RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580784.5

CSNK1D-215, Transcript of casein kinase 1 delta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSNK1D, Length 1,081 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1D-215ENST00000580784 TTC39AQ5SRH9 613 aa26.17■■□□□ 1.78
CSNK1D-215ENST00000580784 CEP85Q6P2H3 762 aa26.17■■□□□ 1.78
CSNK1D-215ENST00000580784 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
CSNK1D-215ENST00000580784 TRIM17Q9Y577 477 aa26.17■■□□□ 1.78
CSNK1D-215ENST00000580784 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
CSNK1D-215ENST00000580784 LDHCP07864 332 aa26.16■■□□□ 1.78
CSNK1D-215ENST00000580784 RHBDL3P58872 404 aa26.16■■□□□ 1.78
CSNK1D-215ENST00000580784 GSTO1P78417 241 aa26.16■■□□□ 1.78
CSNK1D-215ENST00000580784 OTOP1Q7RTM1 612 aa26.16■■□□□ 1.78
CSNK1D-215ENST00000580784 CD99L2Q8TCZ2 262 aa26.16■■□□□ 1.78
CSNK1D-215ENST00000580784 ERO1AQ96HE7 468 aa26.16■■□□□ 1.78
CSNK1D-215ENST00000580784 LRP2BPQ9P2M1 347 aa26.16■■□□□ 1.78
CSNK1D-215ENST00000580784 ATRNL1Q5VV63 1379 aa26.16■■□□□ 1.78
CSNK1D-215ENST00000580784 SP3Q02447 781 aa26.15■■□□□ 1.78
CSNK1D-215ENST00000580784 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa26.15■■□□□ 1.78
CSNK1D-215ENST00000580784 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
CSNK1D-215ENST00000580784 PHF20L1A8MW92 1017 aa26.14■■□□□ 1.78
CSNK1D-215ENST00000580784 BTBD19C9JJ37 291 aa26.14■■□□□ 1.78
CSNK1D-215ENST00000580784 SLURP2P0DP57 97 aa26.14■■□□□ 1.78
CSNK1D-215ENST00000580784 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
CSNK1D-215ENST00000580784 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
CSNK1D-215ENST00000580784 CAP1Q01518 475 aa26.13■■□□□ 1.77
CSNK1D-215ENST00000580784 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
CSNK1D-215ENST00000580784 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
CSNK1D-215ENST00000580784 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
CSNK1D-215ENST00000580784 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
CSNK1D-215ENST00000580784 MS4A1P11836 297 aa26.12■■□□□ 1.77
CSNK1D-215ENST00000580784 MAP3K10Q02779 954 aa26.12■■□□□ 1.77
CSNK1D-215ENST00000580784 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
CSNK1D-215ENST00000580784 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
CSNK1D-215ENST00000580784 KCNH4Q9UQ05 1017 aa26.11■■□□□ 1.77
CSNK1D-215ENST00000580784 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa26.11■■□□□ 1.77
CSNK1D-215ENST00000580784 EFCC1Q9HA90 598 aa26.1■■□□□ 1.77
CSNK1D-215ENST00000580784 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
CSNK1D-215ENST00000580784 COG6Q9Y2V7 657 aa26.1■■□□□ 1.77
CSNK1D-215ENST00000580784 NPM3O75607 178 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
CSNK1D-215ENST00000580784 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
CSNK1D-215ENST00000580784 ZAP70P43403 619 aa26.09■■□□□ 1.77
CSNK1D-215ENST00000580784 SCYL3Q8IZE3 742 aa26.09■■□□□ 1.77
CSNK1D-215ENST00000580784 PTPN22Q9Y2R2 807 aa26.09■■□□□ 1.77
CSNK1D-215ENST00000580784 HTTP42858 3142 aa26.09■■□□□ 1.77
CSNK1D-215ENST00000580784 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
CSNK1D-215ENST00000580784 TLR2O60603 784 aa26.08■■□□□ 1.77
CSNK1D-215ENST00000580784 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
CSNK1D-215ENST00000580784 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
CSNK1D-215ENST00000580784 RCAN3Q9UKA8 241 aa26.08■■□□□ 1.77
CSNK1D-215ENST00000580784 MOGSQ13724 837 aa26.07■■□□□ 1.76
CSNK1D-215ENST00000580784 TEX11Q8IYF3 940 aa26.07■■□□□ 1.76
CSNK1D-215ENST00000580784 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
CSNK1D-215ENST00000580784 PICK1Q9NRD5 415 aa26.07■■□□□ 1.76
CSNK1D-215ENST00000580784 ZHX2Q9Y6X8 837 aa26.07■■□□□ 1.76
CSNK1D-215ENST00000580784 MAST2Q6P0Q8 1798 aa26.06■■□□□ 1.76
CSNK1D-215ENST00000580784 PTPRAP18433 802 aa26.06■■□□□ 1.76
CSNK1D-215ENST00000580784 ANKRD23Q86SG2 305 aa26.06■■□□□ 1.76
CSNK1D-215ENST00000580784 ADGRA1Q86SQ6 560 aa26.06■■□□□ 1.76
CSNK1D-215ENST00000580784 ERC1Q8IUD2 1116 aa26.06■■□□□ 1.76
CSNK1D-215ENST00000580784 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
CSNK1D-215ENST00000580784 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
CSNK1D-215ENST00000580784 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP26.06■■□□□ 1.76
CSNK1D-215ENST00000580784 DOCK1Q14185 1865 aa26.05■■□□□ 1.76
CSNK1D-215ENST00000580784 FAM196BA6NMK8 535 aa26.05■■□□□ 1.76
CSNK1D-215ENST00000580784 PDHXO00330 501 aa26.05■■□□□ 1.76
CSNK1D-215ENST00000580784 CXCL11O14625 94 aa26.05■■□□□ 1.76
CSNK1D-215ENST00000580784 TBC1D12O60347 775 aa26.05■■□□□ 1.76
CSNK1D-215ENST00000580784 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
CSNK1D-215ENST00000580784 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa26.05■■□□□ 1.76
CSNK1D-215ENST00000580784 DDX19BQ9UMR2 479 aa26.05■■□□□ 1.76
CSNK1D-215ENST00000580784 PHIPQ8WWQ0 1821 aa26.04■■□□□ 1.76
CSNK1D-215ENST00000580784 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa26.04■■□□□ 1.76
CSNK1D-215ENST00000580784 CENPFP49454 3210 aa26.04■■□□□ 1.76
CSNK1D-215ENST00000580784 BAG3O95817 575 aa26.04■■□□□ 1.76
CSNK1D-215ENST00000580784 AACSQ86V21 672 aa26.04■■□□□ 1.76
CSNK1D-215ENST00000580784 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
CSNK1D-215ENST00000580784 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP26.04■■□□□ 1.767e-6■□□□□ 9.9
CSNK1D-215ENST00000580784 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa26.04■■□□□ 1.76
CSNK1D-215ENST00000580784 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa26.04■■□□□ 1.76
CSNK1D-215ENST00000580784 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa26.04■■□□□ 1.76
CSNK1D-215ENST00000580784 PPP4CP60510 307 aa26.03■■□□□ 1.76
CSNK1D-215ENST00000580784 SIRT2Q8IXJ6 389 aa26.03■■□□□ 1.76
CSNK1D-215ENST00000580784 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
CSNK1D-215ENST00000580784 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa26.03■■□□□ 1.76
CSNK1D-215ENST00000580784 ARHGEF6Q15052 776 aa26.02■■□□□ 1.76
CSNK1D-215ENST00000580784 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa26.02■■□□□ 1.76
CSNK1D-215ENST00000580784 GPAT2Q6NUI2 795 aa26.02■■□□□ 1.76
CSNK1D-215ENST00000580784 C17orf99Q6UX52 265 aa26.02■■□□□ 1.76
CSNK1D-215ENST00000580784 RHPN1Q8TCX5 695 aa26.02■■□□□ 1.76
CSNK1D-215ENST00000580784 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa26.02■■□□□ 1.76
CSNK1D-215ENST00000580784 CPA4Q9UI42 421 aa26.02■■□□□ 1.76
CSNK1D-215ENST00000580784 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
CSNK1D-215ENST00000580784 PTPRFP10586 1907 aa26.02■■□□□ 1.76
CSNK1D-215ENST00000580784 APBB1O00213 710 aa26.01■■□□□ 1.75
CSNK1D-215ENST00000580784 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
CSNK1D-215ENST00000580784 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa26.01■■□□□ 1.75
CSNK1D-215ENST00000580784 FOCADQ5VW36 1801 aa26■■□□□ 1.75
CSNK1D-215ENST00000580784 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
CSNK1D-215ENST00000580784 IDH1O75874 414 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
CSNK1D-215ENST00000580784 PLCG2P16885 1265 aa26■■□□□ 1.75
CSNK1D-215ENST00000580784 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
CSNK1D-215ENST00000580784 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
CSNK1D-215ENST00000580784 ANTXR1Q9H6X2 564 aa26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14 ms