RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318129.5

GINS3-201, Transcript of GINS complex subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS3, Length 2,274 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3-201ENST00000318129 C2orf66Q6UXQ4 117 aa7.45□□□□□ -1.22
GINS3-201ENST00000318129 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
GINS3-201ENST00000318129 SPXQ9BT56 116 aa7.45□□□□□ -1.22
GINS3-201ENST00000318129 C11orf21Q9P2W6 132 aa7.45□□□□□ -1.22
GINS3-201ENST00000318129 A4D1N5 150 aa7.44□□□□□ -1.22
GINS3-201ENST00000318129 C11orf86A6NJI1 115 aa7.44□□□□□ -1.22
GINS3-201ENST00000318129 H3BMM0 161 aa7.44□□□□□ -1.22
GINS3-201ENST00000318129 DEFB1P60022 68 aa7.44□□□□□ -1.22
GINS3-201ENST00000318129 ODF3L2Q3SX64 289 aa7.44□□□□□ -1.22
GINS3-201ENST00000318129 SPATA3Q8NHX4 192 aa7.44□□□□□ -1.22
GINS3-201ENST00000318129 UBE2WQ96B02 151 aa7.44□□□□□ -1.22
GINS3-201ENST00000318129 FAM19A4Q96LR4 140 aa7.44□□□□□ -1.22
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GINS3-201ENST00000318129 AMELXQ99217 191 aa7.44□□□□□ -1.22
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GINS3-201ENST00000318129 A0A0B4J2C4 111 aa7.43□□□□□ -1.22
GINS3-201ENST00000318129 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa7.43□□□□□ -1.22
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GINS3-201ENST00000318129 ZNF56Q15929 161 aa7.43□□□□□ -1.22
GINS3-201ENST00000318129 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa7.42□□□□□ -1.22
GINS3-201ENST00000318129 APRG1Q8IVJ8 170 aa7.42□□□□□ -1.22
GINS3-201ENST00000318129 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa7.42□□□□□ -1.22
GINS3-201ENST00000318129 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa7.41□□□□□ -1.22
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GINS3-201ENST00000318129 H7C2G1 150 aa7.41□□□□□ -1.22
GINS3-201ENST00000318129 SPANXN1Q5VSR9 72 aa7.41□□□□□ -1.22
GINS3-201ENST00000318129 STHQ8IWL8 128 aa7.41□□□□□ -1.22
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GINS3-201ENST00000318129 C19orf73Q9NVV2 129 aa7.41□□□□□ -1.22
GINS3-201ENST00000318129 CSMD3Q7Z407 3707 aa7.41□□□□□ -1.22
GINS3-201ENST00000318129 KLLNB2CW77 178 aa7.41□□□□□ -1.22
GINS3-201ENST00000318129 TSHBP01222 138 aa7.41□□□□□ -1.22
GINS3-201ENST00000318129 DEFB121Q5J5C9 76 aa7.41□□□□□ -1.22
GINS3-201ENST00000318129 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
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GINS3-201ENST00000318129 COL7A1Q02388 2944 aa7.41□□□□□ -1.22
GINS3-201ENST00000318129 TGP01266 2768 aa7.41□□□□□ -1.22
GINS3-201ENST00000318129 TRAV21A0A0B4J279 112 aa7.4□□□□□ -1.22
GINS3-201ENST00000318129 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa7.4□□□□□ -1.22
GINS3-201ENST00000318129 IGKV3-20P01619 116 aa7.4□□□□□ -1.22
GINS3-201ENST00000318129 C2orf82Q6UX34 121 aa7.4□□□□□ -1.22
GINS3-201ENST00000318129 H7C423 109 aa7.4□□□□□ -1.23
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GINS3-201ENST00000318129 TRGV11A0A075B6L2 103 aa7.39□□□□□ -1.23
GINS3-201ENST00000318129 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa7.39□□□□□ -1.23
GINS3-201ENST00000318129 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa7.39□□□□□ -1.23
GINS3-201ENST00000318129 J3QQQ9 107 aa7.39□□□□□ -1.23
GINS3-201ENST00000318129 C9orf153Q5TBE3 101 aa7.39□□□□□ -1.23
GINS3-201ENST00000318129 TMEM101Q96IK0 257 aa7.39□□□□□ -1.23
GINS3-201ENST00000318129 IMUPQ9GZP8 106 aa7.39□□□□□ -1.23
GINS3-201ENST00000318129 A0A1B0GX51 115 aa7.39□□□□□ -1.23
GINS3-201ENST00000318129 H3BT86 120 aa7.39□□□□□ -1.23
GINS3-201ENST00000318129 TRIAP1O43715 76 aa7.39□□□□□ -1.23
GINS3-201ENST00000318129 HERVK_113P63121 156 aa7.39□□□□□ -1.23
GINS3-201ENST00000318129 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa7.39□□□□□ -1.23
GINS3-201ENST00000318129 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
GINS3-201ENST00000318129 MUSTN1Q8IVN3 82 aa7.39□□□□□ -1.23
GINS3-201ENST00000318129 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
GINS3-201ENST00000318129 IGIPA6NJ69 53 aa7.38□□□□□ -1.23
GINS3-201ENST00000318129 PMVKQ15126 192 aa7.38□□□□□ -1.23
GINS3-201ENST00000318129 Q1RN00 199 aa7.38□□□□□ -1.23
GINS3-201ENST00000318129 SPINK13Q1W4C9 94 aa7.38□□□□□ -1.23
GINS3-201ENST00000318129 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa7.38□□□□□ -1.23
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GINS3-201ENST00000318129 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
GINS3-201ENST00000318129 J3KT08 172 aa7.38□□□□□ -1.23
GINS3-201ENST00000318129 UQCRQO14949 82 aa7.38□□□□□ -1.23
GINS3-201ENST00000318129 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
GINS3-201ENST00000318129 OXLD1Q5BKU9 147 aa7.38□□□□□ -1.23
GINS3-201ENST00000318129 TMEM170BQ5T4T1 132 aa7.38□□□□□ -1.23
GINS3-201ENST00000318129 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
GINS3-201ENST00000318129 ZNRF2Q8NHG8 242 aa7.38□□□□□ -1.23
GINS3-201ENST00000318129 LINC00526Q96FQ7 95 aa7.38□□□□□ -1.23
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GINS3-201ENST00000318129 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa7.36□□□□□ -1.23
GINS3-201ENST00000318129 M0R381 172 aa7.36□□□□□ -1.23
GINS3-201ENST00000318129 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
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GINS3-201ENST00000318129 TMEM223A0PJW6 202 aa7.36□□□□□ -1.23
GINS3-201ENST00000318129 INSP01308 110 aa7.36□□□□□ -1.23
GINS3-201ENST00000318129 WFDC10AQ9H1F0 79 aa7.36□□□□□ -1.23
GINS3-201ENST00000318129 DPH3P1Q9H4G8 78 aa7.36□□□□□ -1.23
GINS3-201ENST00000318129 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa7.35□□□□□ -1.23
GINS3-201ENST00000318129 RPS28P62857 69 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
GINS3-201ENST00000318129 ZNF876PQ49A33 203 aa7.35□□□□□ -1.23
GINS3-201ENST00000318129 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa7.35□□□□□ -1.23
GINS3-201ENST00000318129 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
GINS3-201ENST00000318129 TMEM141Q96I45 108 aa7.35□□□□□ -1.23
GINS3-201ENST00000318129 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
GINS3-201ENST00000318129 DNAH3Q8TD57 4116 aa7.34□□□□□ -1.23
GINS3-201ENST00000318129 LEPROTO15243 131 aa7.34□□□□□ -1.23
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