RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
CCSAP-201ENST00000284617 TSHBP01222 138 aa15.67■□□□□ 0.1
CCSAP-201ENST00000284617 SDIM1Q6ZPB5 146 aa15.67■□□□□ 0.1
CCSAP-201ENST00000284617 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa15.67■□□□□ 0.1
CCSAP-201ENST00000284617 MIFP14174 115 aa15.66■□□□□ 0.1
CCSAP-201ENST00000284617 SPATA25Q9BR10 227 aa15.66■□□□□ 0.1
CCSAP-201ENST00000284617 HIGD2AQ9BW72 106 aa15.66■□□□□ 0.1
CCSAP-201ENST00000284617 DSCAMO60469 2012 aa15.66■□□□□ 0.1
CCSAP-201ENST00000284617 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
CCSAP-201ENST00000284617 C11orf21Q9P2W6 132 aa15.66■□□□□ 0.1
CCSAP-201ENST00000284617 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa15.66■□□□□ 0.1
CCSAP-201ENST00000284617 PROK1P58294 105 aa15.65■□□□□ 0.1
CCSAP-201ENST00000284617 C20orf197Q8N268 126 aa15.65■□□□□ 0.1
CCSAP-201ENST00000284617 IL17DQ8TAD2 202 aa15.65■□□□□ 0.1
CCSAP-201ENST00000284617 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa15.65■□□□□ 0.1
CCSAP-201ENST00000284617 CNFNQ9BYD5 112 aa15.64■□□□□ 0.09
CCSAP-201ENST00000284617 C10orf99Q6UWK7 81 aa15.64■□□□□ 0.09
CCSAP-201ENST00000284617 PRO3102Q9H379 93 aa15.64■□□□□ 0.09
CCSAP-201ENST00000284617 PRR9Q5T870 116 aa15.63■□□□□ 0.09
CCSAP-201ENST00000284617 Q8N976 141 aa15.63■□□□□ 0.09
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC168Q8NDH2 2452 aa15.63■□□□□ 0.09
CCSAP-201ENST00000284617 SLPIP03973 132 aa15.63■□□□□ 0.09
CCSAP-201ENST00000284617 CRYGDP07320 174 aa15.63■□□□□ 0.09
CCSAP-201ENST00000284617 C9orf85Q96MD7 179 aa15.62■□□□□ 0.09
CCSAP-201ENST00000284617 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa15.62■□□□□ 0.09
CCSAP-201ENST00000284617 C6orf99Q4VX62 202 aa15.62■□□□□ 0.09
CCSAP-201ENST00000284617 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
CCSAP-201ENST00000284617 NUP210LQ5VU65 1888 aa15.61■□□□□ 0.09
CCSAP-201ENST00000284617 RBX1P62877 108 aa15.61■□□□□ 0.09
CCSAP-201ENST00000284617 C10orf142B7Z368 130 aa15.61■□□□□ 0.09
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF702PQ9H963 129 aa15.6■□□□□ 0.09
CCSAP-201ENST00000284617 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa15.6■□□□□ 0.09
CCSAP-201ENST00000284617 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
CCSAP-201ENST00000284617 IGLV1-40P01703 118 aa15.59■□□□□ 0.09
CCSAP-201ENST00000284617 XAGE1AQ9HD64 81 aa15.59■□□□□ 0.09
CCSAP-201ENST00000284617 ENHOQ6UWT2 76 aa15.59■□□□□ 0.09
CCSAP-201ENST00000284617 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa15.59■□□□□ 0.09
CCSAP-201ENST00000284617 LST1O00453 97 aa15.58■□□□□ 0.09
CCSAP-201ENST00000284617 CD164L2Q6UWJ8 174 aa15.58■□□□□ 0.08
CCSAP-201ENST00000284617 C3orf22Q8N5N4 141 aa15.58■□□□□ 0.08
CCSAP-201ENST00000284617 IMUPQ9GZP8 106 aa15.58■□□□□ 0.08
CCSAP-201ENST00000284617 PIEZO1Q92508 2521 aa15.58■□□□□ 0.08
CCSAP-201ENST00000284617 HILS1P60008 231 aa15.58■□□□□ 0.08
CCSAP-201ENST00000284617 SYCNQ0VAF6 134 aa15.57■□□□□ 0.08
CCSAP-201ENST00000284617 A8MZ25 164 aa15.57■□□□□ 0.08
CCSAP-201ENST00000284617 HCFC1P51610 2035 aa15.57■□□□□ 0.08
CCSAP-201ENST00000284617 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa15.56■□□□□ 0.08
CCSAP-201ENST00000284617 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa15.56■□□□□ 0.08
CCSAP-201ENST00000284617 FAM236CP0DP71 79 aa15.56■□□□□ 0.08
CCSAP-201ENST00000284617 DCANP1Q8TF63 244 aa15.56■□□□□ 0.08
CCSAP-201ENST00000284617 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
CCSAP-201ENST00000284617 LINC00482Q8N8I6 264 aa15.55■□□□□ 0.08
CCSAP-201ENST00000284617 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa15.55■□□□□ 0.08
CCSAP-201ENST00000284617 IGKV4-1P06312 121 aa15.54■□□□□ 0.08
CCSAP-201ENST00000284617 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa15.54■□□□□ 0.08
CCSAP-201ENST00000284617 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa15.54■□□□□ 0.08
CCSAP-201ENST00000284617 GAS8-AS1O95177 125 aa15.53■□□□□ 0.08
CCSAP-201ENST00000284617 MYO9AB2RTY4 2548 aa15.53■□□□□ 0.08
CCSAP-201ENST00000284617 UBE2D1P51668 147 aa15.53■□□□□ 0.08
CCSAP-201ENST00000284617 LINC00310P59036 64 aa15.53■□□□□ 0.08
CCSAP-201ENST00000284617 CCKP06307 115 aa15.52■□□□□ 0.08
CCSAP-201ENST00000284617 SCXQ7RTU7 201 aa15.52■□□□□ 0.08
CCSAP-201ENST00000284617 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
CCSAP-201ENST00000284617 TANC2Q9HCD6 1990 aa15.51■□□□□ 0.07
CCSAP-201ENST00000284617 Q6ZS46 218 aa15.51■□□□□ 0.07
CCSAP-201ENST00000284617 BRK1Q8WUW1 75 aa15.51■□□□□ 0.07
CCSAP-201ENST00000284617 ABCA2Q9BZC7 2435 aa15.51■□□□□ 0.07
CCSAP-201ENST00000284617 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa15.51■□□□□ 0.07
CCSAP-201ENST00000284617 IGIPA6NJ69 53 aa15.5■□□□□ 0.07
CCSAP-201ENST00000284617 LINC01006Q8NI28 216 aa15.5■□□□□ 0.07
CCSAP-201ENST00000284617 INAFM1C9JVW0 142 aa15.49■□□□□ 0.07
CCSAP-201ENST00000284617 SEC61GP60059 68 aa15.49■□□□□ 0.07
CCSAP-201ENST00000284617 A0A087WZ39 114 aa15.49■□□□□ 0.07
CCSAP-201ENST00000284617 Q6ZQY7 126 aa15.49■□□□□ 0.07
CCSAP-201ENST00000284617 MUC7Q8TAX7 377 aa15.49■□□□□ 0.07
CCSAP-201ENST00000284617 LELP1Q5T871 98 aa15.48■□□□□ 0.07
CCSAP-201ENST00000284617 SHISA2Q6UWI4 295 aa15.48■□□□□ 0.07
CCSAP-201ENST00000284617 SERP2Q8N6R1 65 aa15.48■□□□□ 0.07
CCSAP-201ENST00000284617 A0A096LNI7 61 aa15.48■□□□□ 0.07
CCSAP-201ENST00000284617 M0R378 163 aa15.48■□□□□ 0.07
CCSAP-201ENST00000284617 USP17L23D6RBM5 183 aa15.47■□□□□ 0.07
CCSAP-201ENST00000284617 COX17Q14061 63 aa15.47■□□□□ 0.07
CCSAP-201ENST00000284617 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
CCSAP-201ENST00000284617 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa15.47■□□□□ 0.07
CCSAP-201ENST00000284617 UBE2D3P61077 147 aa15.46■□□□□ 0.07
CCSAP-201ENST00000284617 UBE2D2P62837 147 aa15.46■□□□□ 0.07
CCSAP-201ENST00000284617 C1orf158Q8N1D5 194 aa15.46■□□□□ 0.07
CCSAP-201ENST00000284617 SMIM11BQ8TCY0 68 aa15.46■□□□□ 0.07
CCSAP-201ENST00000284617 TRAV10A0A0B4J240 114 aa15.45■□□□□ 0.06
CCSAP-201ENST00000284617 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa15.45■□□□□ 0.06
CCSAP-201ENST00000284617 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa15.45■□□□□ 0.06
CCSAP-201ENST00000284617 NDUFC1O43677 76 aa15.45■□□□□ 0.06
CCSAP-201ENST00000284617 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa15.44■□□□□ 0.06
CCSAP-201ENST00000284617 POM121L12Q8N7R1 296 aa15.44■□□□□ 0.06
CCSAP-201ENST00000284617 NCOR2Q9Y618 2525 aa15.44■□□□□ 0.06
CCSAP-201ENST00000284617 Q8IZM0 81 aa15.43■□□□□ 0.06
CCSAP-201ENST00000284617 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa15.43■□□□□ 0.06
CCSAP-201ENST00000284617 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa15.42■□□□□ 0.06
CCSAP-201ENST00000284617 C18orf65Q6ZTR6 163 aa15.42■□□□□ 0.06
CCSAP-201ENST00000284617 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 121.7 ms