RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589969.1

NFIC-209, Transcript of nuclear factor I C, humanhuman

TSL 3

Gene NFIC, Length 614 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIC-209ENST00000589969 ANKRD23Q86SG2 305 aa25.4■■□□□ 1.66
NFIC-209ENST00000589969 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
NFIC-209ENST00000589969 RAI14Q9P0K7 980 aa25.4■■□□□ 1.66
NFIC-209ENST00000589969 AK9Q5TCS8 1911 aa25.39■■□□□ 1.66
NFIC-209ENST00000589969 PHF20L1A8MW92 1017 aa25.39■■□□□ 1.66
NFIC-209ENST00000589969 CXCL11O14625 94 aa25.39■■□□□ 1.66
NFIC-209ENST00000589969 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
NFIC-209ENST00000589969 SURF6O75683 361 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
NFIC-209ENST00000589969 KIF22Q14807 665 aa25.39■■□□□ 1.66
NFIC-209ENST00000589969 CCDC158Q5M9N0 1113 aa25.39■■□□□ 1.66
NFIC-209ENST00000589969 PI16Q6UXB8 463 aa25.39■■□□□ 1.66
NFIC-209ENST00000589969 PICK1Q9NRD5 415 aa25.39■■□□□ 1.66
NFIC-209ENST00000589969 HTTP42858 3142 aa25.38■■□□□ 1.65
NFIC-209ENST00000589969 MCAMP43121 646 aa25.38■■□□□ 1.65
NFIC-209ENST00000589969 RHBDL3P58872 404 aa25.38■■□□□ 1.65
NFIC-209ENST00000589969 PICALMQ13492 652 aa25.38■■□□□ 1.65
NFIC-209ENST00000589969 TNNI3KQ59H18 835 aa25.38■■□□□ 1.65
NFIC-209ENST00000589969 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa25.38■■□□□ 1.65
NFIC-209ENST00000589969 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa25.38■■□□□ 1.65
NFIC-209ENST00000589969 SCYL3Q8IZE3 742 aa25.38■■□□□ 1.65
NFIC-209ENST00000589969 ZNF384Q8TF68 577 aa25.38■■□□□ 1.65
NFIC-209ENST00000589969 ARMC5Q96C12 935 aa25.38■■□□□ 1.65
NFIC-209ENST00000589969 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
NFIC-209ENST00000589969 LRP2BPQ9P2M1 347 aa25.38■■□□□ 1.65
NFIC-209ENST00000589969 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
NFIC-209ENST00000589969 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa25.38■■□□□ 1.65
NFIC-209ENST00000589969 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
NFIC-209ENST00000589969 IGSF3O75054 1194 aa25.37■■□□□ 1.65
NFIC-209ENST00000589969 GNRH1P01148 92 aa25.37■■□□□ 1.65
NFIC-209ENST00000589969 TTC39AQ5SRH9 613 aa25.37■■□□□ 1.65
NFIC-209ENST00000589969 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
NFIC-209ENST00000589969 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
NFIC-209ENST00000589969 RLBP1P12271 317 aa25.36■■□□□ 1.65
NFIC-209ENST00000589969 C1orf115Q9H7X2 142 aa25.36■■□□□ 1.65
NFIC-209ENST00000589969 PDHXO00330 501 aa25.35■■□□□ 1.65
NFIC-209ENST00000589969 TBC1D12O60347 775 aa25.35■■□□□ 1.65
NFIC-209ENST00000589969 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
NFIC-209ENST00000589969 CAP1Q01518 475 aa25.35■■□□□ 1.65
NFIC-209ENST00000589969 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
NFIC-209ENST00000589969 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
NFIC-209ENST00000589969 ZHX2Q9Y6X8 837 aa25.35■■□□□ 1.65
NFIC-209ENST00000589969 MS4A1P11836 297 aa25.34■■□□□ 1.65
NFIC-209ENST00000589969 PTPRAP18433 802 aa25.34■■□□□ 1.65
NFIC-209ENST00000589969 C17orf99Q6UX52 265 aa25.34■■□□□ 1.65
NFIC-209ENST00000589969 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
NFIC-209ENST00000589969 NBPF11Q86T75 865 aa25.34■■□□□ 1.65
NFIC-209ENST00000589969 PRMT2P55345 433 aa25.33■■□□□ 1.65
NFIC-209ENST00000589969 MOGSQ13724 837 aa25.33■■□□□ 1.65
NFIC-209ENST00000589969 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
NFIC-209ENST00000589969 DBNDD2Q9BQY9 259 aa25.33■■□□□ 1.65
NFIC-209ENST00000589969 DOCK2Q92608 1830 aa25.33■■□□□ 1.64
NFIC-209ENST00000589969 BAG3O95817 575 aa25.32■■□□□ 1.64
NFIC-209ENST00000589969 PLCG2P16885 1265 aa25.32■■□□□ 1.64
NFIC-209ENST00000589969 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
NFIC-209ENST00000589969 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa25.32■■□□□ 1.64
NFIC-209ENST00000589969 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
NFIC-209ENST00000589969 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
NFIC-209ENST00000589969 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa25.31■■□□□ 1.64
NFIC-209ENST00000589969 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
NFIC-209ENST00000589969 TEX11Q8IYF3 940 aa25.31■■□□□ 1.64
NFIC-209ENST00000589969 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
NFIC-209ENST00000589969 SNRKQ9NRH2 765 aa25.31■■□□□ 1.64
NFIC-209ENST00000589969 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa25.31■■□□□ 1.64
NFIC-209ENST00000589969 CEP85Q6P2H3 762 aa25.3■■□□□ 1.64
NFIC-209ENST00000589969 ERC1Q8IUD2 1116 aa25.3■■□□□ 1.64
NFIC-209ENST00000589969 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP25.3■■□□□ 1.64
NFIC-209ENST00000589969 CPA4Q9UI42 421 aa25.3■■□□□ 1.64
NFIC-209ENST00000589969 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa25.3■■□□□ 1.64
NFIC-209ENST00000589969 PPP4CP60510 307 aa25.29■■□□□ 1.64
NFIC-209ENST00000589969 GPAT2Q6NUI2 795 aa25.29■■□□□ 1.64
NFIC-209ENST00000589969 ZNF333Q96JL9 665 aa25.29■■□□□ 1.64
NFIC-209ENST00000589969 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa25.29■■□□□ 1.64
NFIC-209ENST00000589969 ADGRA2Q96PE1 1338 aa25.29■■□□□ 1.64
NFIC-209ENST00000589969 CENPFP49454 3210 aa25.29■■□□□ 1.64
NFIC-209ENST00000589969 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
NFIC-209ENST00000589969 HOXD10P28358 340 aa25.28■■□□□ 1.64
NFIC-209ENST00000589969 TMEM106CQ9BVX2 250 aa25.28■■□□□ 1.64
NFIC-209ENST00000589969 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa25.28■■□□□ 1.64
NFIC-209ENST00000589969 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
NFIC-209ENST00000589969 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
NFIC-209ENST00000589969 POTEFA5A3E0 1075 aa25.27■■□□□ 1.64
NFIC-209ENST00000589969 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa25.27■■□□□ 1.64
NFIC-209ENST00000589969 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
NFIC-209ENST00000589969 PANK1Q8TE04 598 aa25.27■■□□□ 1.64
NFIC-209ENST00000589969 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
NFIC-209ENST00000589969 TBC1D2Q9BYX2 928 aa25.27■■□□□ 1.64
NFIC-209ENST00000589969 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
NFIC-209ENST00000589969 PSMC4P43686 418 aa25.26■■□□□ 1.63
NFIC-209ENST00000589969 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
NFIC-209ENST00000589969 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP25.26■■□□□ 1.63
NFIC-209ENST00000589969 PI4KBQ9UBF8 816 aa25.26■■□□□ 1.63
NFIC-209ENST00000589969 SLURP2P0DP57 97 aa25.25■■□□□ 1.63
NFIC-209ENST00000589969 ZAP70P43403 619 aa25.25■■□□□ 1.63
NFIC-209ENST00000589969 GADL1Q6ZQY3 521 aa25.25■■□□□ 1.63
NFIC-209ENST00000589969 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
NFIC-209ENST00000589969 TRIM75PA6NK02 468 aa25.24■■□□□ 1.63
NFIC-209ENST00000589969 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
NFIC-209ENST00000589969 BCRP11274 1271 aa25.24■■□□□ 1.63
NFIC-209ENST00000589969 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
NFIC-209ENST00000589969 CERS3Q8IU89 383 aa25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms