RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa5.07□□□□□ -1.6
SGMS1-201ENST00000361543 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
SGMS1-201ENST00000361543 HLA-DQA1P01909 254 aa5.07□□□□□ -1.6
SGMS1-201ENST00000361543 CRPP02741 224 aa5.07□□□□□ -1.6
SGMS1-201ENST00000361543 FCER1GP30273 86 aa5.07□□□□□ -1.6
SGMS1-201ENST00000361543 XGP55808 180 aa5.07□□□□□ -1.6
SGMS1-201ENST00000361543 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
SGMS1-201ENST00000361543 MPV17L2Q567V2 206 aa5.07□□□□□ -1.6
SGMS1-201ENST00000361543 XP32Q5T750 250 aa5.07□□□□□ -1.6
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM18Q96B42 140 aa5.07□□□□□ -1.6
SGMS1-201ENST00000361543 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM70Q9BUB7 260 aa5.07□□□□□ -1.6
SGMS1-201ENST00000361543 A0A1B0GUV1 79 aa5.06□□□□□ -1.6
SGMS1-201ENST00000361543 EPM2AB3EWF7 344 aa5.06□□□□□ -1.6
SGMS1-201ENST00000361543 D6R8Y8 96 aa5.06□□□□□ -1.6
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
SGMS1-201ENST00000361543 G0S2P27469 103 aa5.06□□□□□ -1.6
SGMS1-201ENST00000361543 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa5.06□□□□□ -1.6
SGMS1-201ENST00000361543 ATRAIDQ6UW56 229 aa5.06□□□□□ -1.6
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM136Q6ZRR5 245 aa5.06□□□□□ -1.6
SGMS1-201ENST00000361543 BAALCQ8WXS3 180 aa5.06□□□□□ -1.6
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM101Q96IK0 257 aa5.06□□□□□ -1.6
SGMS1-201ENST00000361543 GNB1LQ9BYB4 327 aa5.06□□□□□ -1.6
SGMS1-201ENST00000361543 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
SGMS1-201ENST00000361543 K7EMI3 77 aa5.05□□□□□ -1.6
SGMS1-201ENST00000361543 TNFRSF6BO95407 300 aa5.05□□□□□ -1.6
SGMS1-201ENST00000361543 ANGP03950 147 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
SGMS1-201ENST00000361543 RAB5AP20339 215 aa5.05□□□□□ -1.6
SGMS1-201ENST00000361543 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
SGMS1-201ENST00000361543 HAMPP81172 84 aa5.05□□□□□ -1.6
SGMS1-201ENST00000361543 MIAQ16674 131 aa5.05□□□□□ -1.6
SGMS1-201ENST00000361543 Q5VSD8 79 aa5.05□□□□□ -1.6
SGMS1-201ENST00000361543 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa5.05□□□□□ -1.6
SGMS1-201ENST00000361543 NRACQ8N912 160 aa5.05□□□□□ -1.6
SGMS1-201ENST00000361543 Q8N976 141 aa5.05□□□□□ -1.6
SGMS1-201ENST00000361543 PRELID3AQ96N28 172 aa5.05□□□□□ -1.6
SGMS1-201ENST00000361543 C1orf43Q9BWL3 253 aa5.05□□□□□ -1.6
SGMS1-201ENST00000361543 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa5.05□□□□□ -1.6
SGMS1-201ENST00000361543 MAP1LC3AQ9H492 121 aa5.05□□□□□ -1.6
SGMS1-201ENST00000361543 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
SGMS1-201ENST00000361543 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa5.04□□□□□ -1.6
SGMS1-201ENST00000361543 RPS10P46783 165 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
SGMS1-201ENST00000361543 RBX1P62877 108 aa5.04□□□□□ -1.6
SGMS1-201ENST00000361543 GAGE6Q13070 117 aa5.04□□□□□ -1.6
SGMS1-201ENST00000361543 ENHOQ6UWT2 76 aa5.04□□□□□ -1.6
SGMS1-201ENST00000361543 SMIM2Q9BVW6 85 aa5.04□□□□□ -1.6
SGMS1-201ENST00000361543 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa5.03□□□□□ -1.6
SGMS1-201ENST00000361543 LINC01549A6NIU2 74 aa5.03□□□□□ -1.6
SGMS1-201ENST00000361543 SMKR1H3BMG3 65 aa5.03□□□□□ -1.6
SGMS1-201ENST00000361543 TSHBP01222 138 aa5.03□□□□□ -1.6
SGMS1-201ENST00000361543 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
SGMS1-201ENST00000361543 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa5.03□□□□□ -1.6
SGMS1-201ENST00000361543 CLPSL2Q6UWE3 100 aa5.03□□□□□ -1.6
SGMS1-201ENST00000361543 OR5A1Q8NGJ0 315 aa5.03□□□□□ -1.6
SGMS1-201ENST00000361543 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
SGMS1-201ENST00000361543 SMCO4Q9NRQ5 59 aa5.03□□□□□ -1.6
SGMS1-201ENST00000361543 PRSS47A8MTI9 375 aa5.02□□□□□ -1.61
SGMS1-201ENST00000361543 CCL25O15444 150 aa5.02□□□□□ -1.61
SGMS1-201ENST00000361543 FGF6P10767 208 aa5.02□□□□□ -1.61
SGMS1-201ENST00000361543 ESDP10768 282 aa5.02□□□□□ -1.61
SGMS1-201ENST00000361543 LINC01620Q4KN68 170 aa5.02□□□□□ -1.61
SGMS1-201ENST00000361543 C14orf177Q52M58 125 aa5.02□□□□□ -1.61
SGMS1-201ENST00000361543 ORMDL2Q53FV1 153 aa5.02□□□□□ -1.61
SGMS1-201ENST00000361543 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
SGMS1-201ENST00000361543 Q6ZSA8 131 aa5.02□□□□□ -1.61
SGMS1-201ENST00000361543 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
SGMS1-201ENST00000361543 LINC00269Q8N2A0 174 aa5.02□□□□□ -1.61
SGMS1-201ENST00000361543 PRR34Q9NV39 138 aa5.02□□□□□ -1.61
SGMS1-201ENST00000361543 FAM30AQ9NZY2 134 aa5.02□□□□□ -1.61
SGMS1-201ENST00000361543 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
SGMS1-201ENST00000361543 USP17L23D6RBM5 183 aa5.01□□□□□ -1.61
SGMS1-201ENST00000361543 GAS8-AS1O95177 125 aa5.01□□□□□ -1.61
SGMS1-201ENST00000361543 NPYP01303 97 aa5.01□□□□□ -1.61
SGMS1-201ENST00000361543 REG3AQ06141 175 aa5.01□□□□□ -1.61
SGMS1-201ENST00000361543 FABP9Q0Z7S8 132 aa5.01□□□□□ -1.61
SGMS1-201ENST00000361543 Q8N8P6 123 aa5.01□□□□□ -1.61
SGMS1-201ENST00000361543 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa5.01□□□□□ -1.61
SGMS1-201ENST00000361543 YPEL4Q96NS1 127 aa5.01□□□□□ -1.61
SGMS1-201ENST00000361543 TIMM21Q9BVV7 248 aa5.01□□□□□ -1.61
SGMS1-201ENST00000361543 SPANXA1Q9NS26 97 aa5.01□□□□□ -1.61
SGMS1-201ENST00000361543 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa5□□□□□ -1.61
SGMS1-201ENST00000361543 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa5□□□□□ -1.61
SGMS1-201ENST00000361543 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
SGMS1-201ENST00000361543 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
SGMS1-201ENST00000361543 NPSP0C0P6 89 aa5□□□□□ -1.61
SGMS1-201ENST00000361543 INAFM2P0DMQ5 153 aa5□□□□□ -1.61
SGMS1-201ENST00000361543 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa5□□□□□ -1.61
SGMS1-201ENST00000361543 C20orf203Q8NBC4 194 aa5□□□□□ -1.61
SGMS1-201ENST00000361543 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa5□□□□□ -1.61
SGMS1-201ENST00000361543 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
SGMS1-201ENST00000361543 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa4.99□□□□□ -1.61
SGMS1-201ENST00000361543 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
SGMS1-201ENST00000361543 RAB5BP61020 215 aa4.99□□□□□ -1.61
SGMS1-201ENST00000361543 CFAP161Q6P656 301 aa4.99□□□□□ -1.61
SGMS1-201ENST00000361543 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa4.99□□□□□ -1.61
SGMS1-201ENST00000361543 SCXQ7RTU7 201 aa4.99□□□□□ -1.61
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF664Q8N3J9 261 aa4.99□□□□□ -1.61
SGMS1-201ENST00000361543 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa4.99□□□□□ -1.61
SGMS1-201ENST00000361543 CYSLTR1Q9Y271 337 aa4.99□□□□□ -1.61
SGMS1-201ENST00000361543 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa4.98□□□□□ -1.61
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