RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283228.6

PTPRR-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 3,529 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-201ENST00000283228 C20orf197Q8N268 126 aa8.34□□□□□ -1.07
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PTPRR-201ENST00000283228 KLLNB2CW77 178 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRR-201ENST00000283228 FAM19A4Q96LR4 140 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRR-201ENST00000283228 C2orf48Q96LS8 159 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRR-201ENST00000283228 FAM223BA6NKX1 122 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRR-201ENST00000283228 SOCS3O14543 225 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRR-201ENST00000283228 LINC00158P58513 81 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRR-201ENST00000283228 C5orf38Q86SI9 138 aa8.33□□□□□ -1.08
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PTPRR-201ENST00000283228 LINC00846Q9NV44 126 aa8.33□□□□□ -1.08
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PTPRR-201ENST00000283228 PFN2P35080 140 aa8.3□□□□□ -1.08
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PTPRR-201ENST00000283228 OXTP01178 125 aa8.3□□□□□ -1.08
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PTPRR-201ENST00000283228 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRR-201ENST00000283228 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa8.29□□□□□ -1.08
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PTPRR-201ENST00000283228 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa8.27□□□□□ -1.09
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PTPRR-201ENST00000283228 CHCHD7Q9BUK0 85 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRR-201ENST00000283228 LINC01561Q8N1V8 128 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRR-201ENST00000283228 A0A0U1RQV1 116 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRR-201ENST00000283228 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRR-201ENST00000283228 PIEZO1Q92508 2521 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRR-201ENST00000283228 APRG1Q8IVJ8 170 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRR-201ENST00000283228 USMG5Q96IX5 58 aa8.25□□□□□ -1.09
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PTPRR-201ENST00000283228 Q6JHZ5 121 aa8.25□□□□□ -1.09
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PTPRR-201ENST00000283228 UBE2L6O14933 153 aa8.25□□□□□ -1.09
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PTPRR-201ENST00000283228 LINC00337Q8N6G1 96 aa8.24□□□□□ -1.09
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PTPRR-201ENST00000283228 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
PTPRR-201ENST00000283228 SMIM1B2RUZ4 78 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRR-201ENST00000283228 HAMPP81172 84 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRR-201ENST00000283228 WIPF1O43516 503 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRR-201ENST00000283228 RPL28P46779 137 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
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