RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635231.1

QARS-238, Transcript of glutaminyl-tRNA synthetase, human

TSL 4

Gene QARS, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
QARS-238	ENST00000635231	CCL5	P13501	91 aa		12.92	□□□□□ -0.34
QARS-238	ENST00000635231	PTPRA	P18433	802 aa		12.92	□□□□□ -0.34
QARS-238	ENST00000635231	GJA8	P48165	433 aa		12.92	□□□□□ -0.34
QARS-238	ENST00000635231	GPAT2	Q6NUI2	795 aa		12.92	□□□□□ -0.34
QARS-238	ENST00000635231	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	12.92	□□□□□ -0.34
QARS-238	ENST00000635231	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		12.92	□□□□□ -0.34
QARS-238	ENST00000635231	FAM163A	Q96GL9	167 aa	Predicted RBP	12.92	□□□□□ -0.34
QARS-238	ENST00000635231	RNF208	Q9H0X6	261 aa		12.92	□□□□□ -0.34
QARS-238	ENST00000635231	ABCF2	Q9UG63	623 aa		12.92	□□□□□ -0.34
QARS-238	ENST00000635231	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		12.92	□□□□□ -0.34
QARS-238	ENST00000635231	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		12.91	□□□□□ -0.34
QARS-238	ENST00000635231	CAPN2	P17655	700 aa		12.91	□□□□□ -0.34
QARS-238	ENST00000635231	ADORA1	P30542	326 aa		12.91	□□□□□ -0.34
QARS-238	ENST00000635231	MAP3K10	Q02779	954 aa		12.91	□□□□□ -0.34
QARS-238	ENST00000635231	PRKCZ	Q05513	592 aa		12.91	□□□□□ -0.34
QARS-238	ENST00000635231	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		12.91	□□□□□ -0.34
QARS-238	ENST00000635231	SHISA4	Q96DD7	197 aa		12.91	□□□□□ -0.34
QARS-238	ENST00000635231	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	12.91	□□□□□ -0.34
QARS-238	ENST00000635231	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	12.91	□□□□□ -0.34
QARS-238	ENST00000635231	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		12.91	□□□□□ -0.34
QARS-238	ENST00000635231	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		12.91	□□□□□ -0.34
QARS-238	ENST00000635231	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		12.91	□□□□□ -0.34
QARS-238	ENST00000635231	BTD	P43251	543 aa		12.9	□□□□□ -0.34
QARS-238	ENST00000635231	RASGRF1	Q13972	1273 aa		12.9	□□□□□ -0.34
QARS-238	ENST00000635231	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	12.9	□□□□□ -0.34
QARS-238	ENST00000635231	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		12.9	□□□□□ -0.34
QARS-238	ENST00000635231	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	12.9	□□□□□ -0.34
QARS-238	ENST00000635231	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		12.9	□□□□□ -0.34
QARS-238	ENST00000635231	NR2E3	Q9Y5X4	410 aa		12.9	□□□□□ -0.34
QARS-238	ENST00000635231	CEP290	O15078	2479 aa		12.89	□□□□□ -0.35
QARS-238	ENST00000635231	TNPO2	O14787	897 aa	Known RBP	12.89	□□□□□ -0.35
QARS-238	ENST00000635231	ADCY3	O60266	1144 aa		12.89	□□□□□ -0.35
QARS-238	ENST00000635231	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	12.89	□□□□□ -0.35
QARS-238	ENST00000635231	LDHC	P07864	332 aa		12.89	□□□□□ -0.35
QARS-238	ENST00000635231	GNAI3	P08754	354 aa		12.89	□□□□□ -0.35
QARS-238	ENST00000635231	TIMM10	P62072	90 aa		12.89	□□□□□ -0.35
QARS-238	ENST00000635231	PICALM	Q13492	652 aa		12.89	□□□□□ -0.35
QARS-238	ENST00000635231	CHRDL2	Q6WN34	429 aa		12.89	□□□□□ -0.35
QARS-238	ENST00000635231	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		12.89	□□□□□ -0.35
QARS-238	ENST00000635231	U2AF1L4	Q8WU68	220 aa	Known RBP	12.89	□□□□□ -0.35
QARS-238	ENST00000635231	PNMA3	Q9UL41	463 aa		12.89	□□□□□ -0.35
QARS-238	ENST00000635231	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		12.89	□□□□□ -0.35
QARS-238	ENST00000635231	MROH7-TTC4	A0A0A0MT08	1334 aa		12.88	□□□□□ -0.35
QARS-238	ENST00000635231	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		12.88	□□□□□ -0.35
QARS-238	ENST00000635231		A0A1B0GUL7	405 aa		12.88	□□□□□ -0.35
QARS-238	ENST00000635231	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
QARS-238	ENST00000635231	TRIM75P	A6NK02	468 aa		12.88	□□□□□ -0.35
QARS-238	ENST00000635231	TBC1D12	O60347	775 aa		12.88	□□□□□ -0.35
QARS-238	ENST00000635231	NPM3	O75607	178 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
QARS-238	ENST00000635231	FARP2	O94887	1054 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
QARS-238	ENST00000635231	FLT3LG	P49771	235 aa		12.88	□□□□□ -0.35
QARS-238	ENST00000635231	GSTO1	P78417	241 aa		12.88	□□□□□ -0.35
QARS-238	ENST00000635231	IRF5	Q13568	498 aa		12.88	□□□□□ -0.35
QARS-238	ENST00000635231	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		12.88	□□□□□ -0.35
QARS-238	ENST00000635231	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
QARS-238	ENST00000635231	PXYLP1	Q8TE99	480 aa		12.88	□□□□□ -0.35
QARS-238	ENST00000635231	COA7	Q96BR5	231 aa		12.88	□□□□□ -0.35
QARS-238	ENST00000635231	XAGE2	Q96GT9	111 aa		12.88	□□□□□ -0.35
QARS-238	ENST00000635231	MEIS3	Q99687	375 aa		12.88	□□□□□ -0.35
QARS-238	ENST00000635231	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
QARS-238	ENST00000635231	GABRQ	Q9UN88	632 aa		12.88	□□□□□ -0.35
QARS-238	ENST00000635231	AGTPBP1	Q9UPW5	1226 aa		12.88	□□□□□ -0.35
QARS-238	ENST00000635231	TRIOBP	Q9H2D6	2365 aa		12.87	□□□□□ -0.35
QARS-238	ENST00000635231	SRGAP3	O43295	1099 aa		12.87	□□□□□ -0.35
QARS-238	ENST00000635231	SGPL1	O95470	568 aa		12.87	□□□□□ -0.35
QARS-238	ENST00000635231	MECOM	Q03112	1051 aa		12.87	□□□□□ -0.35
QARS-238	ENST00000635231	GORAB	Q5T7V8	394 aa		12.87	□□□□□ -0.35
QARS-238	ENST00000635231	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		12.87	□□□□□ -0.35
QARS-238	ENST00000635231	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		12.87	□□□□□ -0.35
QARS-238	ENST00000635231	OSBPL5	Q9H0X9	879 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
QARS-238	ENST00000635231	UNC93B1	Q9H1C4	597 aa		12.87	□□□□□ -0.35
QARS-238	ENST00000635231	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	12.87	□□□□□ -0.35	3e-7	■■■□□ 16.9
QARS-238	ENST00000635231	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		12.86	□□□□□ -0.35
QARS-238	ENST00000635231	INHA	P05111	366 aa		12.86	□□□□□ -0.35
QARS-238	ENST00000635231	TFCP2	Q12800	502 aa		12.86	□□□□□ -0.35
QARS-238	ENST00000635231	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	12.86	□□□□□ -0.35	7e-6	■■□□□ 12.3
QARS-238	ENST00000635231	MTX1	Q13505	466 aa		12.86	□□□□□ -0.35
QARS-238	ENST00000635231	PROCA1	Q8NCQ7	364 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
QARS-238	ENST00000635231	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		12.86	□□□□□ -0.35
QARS-238	ENST00000635231	AK9	Q5TCS8	1911 aa		12.86	□□□□□ -0.35
QARS-238	ENST00000635231	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
QARS-238	ENST00000635231	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	12.85	□□□□□ -0.35
QARS-238	ENST00000635231	RHBDL3	P58872	404 aa		12.85	□□□□□ -0.35
QARS-238	ENST00000635231	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		12.85	□□□□□ -0.35
QARS-238	ENST00000635231	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		12.85	□□□□□ -0.35
QARS-238	ENST00000635231	SPATA5	Q8NB90	893 aa		12.85	□□□□□ -0.35
QARS-238	ENST00000635231	ZNF280C	Q8ND82	737 aa		12.85	□□□□□ -0.35
QARS-238	ENST00000635231	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
QARS-238	ENST00000635231	RAI14	Q9P0K7	980 aa		12.85	□□□□□ -0.35
QARS-238	ENST00000635231	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		12.85	□□□□□ -0.35
QARS-238	ENST00000635231	RBM27	Q9P2N5	1060 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
QARS-238	ENST00000635231	TAOK2	Q9UL54	1235 aa		12.85	□□□□□ -0.35
QARS-238	ENST00000635231	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		12.85	□□□□□ -0.35
QARS-238	ENST00000635231	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
QARS-238	ENST00000635231	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
QARS-238	ENST00000635231	SLURP2	P0DP57	97 aa		12.84	□□□□□ -0.35
QARS-238	ENST00000635231	ELN	P15502	786 aa		12.84	□□□□□ -0.35
QARS-238	ENST00000635231	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
QARS-238	ENST00000635231	SPP2	Q13103	211 aa		12.84	□□□□□ -0.35
QARS-238	ENST00000635231	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	12.84	□□□□□ -0.35	4e-7	■■■□□ 14.9

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