RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640888.1

LIAS-222, Transcript of lipoic acid synthetase, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LIAS, Length 4,041 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LIAS-222	ENST00000640888	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		11.32	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		11.32	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		11.32	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		11.32	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	RGL2	O15211	777 aa		11.32	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	DNTTIP2	Q5QJE6	756 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		11.32	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	NUP98	P52948	1817 aa		11.32	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	RIMBP2	O15034	1052 aa		11.32	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	FOXP2	O15409	715 aa		11.32	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		11.32	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	KRT40	Q6A162	431 aa		11.32	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	SPTLC2	O15270	562 aa		11.31	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		11.31	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	11.31	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		11.31	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	TNKS	O95271	1327 aa		11.31	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		11.31	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		11.31	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		11.31	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	ZNF444	Q8N0Y2	327 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		11.31	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	LIFR	P42702	1097 aa		11.31	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	TYRO3	Q06418	890 aa		11.31	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	AIFM3	Q96NN9	605 aa		11.31	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	TXNRD1	Q16881	649 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	UVSSA	Q2YD98	709 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	SLF2	Q8IX21	1173 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	LY9	Q9HBG7	655 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888		F8W031	263 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	NR1I2	O75469	434 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	MYSM1	Q5VVJ2	828 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	SENP2	Q9HC62	589 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	CTAGE5	O15320	804 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	ATP2B4	P23634	1241 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	ADGRA1	Q86SQ6	560 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		11.29	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	ZSCAN30	Q86W11	494 aa		11.29	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	TRIM5	Q9C035	493 aa		11.29	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	FDPS	P14324	419 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	CDC27	P30260	824 aa		11.29	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	ANO6	Q4KMQ2	910 aa		11.29	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	ANO1	Q5XXA6	986 aa		11.29	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		11.29	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	KAT14	Q9H8E8	782 aa		11.29	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		11.29	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	ADCY5	O95622	1261 aa		11.29	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	TPM4	P67936	248 aa		11.29	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		11.29	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	MSL1	Q68DK7	614 aa		11.29	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		11.29	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	FANCB	Q8NB91	859 aa		11.29	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	SPC24	Q8NBT2	197 aa		11.29	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		11.29	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		11.29	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	NBPF3	Q9H094	633 aa		11.29	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		11.29	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	SPEF2	Q9C093	1822 aa		11.28	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888		A0A1B0GVL5	298 aa		11.28	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	GYS1	P13807	737 aa		11.28	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		11.28	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	FAM200A	Q8TCP9	573 aa		11.28	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		11.28	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	NAT10	Q9H0A0	1025 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		11.28	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	BBOX1	O75936	387 aa		11.28	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	DEXI	O95424	95 aa		11.28	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	TSPY3	P0CV98	308 aa		11.28	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	TSPY8	P0CW00	308 aa		11.28	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	CALM1	P0DP23	149 aa		11.28	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	CALM2	P0DP24	149 aa		11.28	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	CALM3	P0DP25	149 aa		11.28	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	ZNF165	P49910	485 aa		11.28	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		11.28	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		11.28	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	PGBD1	Q96JS3	809 aa		11.28	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	STX8	Q9UNK0	236 aa		11.28	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		11.28	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	ATRN	O75882	1429 aa		11.28	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	GPSM2	P81274	684 aa		11.28	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	SGMS1	Q86VZ5	419 aa		11.28	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		11.28	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	TEX11	Q8IYF3	940 aa		11.28	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		11.28	□□□□□ -0.6
LIAS-222	ENST00000640888	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		11.28	□□□□□ -0.6

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