RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597259.1

HERC3-212, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 2

Gene HERC3, Length 313 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-212ENST00000597259 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
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HERC3-212ENST00000597259 SASH3O75995 380 aa7.66□□□□□ -1.18
HERC3-212ENST00000597259 EPB42P16452 691 aa7.66□□□□□ -1.18
HERC3-212ENST00000597259 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
HERC3-212ENST00000597259 DGKZQ13574 1117 aa7.66□□□□□ -1.18
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HERC3-212ENST00000597259 ERICH6Q7L0X2 663 aa7.66□□□□□ -1.18
HERC3-212ENST00000597259 DEFB132Q7Z7B7 95 aa7.66□□□□□ -1.18
HERC3-212ENST00000597259 TRPM4Q8TD43 1214 aa7.66□□□□□ -1.18
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HERC3-212ENST00000597259 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa7.66□□□□□ -1.18
HERC3-212ENST00000597259 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
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HERC3-212ENST00000597259 NUP188Q5SRE5 1749 aa7.63□□□□□ -1.19
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HERC3-212ENST00000597259 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
HERC3-212ENST00000597259 NME9Q86XW9 330 aa7.58□□□□□ -1.2
HERC3-212ENST00000597259 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
HERC3-212ENST00000597259 CAMKK2Q96RR4 588 aa7.58□□□□□ -1.2
HERC3-212ENST00000597259 PCMTD2Q9NV79 361 aa7.58□□□□□ -1.2
HERC3-212ENST00000597259 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
HERC3-212ENST00000597259 USP35Q9P2H5 1018 aa7.58□□□□□ -1.2
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