RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345512.7

PTPRU-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 4,470 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-201ENST00000345512 Q6ZTI0 123 aa11.43□□□□□ -0.58
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PTPRU-201ENST00000345512 Q9HAA7 133 aa11.43□□□□□ -0.58
PTPRU-201ENST00000345512 FN1P02751 2386 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
PTPRU-201ENST00000345512 TRAV4A0A0B4J268 109 aa11.43□□□□□ -0.58
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PTPRU-201ENST00000345512 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa11.43□□□□□ -0.58
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PTPRU-201ENST00000345512 TRAV25A0A0B4J276 109 aa11.36□□□□□ -0.59
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PTPRU-201ENST00000345512 FAM19A4Q96LR4 140 aa11.33□□□□□ -0.6
PTPRU-201ENST00000345512 C14orf132Q9NPU4 83 aa11.33□□□□□ -0.6
PTPRU-201ENST00000345512 NDUFA7O95182 113 aa11.32□□□□□ -0.6
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PTPRU-201ENST00000345512 IGHV4-31P0DP07 118 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRU-201ENST00000345512 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
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PTPRU-201ENST00000345512 TRACP01848 142 aa11.31□□□□□ -0.6
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PTPRU-201ENST00000345512 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa11.26□□□□□ -0.61
PTPRU-201ENST00000345512 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa11.25□□□□□ -0.61
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PTPRU-201ENST00000345512 LINC00694P0DN24 101 aa11.25□□□□□ -0.61
PTPRU-201ENST00000345512 KLK9Q2XQG4 91 aa11.25□□□□□ -0.61
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PTPRU-201ENST00000345512 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa11.25□□□□□ -0.61
PTPRU-201ENST00000345512 SDIM1Q6ZPB5 146 aa11.25□□□□□ -0.61
PTPRU-201ENST00000345512 ZNF292O60281 2723 aa11.24□□□□□ -0.61
PTPRU-201ENST00000345512 DSCR8Q96T75 97 aa11.24□□□□□ -0.61
PTPRU-201ENST00000345512 SMIM1B2RUZ4 78 aa11.24□□□□□ -0.61
PTPRU-201ENST00000345512 DEFB4AO15263 64 aa11.24□□□□□ -0.61
PTPRU-201ENST00000345512 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
PTPRU-201ENST00000345512 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa11.23□□□□□ -0.61
PTPRU-201ENST00000345512 WFDC10AQ9H1F0 79 aa11.23□□□□□ -0.61
PTPRU-201ENST00000345512 ZNF575Q86XF7 245 aa11.23□□□□□ -0.61
PTPRU-201ENST00000345512 ODF3L2Q3SX64 289 aa11.23□□□□□ -0.61
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