RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317623.8

PCNX4-201, Transcript of pecanex 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene PCNX4, Length 17,339 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX4-201ENST00000317623 A0A0J9YX75 114 aa4.98□□□□□ -1.61
PCNX4-201ENST00000317623 APRG1Q8IVJ8 170 aa4.98□□□□□ -1.61
PCNX4-201ENST00000317623 C22orf34Q6ZV56 151 aa4.98□□□□□ -1.61
PCNX4-201ENST00000317623 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa4.97□□□□□ -1.61
PCNX4-201ENST00000317623 SMIM11BQ8TCY0 68 aa4.97□□□□□ -1.61
PCNX4-201ENST00000317623 DEFB1P60022 68 aa4.97□□□□□ -1.61
PCNX4-201ENST00000317623 ZMAT4Q9H898 229 aa4.97□□□□□ -1.61
PCNX4-201ENST00000317623 SIRPDQ9H106 197 aa4.97□□□□□ -1.61
PCNX4-201ENST00000317623 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
PCNX4-201ENST00000317623 UBE2D1P51668 147 aa4.97□□□□□ -1.61
PCNX4-201ENST00000317623 GPHB5Q86YW7 130 aa4.97□□□□□ -1.61
PCNX4-201ENST00000317623 C1orf158Q8N1D5 194 aa4.97□□□□□ -1.61
PCNX4-201ENST00000317623 RNF138Q8WVD3 245 aa4.97□□□□□ -1.61
PCNX4-201ENST00000317623 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
PCNX4-201ENST00000317623 DKK4Q9UBT3 224 aa4.97□□□□□ -1.61
PCNX4-201ENST00000317623 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
PCNX4-201ENST00000317623 A8MZ25 164 aa4.96□□□□□ -1.61
PCNX4-201ENST00000317623 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa4.96□□□□□ -1.61
PCNX4-201ENST00000317623 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa4.96□□□□□ -1.62
PCNX4-201ENST00000317623 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
PCNX4-201ENST00000317623 BRWD1-AS2P59051 145 aa4.96□□□□□ -1.62
PCNX4-201ENST00000317623 MYCNOSP40205 109 aa4.96□□□□□ -1.62
PCNX4-201ENST00000317623 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
PCNX4-201ENST00000317623 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa4.96□□□□□ -1.62
PCNX4-201ENST00000317623 COL4A5P29400 1685 aa4.96□□□□□ -1.62
PCNX4-201ENST00000317623 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa4.96□□□□□ -1.62
PCNX4-201ENST00000317623 LINC00574Q9H8X3 128 aa4.96□□□□□ -1.62
PCNX4-201ENST00000317623 DEFB112Q30KQ8 113 aa4.96□□□□□ -1.62
PCNX4-201ENST00000317623 PRYO14603 147 aa4.95□□□□□ -1.62
PCNX4-201ENST00000317623 LY6DQ14210 128 aa4.95□□□□□ -1.62
PCNX4-201ENST00000317623 DEFB121Q5J5C9 76 aa4.95□□□□□ -1.62
PCNX4-201ENST00000317623 ODF3Q96PU9 254 aa4.95□□□□□ -1.62
PCNX4-201ENST00000317623 TSHBP01222 138 aa4.95□□□□□ -1.62
PCNX4-201ENST00000317623 WFDC10AQ9H1F0 79 aa4.95□□□□□ -1.62
PCNX4-201ENST00000317623 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa4.95□□□□□ -1.62
PCNX4-201ENST00000317623 ADAMTS20P59510 1910 aa4.95□□□□□ -1.62
PCNX4-201ENST00000317623 C5orf56Q8N8D9 126 aa4.95□□□□□ -1.62
PCNX4-201ENST00000317623 SPART-AS1P0CW21 52 aa4.95□□□□□ -1.62
PCNX4-201ENST00000317623 PTPRSQ13332 1948 aa4.95□□□□□ -1.62
PCNX4-201ENST00000317623 C3orf84H3BNL1 204 aa4.94□□□□□ -1.62
PCNX4-201ENST00000317623 POM121L12Q8N7R1 296 aa4.94□□□□□ -1.62
PCNX4-201ENST00000317623 SLURP1P55000 103 aa4.94□□□□□ -1.62
PCNX4-201ENST00000317623 MUC6Q6W4X9 2439 aa4.94□□□□□ -1.62
PCNX4-201ENST00000317623 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
PCNX4-201ENST00000317623 ABCA12Q86UK0 2595 aa4.93□□□□□ -1.62
PCNX4-201ENST00000317623 Q8N814 137 aa4.93□□□□□ -1.62
PCNX4-201ENST00000317623 CTSZQ9UBR2 303 aa4.93□□□□□ -1.62
PCNX4-201ENST00000317623 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
PCNX4-201ENST00000317623 KLK12Q9UKR0 248 aa4.93□□□□□ -1.62
PCNX4-201ENST00000317623 IGF1P05019 195 aa4.93□□□□□ -1.62
PCNX4-201ENST00000317623 LINC00269Q8N2A0 174 aa4.93□□□□□ -1.62
PCNX4-201ENST00000317623 DEFB136Q30KP8 78 aa4.93□□□□□ -1.62
PCNX4-201ENST00000317623 B9D2Q9BPU9 175 aa4.93□□□□□ -1.62
PCNX4-201ENST00000317623 Q8N9L7 120 aa4.93□□□□□ -1.62
PCNX4-201ENST00000317623 LIMD2Q9BT23 127 aa4.93□□□□□ -1.62
PCNX4-201ENST00000317623 CELA1Q9UNI1 258 aa4.93□□□□□ -1.62
PCNX4-201ENST00000317623 IGIPA6NJ69 53 aa4.93□□□□□ -1.62
PCNX4-201ENST00000317623 K7ENP7 123 aa4.93□□□□□ -1.62
PCNX4-201ENST00000317623 C6orf99Q4VX62 202 aa4.93□□□□□ -1.62
PCNX4-201ENST00000317623 CRYGAP11844 174 aa4.92□□□□□ -1.62
PCNX4-201ENST00000317623 ESRGQ1W209 222 aa4.92□□□□□ -1.62
PCNX4-201ENST00000317623 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
PCNX4-201ENST00000317623 GAS8-AS1O95177 125 aa4.92□□□□□ -1.62
PCNX4-201ENST00000317623 Q8N9W7 124 aa4.92□□□□□ -1.62
PCNX4-201ENST00000317623 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa4.92□□□□□ -1.62
PCNX4-201ENST00000317623 A0A087WVE0 104 aa4.92□□□□□ -1.62
PCNX4-201ENST00000317623 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa4.92□□□□□ -1.62
PCNX4-201ENST00000317623 C4orf48Q5BLP8 95 aa4.92□□□□□ -1.62
PCNX4-201ENST00000317623 SPTBN4Q9H254 2564 aa4.92□□□□□ -1.62
PCNX4-201ENST00000317623 Q6ZPA2 131 aa4.92□□□□□ -1.62
PCNX4-201ENST00000317623 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa4.92□□□□□ -1.62
PCNX4-201ENST00000317623 RPL28P46779 137 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
PCNX4-201ENST00000317623 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa4.92□□□□□ -1.62
PCNX4-201ENST00000317623 NAV2Q8IVL1 2488 aa4.92□□□□□ -1.62
PCNX4-201ENST00000317623 WFDC13Q8IUB5 93 aa4.91□□□□□ -1.62
PCNX4-201ENST00000317623 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
PCNX4-201ENST00000317623 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa4.91□□□□□ -1.62
PCNX4-201ENST00000317623 U3KQA8 63 aa4.91□□□□□ -1.62
PCNX4-201ENST00000317623 CNFNQ9BYD5 112 aa4.91□□□□□ -1.62
PCNX4-201ENST00000317623 CXCL6P80162 114 aa4.91□□□□□ -1.62
PCNX4-201ENST00000317623 PIEZO1Q92508 2521 aa4.91□□□□□ -1.62
PCNX4-201ENST00000317623 RNF223E7ERA6 249 aa4.91□□□□□ -1.62
PCNX4-201ENST00000317623 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa4.91□□□□□ -1.62
PCNX4-201ENST00000317623 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa4.91□□□□□ -1.62
PCNX4-201ENST00000317623 CRIP3Q6Q6R5 217 aa4.91□□□□□ -1.62
PCNX4-201ENST00000317623 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.62
PCNX4-201ENST00000317623 COX17Q14061 63 aa4.9□□□□□ -1.62
PCNX4-201ENST00000317623 TMEM254Q8TBM7 123 aa4.9□□□□□ -1.62
PCNX4-201ENST00000317623 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa4.9□□□□□ -1.62
PCNX4-201ENST00000317623 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.62
PCNX4-201ENST00000317623 DCANP1Q8TF63 244 aa4.9□□□□□ -1.62
PCNX4-201ENST00000317623 C9orf85Q96MD7 179 aa4.9□□□□□ -1.62
PCNX4-201ENST00000317623 BEAN1Q3B7T3 259 aa4.9□□□□□ -1.62
PCNX4-201ENST00000317623 ESM1Q9NQ30 184 aa4.9□□□□□ -1.63
PCNX4-201ENST00000317623 CCDC140Q96MF4 163 aa4.9□□□□□ -1.63
PCNX4-201ENST00000317623 LRP4O75096 1905 aa4.9□□□□□ -1.63
PCNX4-201ENST00000317623 MTORP42345 2549 aa4.9□□□□□ -1.63
PCNX4-201ENST00000317623 Q6ZQY7 126 aa4.9□□□□□ -1.63
PCNX4-201ENST00000317623 REG3AQ06141 175 aa4.9□□□□□ -1.63
PCNX4-201ENST00000317623 M0R378 163 aa4.89□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.6 ms