RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622362.1

FAM200B-223, Transcript of family with sequence similarity 200 member B, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM200B, Length 4,377 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM200B-223	ENST00000622362	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		13.16	□□□□□ -0.3
FAM200B-223	ENST00000622362	PYCARD	Q9ULZ3	195 aa		13.16	□□□□□ -0.3
FAM200B-223	ENST00000622362	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	13.16	□□□□□ -0.3
FAM200B-223	ENST00000622362	PEX19	P40855	299 aa		13.16	□□□□□ -0.3
FAM200B-223	ENST00000622362	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		13.16	□□□□□ -0.3
FAM200B-223	ENST00000622362	CCDC63	Q8NA47	563 aa		13.16	□□□□□ -0.3
FAM200B-223	ENST00000622362	MIPOL1	Q8TD10	442 aa		13.16	□□□□□ -0.3
FAM200B-223	ENST00000622362	NAP1L3	Q99457	506 aa	Predicted RBP	13.16	□□□□□ -0.3
FAM200B-223	ENST00000622362	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	13.16	□□□□□ -0.3
FAM200B-223	ENST00000622362	TUBB2A	Q13885	445 aa		13.16	□□□□□ -0.3
FAM200B-223	ENST00000622362	CCDC174	Q6PII3	467 aa		13.16	□□□□□ -0.3
FAM200B-223	ENST00000622362	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		13.16	□□□□□ -0.3
FAM200B-223	ENST00000622362	SLF1	Q9BQI6	1058 aa		13.16	□□□□□ -0.3
FAM200B-223	ENST00000622362	TUBB2B	Q9BVA1	445 aa		13.16	□□□□□ -0.3
FAM200B-223	ENST00000622362	KRT23	Q9C075	422 aa		13.16	□□□□□ -0.3
FAM200B-223	ENST00000622362	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		13.16	□□□□□ -0.3
FAM200B-223	ENST00000622362	ZNF202	O95125	648 aa		13.16	□□□□□ -0.3
FAM200B-223	ENST00000622362	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		13.16	□□□□□ -0.3
FAM200B-223	ENST00000622362	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		13.16	□□□□□ -0.3
FAM200B-223	ENST00000622362	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		13.15	□□□□□ -0.3
FAM200B-223	ENST00000622362	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		13.15	□□□□□ -0.3
FAM200B-223	ENST00000622362	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		13.15	□□□□□ -0.3
FAM200B-223	ENST00000622362	FER	P16591	822 aa		13.15	□□□□□ -0.3
FAM200B-223	ENST00000622362	CEP85L	Q5SZL2	805 aa		13.15	□□□□□ -0.3
FAM200B-223	ENST00000622362	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		13.15	□□□□□ -0.3
FAM200B-223	ENST00000622362	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		13.15	□□□□□ -0.3
FAM200B-223	ENST00000622362		E7EVH7	732 aa		13.15	□□□□□ -0.3
FAM200B-223	ENST00000622362	NEDD9	Q14511	834 aa		13.15	□□□□□ -0.3
FAM200B-223	ENST00000622362	ANO1	Q5XXA6	986 aa		13.15	□□□□□ -0.3
FAM200B-223	ENST00000622362	GPT2	Q8TD30	523 aa		13.15	□□□□□ -0.3
FAM200B-223	ENST00000622362	PPAN	Q9NQ55	473 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
FAM200B-223	ENST00000622362	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		13.15	□□□□□ -0.3
FAM200B-223	ENST00000622362	MCM7	P33993	719 aa		13.15	□□□□□ -0.3
FAM200B-223	ENST00000622362	COPS6	Q7L5N1	327 aa		13.15	□□□□□ -0.3
FAM200B-223	ENST00000622362	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		13.15	□□□□□ -0.3
FAM200B-223	ENST00000622362	TRIM7	Q9C029	511 aa		13.15	□□□□□ -0.3
FAM200B-223	ENST00000622362	PLEKHA4	Q9H4M7	779 aa		13.15	□□□□□ -0.3
FAM200B-223	ENST00000622362	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		13.15	□□□□□ -0.3
FAM200B-223	ENST00000622362	EPB41L3	Q9Y2J2	1087 aa	Predicted RBP	13.15	□□□□□ -0.3
FAM200B-223	ENST00000622362	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		13.15	□□□□□ -0.3
FAM200B-223	ENST00000622362	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	BICDL2	A1A5D9	508 aa		13.14	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	PPP1R7	Q15435	360 aa		13.14	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	CCDC38	Q502W7	563 aa		13.14	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	KIAA1524	Q8TCG1	905 aa		13.14	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	CUL5	Q93034	780 aa		13.14	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		13.14	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	PSMD1	Q99460	953 aa		13.14	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	DESI2	Q9BSY9	194 aa		13.14	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362		A0A1W2PP64	1363 aa		13.14	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	POLR2D	O15514	142 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	ADK	P55263	362 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		13.14	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	SAMM50	Q9Y512	469 aa		13.14	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	COMMD10	Q9Y6G5	202 aa		13.14	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	CYP26C1	Q6V0L0	522 aa		13.14	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		13.14	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	CACNA2D3	Q8IZS8	1091 aa		13.14	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	CCDC26	Q8TAB7	109 aa		13.14	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	CNNM2	Q9H8M5	875 aa		13.14	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	CABP5	Q9NP86	173 aa		13.14	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	GNGT1	P63211	74 aa		13.13	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		13.13	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	BRD3	Q15059	726 aa		13.13	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	ATP2B3	Q16720	1220 aa		13.13	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	TMTC1	Q8IUR5	882 aa		13.13	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	IFT20	Q8IY31	132 aa		13.13	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		13.13	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	JAKMIP2	Q96AA8	810 aa		13.13	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		13.13	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		13.13	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	CCDC50	Q8IVM0	306 aa		13.13	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	TRMT44	Q8IYL2	757 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	CCDC170	Q8IYT3	715 aa		13.13	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	DDX41	Q9UJV9	622 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		13.13	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		13.13	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	SGSM2	O43147	1006 aa		13.13	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	RPS6KB1	P23443	525 aa		13.13	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	LRRC45	Q96CN5	670 aa		13.13	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	FAM114A2	Q9NRY5	505 aa		13.13	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		13.13	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	DIP2B	Q9P265	1576 aa		13.13	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	ATP1A2	P50993	1020 aa		13.13	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	KLHL7	Q8IXQ5	586 aa		13.13	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	ARHGEF2	Q92974	986 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	JAK2	O60674	1132 aa		13.12	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	PSMC4	P43686	418 aa		13.12	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	E2F4	Q16254	413 aa		13.12	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	KRT71	Q3SY84	523 aa		13.12	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		13.12	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
FAM200B-223	ENST00000622362	TSNARE1	Q96NA8	513 aa		13.12	□□□□□ -0.31

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14 ms