RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639525.1

SPIN3-223, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5 BASIC

Gene SPIN3, Length 3,958 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-223	ENST00000639525	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SPIN3-223	ENST00000639525	TMEM232	C9JQI7	657 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SPIN3-223	ENST00000639525	CDC25A	P30304	524 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SPIN3-223	ENST00000639525	UBA7	P41226	1012 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SPIN3-223	ENST00000639525	MCAM	P43121	646 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SPIN3-223	ENST00000639525	POSTN	Q15063	836 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SPIN3-223	ENST00000639525	CCDC70	Q6NSX1	233 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SPIN3-223	ENST00000639525	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
SPIN3-223	ENST00000639525	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SPIN3-223	ENST00000639525	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SPIN3-223	ENST00000639525	SPATA5	Q8NB90	893 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SPIN3-223	ENST00000639525	CAPZA3	Q96KX2	299 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SPIN3-223	ENST00000639525	PPARD	Q03181	441 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SPIN3-223	ENST00000639525	IQCB1	Q15051	598 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SPIN3-223	ENST00000639525	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SPIN3-223	ENST00000639525	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
SPIN3-223	ENST00000639525	UCHL5	Q9Y5K5	329 aa	Known RBP eCLIP	13.41	□□□□□ -0.26
SPIN3-223	ENST00000639525	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SPIN3-223	ENST00000639525	ETF1	P62495	437 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
SPIN3-223	ENST00000639525	STIM1	Q13586	685 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SPIN3-223	ENST00000639525	LEKR1	Q6ZMV7	388 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SPIN3-223	ENST00000639525	GDAP1L1	Q96MZ0	367 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SPIN3-223	ENST00000639525	SENP2	Q9HC62	589 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SPIN3-223	ENST00000639525	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SPIN3-223	ENST00000639525	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SPIN3-223	ENST00000639525	TCHH	Q07283	1943 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SPIN3-223	ENST00000639525	SLC39A14	Q15043	492 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SPIN3-223	ENST00000639525	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SPIN3-223	ENST00000639525	CNNM2	Q9H8M5	875 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SPIN3-223	ENST00000639525	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
SPIN3-223	ENST00000639525	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SPIN3-223	ENST00000639525	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SPIN3-223	ENST00000639525	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SPIN3-223	ENST00000639525	MAGEB6P1	A0A0J9YX57	407 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SPIN3-223	ENST00000639525	CCDC175	P0C221	793 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SPIN3-223	ENST00000639525	FOXO4	P98177	505 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SPIN3-223	ENST00000639525	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SPIN3-223	ENST00000639525	FMR1NB	Q8N0W7	255 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
SPIN3-223	ENST00000639525	ST7	Q9NRC1	585 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SPIN3-223	ENST00000639525	ERLIN1	O75477	346 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SPIN3-223	ENST00000639525	GYG1	P46976	350 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SPIN3-223	ENST00000639525	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SPIN3-223	ENST00000639525	TBC1D10C	Q8IV04	446 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SPIN3-223	ENST00000639525	TMEM87B	Q96K49	555 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SPIN3-223	ENST00000639525	AK7	Q96M32	723 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SPIN3-223	ENST00000639525	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SPIN3-223	ENST00000639525	AKNAD1	Q5T1N1	836 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SPIN3-223	ENST00000639525	DHX40	Q8IX18	779 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
SPIN3-223	ENST00000639525	TRIM47	Q96LD4	638 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SPIN3-223	ENST00000639525	CENPH	Q9H3R5	247 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SPIN3-223	ENST00000639525	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SPIN3-223	ENST00000639525	CUTA	O60888	179 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SPIN3-223	ENST00000639525	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
SPIN3-223	ENST00000639525	FDPS	P14324	419 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
SPIN3-223	ENST00000639525	CDC27	P30260	824 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SPIN3-223	ENST00000639525	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
SPIN3-223	ENST00000639525	PPP2R3A	Q06190	1150 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SPIN3-223	ENST00000639525	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
SPIN3-223	ENST00000639525	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
SPIN3-223	ENST00000639525	NOSTRIN	Q8IVI9	506 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SPIN3-223	ENST00000639525	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SPIN3-223	ENST00000639525	RUFY1	Q96T51	708 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SPIN3-223	ENST00000639525	SAMSN1	Q9NSI8	373 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
SPIN3-223	ENST00000639525	CTNND2	Q9UQB3	1225 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SPIN3-223	ENST00000639525	DPF2	Q92785	391 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SPIN3-223	ENST00000639525	MED23	Q9ULK4	1368 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SPIN3-223	ENST00000639525	MTIF2	P46199	727 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
SPIN3-223	ENST00000639525	CTSW	P56202	376 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SPIN3-223	ENST00000639525	PIP4K2B	P78356	416 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SPIN3-223	ENST00000639525	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SPIN3-223	ENST00000639525	SOGA3	Q5TF21	947 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SPIN3-223	ENST00000639525	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SPIN3-223	ENST00000639525	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
SPIN3-223	ENST00000639525	TAB2	Q9NYJ8	693 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SPIN3-223	ENST00000639525	IMPACT	Q9P2X3	320 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SPIN3-223	ENST00000639525	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SPIN3-223	ENST00000639525	FAM170A	A1A519	330 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SPIN3-223	ENST00000639525	PDE8B	O95263	885 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SPIN3-223	ENST00000639525	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SPIN3-223	ENST00000639525	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SPIN3-223	ENST00000639525	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SPIN3-223	ENST00000639525		A0A1W2PQ27	194 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SPIN3-223	ENST00000639525		A0A1W2PQ64	194 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SPIN3-223	ENST00000639525		A0A1W2PQD8	194 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SPIN3-223	ENST00000639525	AKR1B15	C9JRZ8	316 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
SPIN3-223	ENST00000639525	PDE8A	O60658	829 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SPIN3-223	ENST00000639525	TRIM21	P19474	475 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
SPIN3-223	ENST00000639525	JADE2	Q9NQC1	790 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SPIN3-223	ENST00000639525	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SPIN3-223	ENST00000639525	STAT6	P42226	847 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SPIN3-223	ENST00000639525	EPS15	P42566	896 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SPIN3-223	ENST00000639525	UBXN1	Q04323	297 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SPIN3-223	ENST00000639525	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SPIN3-223	ENST00000639525	DHX37	Q8IY37	1157 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF444	Q8N0Y2	327 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
SPIN3-223	ENST00000639525	LPIN2	Q92539	896 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SPIN3-223	ENST00000639525	PCDHB6	Q9Y5E3	794 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SPIN3-223	ENST00000639525	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
SPIN3-223	ENST00000639525	KRT2	P35908	639 aa		13.38	□□□□□ -0.27

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