RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000381565.2

APOBEC3F-202, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3F, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC3F, Length 616 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3F-202ENST00000381565 PPP1R2P9O14990 202 aa7.52□□□□□ -1.21
APOBEC3F-202ENST00000381565 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
APOBEC3F-202ENST00000381565 Q6ZSA8 131 aa7.52□□□□□ -1.21
APOBEC3F-202ENST00000381565 UBR4Q5T4S7 5183 aa7.51□□□□□ -1.21
APOBEC3F-202ENST00000381565 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa7.51□□□□□ -1.21
APOBEC3F-202ENST00000381565 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa7.51□□□□□ -1.21
APOBEC3F-202ENST00000381565 D6R8Y8 96 aa7.51□□□□□ -1.21
APOBEC3F-202ENST00000381565 PRSS1P07477 247 aa7.51□□□□□ -1.21
APOBEC3F-202ENST00000381565 UQCC3Q6UW78 93 aa7.51□□□□□ -1.21
APOBEC3F-202ENST00000381565 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa7.51□□□□□ -1.21
APOBEC3F-202ENST00000381565 TMEM218A2RU14 115 aa7.5□□□□□ -1.21
APOBEC3F-202ENST00000381565 LINC00862A6NCI5 91 aa7.5□□□□□ -1.21
APOBEC3F-202ENST00000381565 PPP1R17O96001 155 aa7.5□□□□□ -1.21
APOBEC3F-202ENST00000381565 MT-ND4LP03901 98 aa7.5□□□□□ -1.21
APOBEC3F-202ENST00000381565 S100A8P05109 93 aa7.5□□□□□ -1.21
APOBEC3F-202ENST00000381565 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
APOBEC3F-202ENST00000381565 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa7.5□□□□□ -1.21
APOBEC3F-202ENST00000381565 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
APOBEC3F-202ENST00000381565 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
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APOBEC3F-202ENST00000381565 C7orf77A4D0Y5 90 aa7.49□□□□□ -1.21
APOBEC3F-202ENST00000381565 F8W036 122 aa7.49□□□□□ -1.21
APOBEC3F-202ENST00000381565 VCYO14598 125 aa7.49□□□□□ -1.21
APOBEC3F-202ENST00000381565 TNFRSF6BO95407 300 aa7.49□□□□□ -1.21
APOBEC3F-202ENST00000381565 NPYP01303 97 aa7.49□□□□□ -1.21
APOBEC3F-202ENST00000381565 CKS2P33552 79 aa7.49□□□□□ -1.21
APOBEC3F-202ENST00000381565 RPL32P62910 135 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
APOBEC3F-202ENST00000381565 C14orf177Q52M58 125 aa7.49□□□□□ -1.21
APOBEC3F-202ENST00000381565 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
APOBEC3F-202ENST00000381565 COMMD7Q86VX2 200 aa7.49□□□□□ -1.21
APOBEC3F-202ENST00000381565 C20orf78Q9BR46 151 aa7.49□□□□□ -1.21
APOBEC3F-202ENST00000381565 C15orf56Q8N910 161 aa7.48□□□□□ -1.21
APOBEC3F-202ENST00000381565 OR5A1Q8NGJ0 315 aa7.48□□□□□ -1.21
APOBEC3F-202ENST00000381565 SMIM2Q9BVW6 85 aa7.48□□□□□ -1.21
APOBEC3F-202ENST00000381565 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
APOBEC3F-202ENST00000381565 GAGE12HA6NDE8 117 aa7.47□□□□□ -1.21
APOBEC3F-202ENST00000381565 FCER1GP30273 86 aa7.47□□□□□ -1.21
APOBEC3F-202ENST00000381565 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
APOBEC3F-202ENST00000381565 SEC11CQ9BY50 192 aa7.47□□□□□ -1.21
APOBEC3F-202ENST00000381565 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa7.47□□□□□ -1.21
APOBEC3F-202ENST00000381565 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa7.47□□□□□ -1.21
APOBEC3F-202ENST00000381565 PHOX2AO14813 284 aa7.46□□□□□ -1.22
APOBEC3F-202ENST00000381565 PPBPP02775 128 aa7.46□□□□□ -1.22
APOBEC3F-202ENST00000381565 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
APOBEC3F-202ENST00000381565 ORMDL3Q8N138 153 aa7.46□□□□□ -1.22
APOBEC3F-202ENST00000381565 TMEM101Q96IK0 257 aa7.46□□□□□ -1.22
APOBEC3F-202ENST00000381565 BTF3L4Q96K17 158 aa7.46□□□□□ -1.22
APOBEC3F-202ENST00000381565 KIR2DL4Q99706 377 aa7.46□□□□□ -1.22
APOBEC3F-202ENST00000381565 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
APOBEC3F-202ENST00000381565 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa7.45□□□□□ -1.22
APOBEC3F-202ENST00000381565 SLPIP03973 132 aa7.45□□□□□ -1.22
APOBEC3F-202ENST00000381565 FOXI1Q12951 378 aa7.45□□□□□ -1.22
APOBEC3F-202ENST00000381565 C10orf91Q5T1B1 145 aa7.45□□□□□ -1.22
APOBEC3F-202ENST00000381565 Q6ZUT4 128 aa7.45□□□□□ -1.22
APOBEC3F-202ENST00000381565 ZNF664Q8N3J9 261 aa7.45□□□□□ -1.22
APOBEC3F-202ENST00000381565 FAM104AQ969W3 186 aa7.45□□□□□ -1.22
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APOBEC3F-202ENST00000381565 hDV102S1A0JD36 115 aa7.44□□□□□ -1.22
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APOBEC3F-202ENST00000381565 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
APOBEC3F-202ENST00000381565 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa7.44□□□□□ -1.22
APOBEC3F-202ENST00000381565 TMEM136Q6ZRR5 245 aa7.44□□□□□ -1.22
APOBEC3F-202ENST00000381565 SCXQ7RTU7 201 aa7.44□□□□□ -1.22
APOBEC3F-202ENST00000381565 C9orf163Q8N9P6 203 aa7.44□□□□□ -1.22
APOBEC3F-202ENST00000381565 CLRN3Q8NCR9 226 aa7.44□□□□□ -1.22
APOBEC3F-202ENST00000381565 IMMP2LQ96T52 175 aa7.44□□□□□ -1.22
APOBEC3F-202ENST00000381565 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
APOBEC3F-202ENST00000381565 FAT3Q8TDW7 4589 aa7.43□□□□□ -1.22
APOBEC3F-202ENST00000381565 CCL25O15444 150 aa7.43□□□□□ -1.22
APOBEC3F-202ENST00000381565 XCL1P47992 114 aa7.43□□□□□ -1.22
APOBEC3F-202ENST00000381565 TIMM21Q9BVV7 248 aa7.43□□□□□ -1.22
APOBEC3F-202ENST00000381565 CTDSP1Q9GZU7 261 aa7.43□□□□□ -1.22
APOBEC3F-202ENST00000381565 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
APOBEC3F-202ENST00000381565 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa7.43□□□□□ -1.22
APOBEC3F-202ENST00000381565 PRSS47A8MTI9 375 aa7.42□□□□□ -1.22
APOBEC3F-202ENST00000381565 PANO1I0J062 215 aa7.42□□□□□ -1.22
APOBEC3F-202ENST00000381565 HIGD2BQ4VC39 106 aa7.42□□□□□ -1.22
APOBEC3F-202ENST00000381565 CHAC1Q9BUX1 264 aa7.42□□□□□ -1.22
APOBEC3F-202ENST00000381565 CDIP1Q9H305 208 aa7.42□□□□□ -1.22
APOBEC3F-202ENST00000381565 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa7.42□□□□□ -1.22
APOBEC3F-202ENST00000381565 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa7.41□□□□□ -1.22
APOBEC3F-202ENST00000381565 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
APOBEC3F-202ENST00000381565 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa7.41□□□□□ -1.22
APOBEC3F-202ENST00000381565 SS18Q15532 418 aa7.4□□□□□ -1.22
APOBEC3F-202ENST00000381565 CD164L2Q6UWJ8 174 aa7.4□□□□□ -1.22
APOBEC3F-202ENST00000381565 SDIM1Q6ZPB5 146 aa7.4□□□□□ -1.22
APOBEC3F-202ENST00000381565 TMEM18Q96B42 140 aa7.4□□□□□ -1.22
APOBEC3F-202ENST00000381565 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
APOBEC3F-202ENST00000381565 SPANXA1Q9NS26 97 aa7.4□□□□□ -1.22
APOBEC3F-202ENST00000381565 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa7.39□□□□□ -1.23
APOBEC3F-202ENST00000381565 SMAGPQ0VAQ4 97 aa7.39□□□□□ -1.23
APOBEC3F-202ENST00000381565 MAP1LC3AQ9H492 121 aa7.39□□□□□ -1.23
APOBEC3F-202ENST00000381565 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa7.38□□□□□ -1.23
APOBEC3F-202ENST00000381565 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
APOBEC3F-202ENST00000381565 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
APOBEC3F-202ENST00000381565 RHEBQ15382 184 aa7.38□□□□□ -1.23
APOBEC3F-202ENST00000381565 CFAP161Q6P656 301 aa7.38□□□□□ -1.23
APOBEC3F-202ENST00000381565 Q8N8P6 123 aa7.38□□□□□ -1.23
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