RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 ABCF2Q9UG63 623 aa31.84■■■□□ 2.69
CAPNS1-211ENST00000590874 HDAC5Q9UQL6 1122 aa31.84■■■□□ 2.69
CAPNS1-211ENST00000590874 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP31.84■■■□□ 2.69
CAPNS1-211ENST00000590874 ZHX2Q9Y6X8 837 aa31.84■■■□□ 2.69
CAPNS1-211ENST00000590874 DOCK2Q92608 1830 aa31.84■■■□□ 2.69
CAPNS1-211ENST00000590874 AK9Q5TCS8 1911 aa31.83■■■□□ 2.69
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP31.83■■■□□ 2.69
CAPNS1-211ENST00000590874 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP31.83■■■□□ 2.69
CAPNS1-211ENST00000590874 PTPRAP18433 802 aa31.83■■■□□ 2.69
CAPNS1-211ENST00000590874 GRK4P32298 578 aa31.83■■■□□ 2.69
CAPNS1-211ENST00000590874 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP31.83■■■□□ 2.69
CAPNS1-211ENST00000590874 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP31.83■■■□□ 2.69
CAPNS1-211ENST00000590874 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP31.83■■■□□ 2.69
CAPNS1-211ENST00000590874 PICK1Q9NRD5 415 aa31.83■■■□□ 2.69
CAPNS1-211ENST00000590874 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP31.82■■■□□ 2.68
CAPNS1-211ENST00000590874 H0YGN5 161 aa31.81■■■□□ 2.68
CAPNS1-211ENST00000590874 BTDP43251 543 aa31.81■■■□□ 2.68
CAPNS1-211ENST00000590874 MAP3K10Q02779 954 aa31.81■■■□□ 2.68
CAPNS1-211ENST00000590874 PRKCZQ05513 592 aa31.81■■■□□ 2.68
CAPNS1-211ENST00000590874 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa31.81■■■□□ 2.68
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A1B0GUL7 405 aa31.8■■■□□ 2.68
CAPNS1-211ENST00000590874 FCGRTP55899 365 aa31.8■■■□□ 2.68
CAPNS1-211ENST00000590874 PICALMQ13492 652 aa31.8■■■□□ 2.68
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP31.8■■■□□ 2.68
CAPNS1-211ENST00000590874 XAGE2Q96GT9 111 aa31.8■■■□□ 2.68
CAPNS1-211ENST00000590874 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP31.8■■■□□ 2.68
CAPNS1-211ENST00000590874 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa31.79■■■□□ 2.68
CAPNS1-211ENST00000590874 MYH2Q9UKX2 1941 aa31.79■■■□□ 2.68
CAPNS1-211ENST00000590874 TFCP2Q12800 502 aa31.79■■■□□ 2.68
CAPNS1-211ENST00000590874 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP31.79■■■□□ 2.68
CAPNS1-211ENST00000590874 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP31.79■■■□□ 2.68
CAPNS1-211ENST00000590874 GADL1Q6ZQY3 521 aa31.78■■■□□ 2.68
CAPNS1-211ENST00000590874 SLF2Q8IX21 1173 aa31.78■■■□□ 2.68
CAPNS1-211ENST00000590874 GABRQQ9UN88 632 aa31.78■■■□□ 2.68
CAPNS1-211ENST00000590874 SRGAP3O43295 1099 aa31.77■■■□□ 2.68
CAPNS1-211ENST00000590874 CCL5P13501 91 aa31.77■■■□□ 2.68
CAPNS1-211ENST00000590874 RARSP54136 660 aaKnown RBP31.77■■■□□ 2.68
CAPNS1-211ENST00000590874 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP31.77■■■□□ 2.68
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF384Q8TF68 577 aa31.77■■■□□ 2.68
CAPNS1-211ENST00000590874 GJA8P48165 433 aa31.76■■■□□ 2.67
CAPNS1-211ENST00000590874 RHBDL3P58872 404 aa31.76■■■□□ 2.67
CAPNS1-211ENST00000590874 MECOMQ03112 1051 aa31.76■■■□□ 2.67
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP31.76■■■□□ 2.67
CAPNS1-211ENST00000590874 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP31.75■■■□□ 2.67
CAPNS1-211ENST00000590874 GJB1P08034 283 aa31.75■■■□□ 2.67
CAPNS1-211ENST00000590874 MTX1Q13505 466 aa31.75■■■□□ 2.67
CAPNS1-211ENST00000590874 MVPQ14764 893 aaKnown RBP31.75■■■□□ 2.67
CAPNS1-211ENST00000590874 NKX2-3Q8TAU0 364 aa31.75■■■□□ 2.67
CAPNS1-211ENST00000590874 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP31.75■■■□□ 2.67
CAPNS1-211ENST00000590874 AKAP2Q9Y2D5 859 aa31.75■■■□□ 2.67
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa31.75■■■□□ 2.67
CAPNS1-211ENST00000590874 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa31.74■■■□□ 2.67
CAPNS1-211ENST00000590874 TRIM75PA6NK02 468 aa31.74■■■□□ 2.67
CAPNS1-211ENST00000590874 ERICH6Q7L0X2 663 aa31.74■■■□□ 2.67
CAPNS1-211ENST00000590874 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa31.74■■■□□ 2.67
CAPNS1-211ENST00000590874 RNF208Q9H0X6 261 aa31.74■■■□□ 2.67
CAPNS1-211ENST00000590874 GNAI3P08754 354 aa31.73■■■□□ 2.67
CAPNS1-211ENST00000590874 PI16Q6UXB8 463 aa31.73■■■□□ 2.67
CAPNS1-211ENST00000590874 SLAIN1Q8ND83 568 aa31.73■■■□□ 2.67
CAPNS1-211ENST00000590874 HMG20BQ9P0W2 317 aa31.73■■■□□ 2.67
CAPNS1-211ENST00000590874 DOCK1Q14185 1865 aa31.73■■■□□ 2.67
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM196BA6NMK8 535 aa31.72■■■□□ 2.67
CAPNS1-211ENST00000590874 UBXN2AP68543 259 aa31.72■■■□□ 2.67
CAPNS1-211ENST00000590874 ARHGAP45Q92619 1136 aa31.72■■■□□ 2.67
CAPNS1-211ENST00000590874 DPF3Q92784 378 aa31.71■■■□□ 2.67
CAPNS1-211ENST00000590874 NEUROD6Q96NK8 337 aa31.71■■■□□ 2.67
CAPNS1-211ENST00000590874 PHIPQ8WWQ0 1821 aa31.7■■■□□ 2.67
CAPNS1-211ENST00000590874 FLT3LGP49771 235 aa31.7■■■□□ 2.67
CAPNS1-211ENST00000590874 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa31.7■■■□□ 2.67
CAPNS1-211ENST00000590874 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP31.7■■■□□ 2.67
CAPNS1-211ENST00000590874 UNC93B1Q9H1C4 597 aa31.7■■■□□ 2.67
CAPNS1-211ENST00000590874 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa31.7■■■□□ 2.67
CAPNS1-211ENST00000590874 TBC1D12O60347 775 aa31.69■■■□□ 2.66
CAPNS1-211ENST00000590874 SPATA5Q8NB90 893 aa31.69■■■□□ 2.66
CAPNS1-211ENST00000590874 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP31.69■■■□□ 2.66
CAPNS1-211ENST00000590874 MGAMO43451 1857 aa31.69■■■□□ 2.66
CAPNS1-211ENST00000590874 ADCY3O60266 1144 aa31.68■■■□□ 2.66
CAPNS1-211ENST00000590874 NPM3O75607 178 aaKnown RBP31.68■■■□□ 2.66
CAPNS1-211ENST00000590874 ELNP15502 786 aa31.68■■■□□ 2.66
CAPNS1-211ENST00000590874 TREML2Q5T2D2 321 aa31.68■■■□□ 2.66
CAPNS1-211ENST00000590874 CHRDL2Q6WN34 429 aa31.68■■■□□ 2.66
CAPNS1-211ENST00000590874 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP31.68■■■□□ 2.66
CAPNS1-211ENST00000590874 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP31.68■■■□□ 2.66
CAPNS1-211ENST00000590874 PTPRFP10586 1907 aa31.68■■■□□ 2.66
CAPNS1-211ENST00000590874 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP31.67■■■□□ 2.66
CAPNS1-211ENST00000590874 TNNQ9UQP3 1299 aa31.67■■■□□ 2.66
CAPNS1-211ENST00000590874 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa31.66■■■□□ 2.66
CAPNS1-211ENST00000590874 INHAP05111 366 aa31.65■■■□□ 2.66
CAPNS1-211ENST00000590874 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP31.65■■■□□ 2.66
CAPNS1-211ENST00000590874 GSTO1P78417 241 aa31.65■■■□□ 2.66
CAPNS1-211ENST00000590874 GORABQ5T7V8 394 aa31.65■■■□□ 2.66
CAPNS1-211ENST00000590874 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP31.65■■■□□ 2.66
CAPNS1-211ENST00000590874 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP31.65■■■□□ 2.66
CAPNS1-211ENST00000590874 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa31.64■■■□□ 2.66
CAPNS1-211ENST00000590874 TRIM27P14373 513 aa31.64■■■□□ 2.66
CAPNS1-211ENST00000590874 IRF5Q13568 498 aa31.64■■■□□ 2.66
CAPNS1-211ENST00000590874 HTATIP2Q9BUP3 242 aa31.64■■■□□ 2.66
CAPNS1-211ENST00000590874 RAI14Q9P0K7 980 aa31.64■■■□□ 2.66
CAPNS1-211ENST00000590874 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP31.63■■■□□ 2.65
CAPNS1-211ENST00000590874 SGPL1O95470 568 aa31.63■■■□□ 2.65
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