RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384525.1

RNU6-1117P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1117, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1117P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1117P-201ENST00000384525 LINC00312Q9Y6C7 94 aa-5.34□□□□□ -3.26
RNU6-1117P-201ENST00000384525 J3QLW9 94 aa-5.35□□□□□ -3.27
RNU6-1117P-201ENST00000384525 RPS17P08708 135 aaKnown RBP-5.35□□□□□ -3.27
RNU6-1117P-201ENST00000384525 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa-5.35□□□□□ -3.27
RNU6-1117P-201ENST00000384525 ARMC1Q9NVT9 282 aa-5.35□□□□□ -3.27
RNU6-1117P-201ENST00000384525 SS18L2Q9UHA2 77 aa-5.35□□□□□ -3.27
RNU6-1117P-201ENST00000384525 MYH3P11055 1940 aa-5.35□□□□□ -3.27
RNU6-1117P-201ENST00000384525 BPTFQ12830 3046 aa-5.35□□□□□ -3.27
RNU6-1117P-201ENST00000384525 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa-5.35□□□□□ -3.27
RNU6-1117P-201ENST00000384525 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP-5.36□□□□□ -3.27
RNU6-1117P-201ENST00000384525 Q8N8P6 123 aa-5.36□□□□□ -3.27
RNU6-1117P-201ENST00000384525 S4R3F8 94 aa-5.36□□□□□ -3.27
RNU6-1117P-201ENST00000384525 ATMQ13315 3056 aa-5.37□□□□□ -3.27
RNU6-1117P-201ENST00000384525 RPP14O95059 124 aaKnown RBP-5.37□□□□□ -3.27
RNU6-1117P-201ENST00000384525 TCRAP04437 139 aa-5.37□□□□□ -3.27
RNU6-1117P-201ENST00000384525 RPL22P35268 128 aaKnown RBP-5.37□□□□□ -3.27
RNU6-1117P-201ENST00000384525 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa-5.37□□□□□ -3.27
RNU6-1117P-201ENST00000384525 LINC01545Q5VT33 79 aa-5.37□□□□□ -3.27
RNU6-1117P-201ENST00000384525 CRIPTQ9P021 101 aa-5.37□□□□□ -3.27
RNU6-1117P-201ENST00000384525 MAP3K1Q13233 1512 aa-5.38□□□□□ -3.27
RNU6-1117P-201ENST00000384525 LELP1Q5T871 98 aa-5.38□□□□□ -3.27
RNU6-1117P-201ENST00000384525 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa-5.38□□□□□ -3.27
RNU6-1117P-201ENST00000384525 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP-5.38□□□□□ -3.27
RNU6-1117P-201ENST00000384525 E2F6O75461 281 aa-5.39□□□□□ -3.27
RNU6-1117P-201ENST00000384525 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa-5.39□□□□□ -3.27
RNU6-1117P-201ENST00000384525 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa-5.39□□□□□ -3.27
RNU6-1117P-201ENST00000384525 A2MP01023 1474 aa-5.39□□□□□ -3.27
RNU6-1117P-201ENST00000384525 SHANK2Q9UPX8 1470 aa-5.4□□□□□ -3.27
RNU6-1117P-201ENST00000384525 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa-5.41□□□□□ -3.27
RNU6-1117P-201ENST00000384525 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa-5.41□□□□□ -3.28
RNU6-1117P-201ENST00000384525 IFNA17P01571 189 aa-5.41□□□□□ -3.28
RNU6-1117P-201ENST00000384525 ADCY9O60503 1353 aa-5.42□□□□□ -3.28
RNU6-1117P-201ENST00000384525 HSD11B1P28845 292 aa-5.42□□□□□ -3.28
RNU6-1117P-201ENST00000384525 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP-5.42□□□□□ -3.28
RNU6-1117P-201ENST00000384525 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa-5.43□□□□□ -3.28
RNU6-1117P-201ENST00000384525 ATG12O94817 140 aa-5.43□□□□□ -3.28
RNU6-1117P-201ENST00000384525 V9GYH0 126 aa-5.43□□□□□ -3.28
RNU6-1117P-201ENST00000384525 NWD2Q9ULI1 1742 aa-5.43□□□□□ -3.28
RNU6-1117P-201ENST00000384525 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP-5.44□□□□□ -3.28
RNU6-1117P-201ENST00000384525 BAGE2Q86Y30 109 aa-5.44□□□□□ -3.28
RNU6-1117P-201ENST00000384525 WFDC13Q8IUB5 93 aa-5.44□□□□□ -3.28
RNU6-1117P-201ENST00000384525 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa-5.44□□□□□ -3.28
RNU6-1117P-201ENST00000384525 DISP2A7MBM2 1401 aa-5.45□□□□□ -3.28
RNU6-1117P-201ENST00000384525 UBE2G1P62253 170 aa-5.45□□□□□ -3.28
RNU6-1117P-201ENST00000384525 PRAP1Q96NZ9 151 aa-5.45□□□□□ -3.28
RNU6-1117P-201ENST00000384525 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa-5.45□□□□□ -3.28
RNU6-1117P-201ENST00000384525 UQCR11O14957 56 aa-5.46□□□□□ -3.28
RNU6-1117P-201ENST00000384525 RPL7P18124 248 aaKnown RBP-5.46□□□□□ -3.28
RNU6-1117P-201ENST00000384525 DCUN1D2Q6PH85 259 aa-5.46□□□□□ -3.28
RNU6-1117P-201ENST00000384525 BTAF1O14981 1849 aa-5.46□□□□□ -3.28
RNU6-1117P-201ENST00000384525 RBP4P02753 201 aa-5.47□□□□□ -3.29
RNU6-1117P-201ENST00000384525 SPA17Q15506 151 aa-5.47□□□□□ -3.29
RNU6-1117P-201ENST00000384525 SPANXN1Q5VSR9 72 aa-5.47□□□□□ -3.29
RNU6-1117P-201ENST00000384525 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP-5.47□□□□□ -3.29
RNU6-1117P-201ENST00000384525 TMED4Q7Z7H5 227 aa-5.47□□□□□ -3.29
RNU6-1117P-201ENST00000384525 GINS3Q9BRX5 216 aa-5.47□□□□□ -3.29
RNU6-1117P-201ENST00000384525 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa-5.47□□□□□ -3.29
RNU6-1117P-201ENST00000384525 BCORQ6W2J9 1755 aa-5.47□□□□□ -3.29
RNU6-1117P-201ENST00000384525 PSPHP78330 225 aa-5.48□□□□□ -3.29
RNU6-1117P-201ENST00000384525 SPTSSBQ8NFR3 76 aa-5.48□□□□□ -3.29
RNU6-1117P-201ENST00000384525 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa-5.48□□□□□ -3.29
RNU6-1117P-201ENST00000384525 SMIM23A6NLE4 172 aa-5.49□□□□□ -3.29
RNU6-1117P-201ENST00000384525 S100A5P33763 92 aa-5.49□□□□□ -3.29
RNU6-1117P-201ENST00000384525 C10orf113Q5VZT2 155 aa-5.49□□□□□ -3.29
RNU6-1117P-201ENST00000384525 SELENOSQ9BQE4 189 aa-5.49□□□□□ -3.29
RNU6-1117P-201ENST00000384525 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP-5.5□□□□□ -3.29
RNU6-1117P-201ENST00000384525 ERCC6Q03468 1493 aa-5.5□□□□□ -3.29
RNU6-1117P-201ENST00000384525 APOC3P02656 99 aa-5.5□□□□□ -3.29
RNU6-1117P-201ENST00000384525 CCL7P80098 99 aa-5.5□□□□□ -3.29
RNU6-1117P-201ENST00000384525 MED31Q9Y3C7 131 aa-5.5□□□□□ -3.29
RNU6-1117P-201ENST00000384525 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP-5.51□□□□□ -3.29
RNU6-1117P-201ENST00000384525 A6NIN4 97 aa-5.51□□□□□ -3.29
RNU6-1117P-201ENST00000384525 DYDC1Q8WWB3 177 aa-5.51□□□□□ -3.29
RNU6-1117P-201ENST00000384525 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP-5.51□□□□□ -3.29
RNU6-1117P-201ENST00000384525 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa-5.52□□□□□ -3.29
RNU6-1117P-201ENST00000384525 TPPP2P59282 170 aa-5.52□□□□□ -3.29
RNU6-1117P-201ENST00000384525 CLLU1Q5K131 121 aa-5.52□□□□□ -3.29
RNU6-1117P-201ENST00000384525 SCIMPQ6UWF3 145 aa-5.52□□□□□ -3.29
RNU6-1117P-201ENST00000384525 HEPN1Q6WQI6 88 aa-5.52□□□□□ -3.29
RNU6-1117P-201ENST00000384525 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP-5.52□□□□□ -3.29
RNU6-1117P-201ENST00000384525 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP-5.52□□□□□ -3.29
RNU6-1117P-201ENST00000384525 LENEPQ9Y5L5 61 aa-5.52□□□□□ -3.29
RNU6-1117P-201ENST00000384525 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP-5.52□□□□□ -3.29
RNU6-1117P-201ENST00000384525 I3L3M4 83 aa-5.53□□□□□ -3.29
RNU6-1117P-201ENST00000384525 YPEL1O60688 119 aa-5.53□□□□□ -3.29
RNU6-1117P-201ENST00000384525 CCL8P80075 99 aa-5.53□□□□□ -3.29
RNU6-1117P-201ENST00000384525 BTG2P78543 158 aa-5.54□□□□□ -3.3
RNU6-1117P-201ENST00000384525 AKAP14Q86UN6 197 aa-5.54□□□□□ -3.3
RNU6-1117P-201ENST00000384525 FAM24BQ8N5W8 94 aa-5.54□□□□□ -3.3
RNU6-1117P-201ENST00000384525 OR13C6PQ8NH95 151 aa-5.54□□□□□ -3.3
RNU6-1117P-201ENST00000384525 A0A0G2JMZ2 1700 aa-5.54□□□□□ -3.3
RNU6-1117P-201ENST00000384525 DOCK2Q92608 1830 aa-5.55□□□□□ -3.3
RNU6-1117P-201ENST00000384525 E7EQ34 232 aa-5.55□□□□□ -3.3
RNU6-1117P-201ENST00000384525 CEBPGP53567 150 aa-5.55□□□□□ -3.3
RNU6-1117P-201ENST00000384525 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa-5.55□□□□□ -3.3
RNU6-1117P-201ENST00000384525 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa-5.55□□□□□ -3.3
RNU6-1117P-201ENST00000384525 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP-5.55□□□□□ -3.3
RNU6-1117P-201ENST00000384525 MYH13Q9UKX3 1938 aa-5.56□□□□□ -3.3
RNU6-1117P-201ENST00000384525 HLA-DRB4P13762 266 aa-5.56□□□□□ -3.3
RNU6-1117P-201ENST00000384525 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa-5.56□□□□□ -3.3
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