□□□□ -2.56
RNU6-1060P-201ENST00000384664 APC2O95996 2303 aa-0.97□□□□□ -2.56
RNU6-1060P-201ENST00000384664 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP-0.97□□□□□ -2.57
RNU6-1060P-201ENST00000384664 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP-0.97□□□□□ -2.57
RNU6-1060P-201ENST00000384664 SPRR1BP22528 89 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-1060P-201ENST00000384664 C12orf73Q69YU5 71 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-1060P-201ENST00000384664 Q8N8P6 123 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-1060P-201ENST00000384664 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP-0.98□□□□□ -2.57
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RNU6-1060P-201ENST00000384664 RBM3P98179 157 aaKnown RBP-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-1060P-201ENST00000384664 Q6AWC8 147 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-1060P-201ENST00000384664 TTC9CQ8N5M4 171 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-1060P-201ENST00000384664 DEFB123Q8N688 67 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-1060P-201ENST00000384664 PDZD2O15018 2839 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-1060P-201ENST00000384664 UQCR11O14957 56 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-1060P-201ENST00000384664 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP-1□□□□□ -2.57
RNU6-1060P-201ENST00000384664 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP-1.01□□□□□ -2.57
RNU6-1060P-201ENST00000384664 TPPP2P59282 170 aa-1.01□□□□□ -2.57
RNU6-1060P-201ENST00000384664 BAGE2Q86Y30 109 aa-1.01□□□□□ -2.57
RNU6-1060P-201ENST00000384664 COPS9Q8WXC6 57 aa-1.01□□□□□ -2.57
RNU6-1060P-201ENST00000384664 MAFIPQ8WZ33 124 aa-1.01□□□□□ -2.57
RNU6-1060P-201ENST00000384664 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa-1.01□□□□□ -2.57
RNU6-1060P-201ENST00000384664 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa-1.01□□□□□ -2.57
RNU6-1060P-201ENST00000384664 F8VRH5 84 aa-1.02□□□□□ -2.57
RNU6-1060P-201ENST00000384664 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP-1.02□□□□□ -2.57
RNU6-1060P-201ENST00000384664 ACANP16112 2415 aa-1.02□□□□□ -2.57
RNU6-1060P-201ENST00000384664 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa-1.02□□□□□ -2.57
RNU6-1060P-201ENST00000384664 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP-1.02□□□□□ -2.57
RNU6-1060P-201ENST00000384664 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa-1.02□□□□□ -2.57
RNU6-1060P-201ENST00000384664 APOC3P02656 99 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-1060P-201ENST00000384664 PDCD10Q9BUL8 212 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-1060P-201ENST00000384664 RERGLQ9H628 205 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-1060P-201ENST00000384664 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-1060P-201ENST00000384664 GAPVD1Q14C86 1478 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1060P-201ENST00000384664 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1060P-201ENST00000384664 LOC730098B7Z3J9 87 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1060P-201ENST00000384664 PFDN5Q99471 154 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1060P-201ENST00000384664 MGST2Q99735 147 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1060P-201ENST00000384664 DYNLRB1Q9NP97 96 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1060P-201ENST00000384664 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1060P-201ENST00000384664 SERP1Q9Y6X1 66 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1060P-201ENST00000384664 SHANK2Q9UPX8 1470 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1060P-201ENST00000384664 UNC13AQ9UPW8 1703 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1060P-201ENST00000384664 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1060P-201ENST00000384664 IGLC7A0M8Q6 106 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1060P-201ENST00000384664 TNFP01375 233 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1060P-201ENST00000384664 ARPC4P59998 168 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1060P-201ENST00000384664 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1060P-201ENST00000384664 MYOM1P52179 1685 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1060P-201ENST00000384664 TULP4Q9NRJ4 1543 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1060P-201ENST00000384664 PSME4Q14997 1843 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-1060P-201ENST00000384664 SPTA1P02549 2419 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-1060P-201ENST00000384664 BICRAQ9NZM4 1560 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-1060P-201ENST00000384664 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-1060P-201ENST00000384664 SPINK4O60575 86 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-1060P-201ENST00000384664 SHROOM2Q13796 1616 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-1060P-201ENST00000384664 ATRQ13535 2644 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-1060P-201ENST00000384664 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-1060P-201ENST00000384664 PHLPP1O60346 1717 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-1060P-201ENST00000384664 M0R2T5 61 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-1060P-201ENST00000384664 IQSEC2Q5JU85 1478 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-1060P-201ENST00000384664 NSD3Q9BZ95 1437 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-1060P-201ENST00000384664 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-1060P-201ENST00000384664 BTAF1O14981 1849 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-1060P-201ENST00000384664 FOCADQ5VW36 1801 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-1060P-201ENST00000384664 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-1060P-201ENST00000384664 HMGN4O00479 90 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-1060P-201ENST00000384664 SPANXDQ9BXN6 97 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-1060P-201ENST00000384664 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-1060P-201ENST00000384664 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-1060P-201ENST00000384664 CHD8Q9HCK8 2581 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-1060P-201ENST00000384664 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP-1.1□□□□□ -2.59
RNU6-1060P-201ENST00000384664 PPP3R2Q96LZ3 170 aa-1.1□□□□□ -2.59
RNU6-1060P-201ENST00000384664 NAA60Q9H7X0 242 aa-1.1□□□□□ -2.59
RNU6-1060P-201ENST00000384664 ARHGEF5Q12774 1597 aa-1.1□□□□□ -2.59
RNU6-1060P-201ENST00000384664 MYH7P12883 1935 aa-1.11□□□□□ -2.59
RNU6-1060P-201ENST00000384664 SFT2D2O95562 160 aa-1.11□□□□□ -2.59
RNU6-1060P-201ENST00000384664 SELENOWP63302 87 aa-1.11□□□□□ -2.59
RNU6-1060P-201ENST00000384664 BTG2P78543 158 aa-1.11□□□□□ -2.59
RNU6-1060P-201ENST00000384664 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP-1.11□□□□□ -2.59
RNU6-1060P-201ENST00000384664 TSLPQ969D9 159 aa-1.11□□□□□ -2.59
RNU6-1060P-201ENST00000384664 SPRR4Q96PI1 79 aa-1.11□□□□□ -2.59
RNU6-1060P-201ENST00000384664 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP-1.12□□□□□ -2.59
RNU6-1060P-201ENST00000384664 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP-1.12□□□□□ -2.59
RNU6-1060P-201ENST00000384664 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa-1.12□□□□□ -2.59
RNU6-1060P-201ENST00000384664 LINC00470Q9BZP3 86 aa-1.12□□□□□ -2.59
RNU6-1060P-201ENST00000384664 KIAA0556O60303 1618 aa-1.12□□□□□ -2.59
RNU6-1060P-201ENST00000384664 PKHD1P08F94 4074 aa-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-1060P-201ENST00000384664 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-1060P-201ENST00000384664 MGPP08493 103 aa-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-1060P-201ENST00000384664 SPRR2AP35326 72 aa-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-1060P-201ENST00000384664 Q56UQ5 140 aa-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-1060P-201ENST00000384664 MEIG1Q5JSS6 88 aa-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-1060P-201ENST00000384664 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-1060P-201ENST00000384664 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-1060P-201ENST00000384664 SSSCA1O60232 199 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-1060P-201ENST00000384664 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP-1.14□□□□□ -2.59
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