RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368078.7

CASQ1-201, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CASQ1, Length 1,897 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-201ENST00000368078 A0A0J9YXV3 536 aa10.69□□□□□ -0.7
CASQ1-201ENST00000368078 NMUP48645 174 aa10.69□□□□□ -0.7
CASQ1-201ENST00000368078 TMEM243Q9BU79 118 aa10.69□□□□□ -0.7
CASQ1-201ENST00000368078 TTTY13Q9BZ97 58 aa10.69□□□□□ -0.7
CASQ1-201ENST00000368078 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa10.68□□□□□ -0.7
CASQ1-201ENST00000368078 GAGE6Q13070 117 aa10.68□□□□□ -0.7
CASQ1-201ENST00000368078 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa10.68□□□□□ -0.7
CASQ1-201ENST00000368078 PCP2Q8IVA1 136 aa10.68□□□□□ -0.7
CASQ1-201ENST00000368078 TM2D3Q9BRN9 247 aa10.68□□□□□ -0.7
CASQ1-201ENST00000368078 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
CASQ1-201ENST00000368078 COX8AP10176 69 aa10.68□□□□□ -0.7
CASQ1-201ENST00000368078 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
CASQ1-201ENST00000368078 Q6ZTC4 211 aa10.68□□□□□ -0.7
CASQ1-201ENST00000368078 UBE2L6O14933 153 aa10.67□□□□□ -0.7
CASQ1-201ENST00000368078 SPATA25Q9BR10 227 aa10.67□□□□□ -0.7
CASQ1-201ENST00000368078 DEFA6Q01524 100 aa10.66□□□□□ -0.7
CASQ1-201ENST00000368078 SLC25A34Q6PIV7 304 aa10.66□□□□□ -0.7
CASQ1-201ENST00000368078 TIMM21Q9BVV7 248 aa10.66□□□□□ -0.7
CASQ1-201ENST00000368078 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa10.66□□□□□ -0.7
CASQ1-201ENST00000368078 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa10.66□□□□□ -0.7
CASQ1-201ENST00000368078 CHCHD5Q9BSY4 110 aa10.66□□□□□ -0.7
CASQ1-201ENST00000368078 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
CASQ1-201ENST00000368078 TMEM170BQ5T4T1 132 aa10.65□□□□□ -0.7
CASQ1-201ENST00000368078 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
CASQ1-201ENST00000368078 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa10.65□□□□□ -0.7
CASQ1-201ENST00000368078 NPSP0C0P6 89 aa10.64□□□□□ -0.71
CASQ1-201ENST00000368078 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
CASQ1-201ENST00000368078 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa10.64□□□□□ -0.71
CASQ1-201ENST00000368078 NFE4Q86UQ8 179 aa10.64□□□□□ -0.71
CASQ1-201ENST00000368078 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa10.64□□□□□ -0.71
CASQ1-201ENST00000368078 C11orf45Q8TAV5 145 aa10.64□□□□□ -0.71
CASQ1-201ENST00000368078 CHAC1Q9BUX1 264 aa10.64□□□□□ -0.71
CASQ1-201ENST00000368078 COL7A1Q02388 2944 aa10.64□□□□□ -0.71
CASQ1-201ENST00000368078 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa10.64□□□□□ -0.71
CASQ1-201ENST00000368078 BOD1L2Q8IYS8 172 aa10.64□□□□□ -0.71
CASQ1-201ENST00000368078 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
CASQ1-201ENST00000368078 OR5A1Q8NGJ0 315 aa10.63□□□□□ -0.71
CASQ1-201ENST00000368078 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa10.62□□□□□ -0.71
CASQ1-201ENST00000368078 UBE2D1P51668 147 aa10.62□□□□□ -0.71
CASQ1-201ENST00000368078 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
CASQ1-201ENST00000368078 TMEM262E9PQX1 116 aa10.61□□□□□ -0.71
CASQ1-201ENST00000368078 H7C423 109 aa10.61□□□□□ -0.71
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
CASQ1-201ENST00000368078 COX6A2Q02221 97 aa10.61□□□□□ -0.71
CASQ1-201ENST00000368078 TMEM97Q5BJF2 176 aa10.61□□□□□ -0.71
CASQ1-201ENST00000368078 TMEM101Q96IK0 257 aa10.61□□□□□ -0.71
CASQ1-201ENST00000368078 C2orf91Q6ZV80 131 aa10.61□□□□□ -0.71
CASQ1-201ENST00000368078 C2orf88Q9BSF0 95 aa10.61□□□□□ -0.71
CASQ1-201ENST00000368078 ICOSQ9Y6W8 199 aa10.61□□□□□ -0.71
CASQ1-201ENST00000368078 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa10.6□□□□□ -0.71
CASQ1-201ENST00000368078 SNHG12Q9BXW3 62 aa10.6□□□□□ -0.71
CASQ1-201ENST00000368078 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa10.59□□□□□ -0.71
CASQ1-201ENST00000368078 E9PLD3 99 aa10.59□□□□□ -0.71
CASQ1-201ENST00000368078 EREGO14944 169 aa10.59□□□□□ -0.71
CASQ1-201ENST00000368078 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
CASQ1-201ENST00000368078 Q8N3U1 123 aa10.59□□□□□ -0.71
CASQ1-201ENST00000368078 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa10.59□□□□□ -0.71
CASQ1-201ENST00000368078 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa10.59□□□□□ -0.71
CASQ1-201ENST00000368078 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa10.59□□□□□ -0.71
CASQ1-201ENST00000368078 TMEM223A0PJW6 202 aa10.59□□□□□ -0.71
CASQ1-201ENST00000368078 MPV17L2Q567V2 206 aa10.59□□□□□ -0.71
CASQ1-201ENST00000368078 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
CASQ1-201ENST00000368078 SMAGPQ0VAQ4 97 aa10.58□□□□□ -0.72
CASQ1-201ENST00000368078 LINC00242Q5T6M2 205 aa10.58□□□□□ -0.72
CASQ1-201ENST00000368078 DLEU1O43261 78 aa10.57□□□□□ -0.72
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
CASQ1-201ENST00000368078 TSPEAR-AS2P59090 65 aa10.57□□□□□ -0.72
CASQ1-201ENST00000368078 LYPD5Q6UWN5 251 aa10.57□□□□□ -0.72
CASQ1-201ENST00000368078 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
CASQ1-201ENST00000368078 RBX1P62877 108 aa10.57□□□□□ -0.72
CASQ1-201ENST00000368078 BATFQ16520 125 aa10.57□□□□□ -0.72
CASQ1-201ENST00000368078 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa10.57□□□□□ -0.72
CASQ1-201ENST00000368078 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa10.56□□□□□ -0.72
CASQ1-201ENST00000368078 M0R143 59 aa10.56□□□□□ -0.72
CASQ1-201ENST00000368078 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP10.56□□□□□ -0.72
CASQ1-201ENST00000368078 TIRAPP58753 221 aa10.55□□□□□ -0.72
CASQ1-201ENST00000368078 HERVK_113P61574 105 aa10.55□□□□□ -0.72
CASQ1-201ENST00000368078 SPINK8P0C7L1 97 aa10.55□□□□□ -0.72
CASQ1-201ENST00000368078 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
CASQ1-201ENST00000368078 A0A1B0GUV1 79 aa10.54□□□□□ -0.72
CASQ1-201ENST00000368078 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa10.54□□□□□ -0.72
CASQ1-201ENST00000368078 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa10.53□□□□□ -0.72
CASQ1-201ENST00000368078 H3BNG1 76 aa10.53□□□□□ -0.72
CASQ1-201ENST00000368078 LELP1Q5T871 98 aa10.53□□□□□ -0.72
CASQ1-201ENST00000368078 CLPSL2Q6UWE3 100 aa10.53□□□□□ -0.72
CASQ1-201ENST00000368078 SH2D6Q7Z4S9 175 aa10.53□□□□□ -0.72
CASQ1-201ENST00000368078 LEPROTO15243 131 aa10.53□□□□□ -0.72
CASQ1-201ENST00000368078 SIVA1O15304 175 aa10.53□□□□□ -0.72
CASQ1-201ENST00000368078 PLEKHB2Q96CS7 222 aa10.53□□□□□ -0.72
CASQ1-201ENST00000368078 B9D2Q9BPU9 175 aa10.53□□□□□ -0.72
CASQ1-201ENST00000368078 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa10.52□□□□□ -0.73
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF815PA8K554 130 aa10.52□□□□□ -0.73
CASQ1-201ENST00000368078 J3QQQ9 107 aa10.52□□□□□ -0.73
CASQ1-201ENST00000368078 ESRGQ1W209 222 aa10.52□□□□□ -0.73
CASQ1-201ENST00000368078 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa10.51□□□□□ -0.73
CASQ1-201ENST00000368078 HERVK_113P63121 156 aa10.51□□□□□ -0.73
CASQ1-201ENST00000368078 TRAV10A0A0B4J240 114 aa10.51□□□□□ -0.73
CASQ1-201ENST00000368078 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa10.51□□□□□ -0.73
CASQ1-201ENST00000368078 LINC00269Q8N2A0 174 aa10.51□□□□□ -0.73
CASQ1-201ENST00000368078 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.7 ms