RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597474.5

FCHO1-220, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 4

Gene FCHO1, Length 556 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-220ENST00000597474 PRKCZQ05513 592 aa16.17■□□□□ 0.18
FCHO1-220ENST00000597474 CCDC102BQ68D86 513 aa16.17■□□□□ 0.18
FCHO1-220ENST00000597474 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
FCHO1-220ENST00000597474 IDI2Q9BXS1 227 aa16.17■□□□□ 0.18
FCHO1-220ENST00000597474 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
FCHO1-220ENST00000597474 LOC285556D6RIA3 1793 aa16.17■□□□□ 0.18
FCHO1-220ENST00000597474 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
FCHO1-220ENST00000597474 CXCL11O14625 94 aa16.16■□□□□ 0.18
FCHO1-220ENST00000597474 SEMA3EO15041 775 aa16.16■□□□□ 0.18
FCHO1-220ENST00000597474 HOXD10P28358 340 aa16.16■□□□□ 0.18
FCHO1-220ENST00000597474 RASGRF1Q13972 1273 aa16.16■□□□□ 0.18
FCHO1-220ENST00000597474 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
FCHO1-220ENST00000597474 SCYL3Q8IZE3 742 aa16.16■□□□□ 0.18
FCHO1-220ENST00000597474 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
FCHO1-220ENST00000597474 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
FCHO1-220ENST00000597474 GABRQQ9UN88 632 aa16.16■□□□□ 0.18
FCHO1-220ENST00000597474 COL6A3P12111 3177 aa16.16■□□□□ 0.18
FCHO1-220ENST00000597474 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
FCHO1-220ENST00000597474 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
FCHO1-220ENST00000597474 ENTPD3O75355 529 aa16.15■□□□□ 0.18
FCHO1-220ENST00000597474 CCL5P13501 91 aa16.15■□□□□ 0.18
FCHO1-220ENST00000597474 PTPRAP18433 802 aa16.15■□□□□ 0.18
FCHO1-220ENST00000597474 IL15P40933 162 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
FCHO1-220ENST00000597474 GJA8P48165 433 aa16.15■□□□□ 0.18
FCHO1-220ENST00000597474 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa16.15■□□□□ 0.18
FCHO1-220ENST00000597474 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
FCHO1-220ENST00000597474 MEIS3Q99687 375 aa16.15■□□□□ 0.18
FCHO1-220ENST00000597474 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
FCHO1-220ENST00000597474 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa16.15■□□□□ 0.18
FCHO1-220ENST00000597474 ZHX2Q9Y6X8 837 aa16.15■□□□□ 0.18
FCHO1-220ENST00000597474 LAMA3Q16787 3333 aa16.15■□□□□ 0.18
FCHO1-220ENST00000597474 SIPA1L1O43166 1804 aa16.15■□□□□ 0.18
FCHO1-220ENST00000597474 ZBTB22O15209 634 aa16.14■□□□□ 0.17
FCHO1-220ENST00000597474 GJB1P08034 283 aa16.14■□□□□ 0.17
FCHO1-220ENST00000597474 TIMM10P62072 90 aa16.14■□□□□ 0.17
FCHO1-220ENST00000597474 MAP3K10Q02779 954 aa16.14■□□□□ 0.17
FCHO1-220ENST00000597474 GADL1Q6ZQY3 521 aa16.14■□□□□ 0.17
FCHO1-220ENST00000597474 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
FCHO1-220ENST00000597474 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
FCHO1-220ENST00000597474 COPRSQ9NQ92 184 aa16.14■□□□□ 0.17
FCHO1-220ENST00000597474 ABCF2Q9UG63 623 aa16.14■□□□□ 0.17
FCHO1-220ENST00000597474 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
FCHO1-220ENST00000597474 FCGRTP55899 365 aa16.13■□□□□ 0.17
FCHO1-220ENST00000597474 CHRDL2Q6WN34 429 aa16.13■□□□□ 0.17
FCHO1-220ENST00000597474 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
FCHO1-220ENST00000597474 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
FCHO1-220ENST00000597474 ZNF384Q8TF68 577 aa16.13■□□□□ 0.17
FCHO1-220ENST00000597474 RNF208Q9H0X6 261 aa16.13■□□□□ 0.17
FCHO1-220ENST00000597474 PICK1Q9NRD5 415 aa16.13■□□□□ 0.17
FCHO1-220ENST00000597474 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
FCHO1-220ENST00000597474 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
FCHO1-220ENST00000597474 A0A0C4DFX4 3053 aa16.13■□□□□ 0.17
FCHO1-220ENST00000597474 DNAH12Q6ZR08 3092 aa16.13■□□□□ 0.17
FCHO1-220ENST00000597474 PLXNB2O15031 1838 aa16.12■□□□□ 0.17
FCHO1-220ENST00000597474 FOCADQ5VW36 1801 aa16.12■□□□□ 0.17
FCHO1-220ENST00000597474 BTDP43251 543 aa16.12■□□□□ 0.17
FCHO1-220ENST00000597474 PICALMQ13492 652 aa16.12■□□□□ 0.17
FCHO1-220ENST00000597474 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
FCHO1-220ENST00000597474 NKX2-3Q8TAU0 364 aa16.12■□□□□ 0.17
FCHO1-220ENST00000597474 DPF3Q92784 378 aa16.12■□□□□ 0.17
FCHO1-220ENST00000597474 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
FCHO1-220ENST00000597474 UNC93B1Q9H1C4 597 aa16.12■□□□□ 0.17
FCHO1-220ENST00000597474 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa16.12■□□□□ 0.17
FCHO1-220ENST00000597474 A0A1B0GUL7 405 aa16.11■□□□□ 0.17
FCHO1-220ENST00000597474 TRIM75PA6NK02 468 aa16.11■□□□□ 0.17
FCHO1-220ENST00000597474 FAM196BA6NMK8 535 aa16.11■□□□□ 0.17
FCHO1-220ENST00000597474 ELNP15502 786 aa16.11■□□□□ 0.17
FCHO1-220ENST00000597474 RHBDL3P58872 404 aa16.11■□□□□ 0.17
FCHO1-220ENST00000597474 UBXN2AP68543 259 aa16.11■□□□□ 0.17
FCHO1-220ENST00000597474 SLAIN1Q8ND83 568 aa16.11■□□□□ 0.17
FCHO1-220ENST00000597474 XAGE2Q96GT9 111 aa16.11■□□□□ 0.17
FCHO1-220ENST00000597474 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
FCHO1-220ENST00000597474 MAST2Q6P0Q8 1798 aa16.1■□□□□ 0.17
FCHO1-220ENST00000597474 ADCY3O60266 1144 aa16.1■□□□□ 0.17
FCHO1-220ENST00000597474 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
FCHO1-220ENST00000597474 FLT3LGP49771 235 aa16.1■□□□□ 0.17
FCHO1-220ENST00000597474 MECOMQ03112 1051 aa16.1■□□□□ 0.17
FCHO1-220ENST00000597474 TFCP2Q12800 502 aa16.1■□□□□ 0.17
FCHO1-220ENST00000597474 PI16Q6UXB8 463 aa16.1■□□□□ 0.17
FCHO1-220ENST00000597474 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
FCHO1-220ENST00000597474 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
FCHO1-220ENST00000597474 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa16.1■□□□□ 0.17
FCHO1-220ENST00000597474 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa16.09■□□□□ 0.17
FCHO1-220ENST00000597474 TREML2Q5T2D2 321 aa16.09■□□□□ 0.17
FCHO1-220ENST00000597474 SLF2Q8IX21 1173 aa16.09■□□□□ 0.17
FCHO1-220ENST00000597474 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
FCHO1-220ENST00000597474 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
FCHO1-220ENST00000597474 SRGAP3O43295 1099 aa16.08■□□□□ 0.16
FCHO1-220ENST00000597474 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
FCHO1-220ENST00000597474 INHAP05111 366 aa16.08■□□□□ 0.16
FCHO1-220ENST00000597474 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
FCHO1-220ENST00000597474 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
FCHO1-220ENST00000597474 ERICH6Q7L0X2 663 aa16.08■□□□□ 0.16
FCHO1-220ENST00000597474 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
FCHO1-220ENST00000597474 PRO3102Q9H379 93 aa16.08■□□□□ 0.16
FCHO1-220ENST00000597474 HMG20BQ9P0W2 317 aa16.08■□□□□ 0.16
FCHO1-220ENST00000597474 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa16.08■□□□□ 0.16
FCHO1-220ENST00000597474 HDAC5Q9UQL6 1122 aa16.08■□□□□ 0.16
FCHO1-220ENST00000597474 SGPL1O95470 568 aa16.07■□□□□ 0.16
FCHO1-220ENST00000597474 RARSP54136 660 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.5 ms