RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580127.5

MKS1-209, Transcript of Meckel syndrome, type 1, humanhuman

TSL 5

Gene MKS1, Length 843 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1-209ENST00000580127 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
MKS1-209ENST00000580127 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
MKS1-209ENST00000580127 GSTO1P78417 241 aa22.14■■□□□ 1.13
MKS1-209ENST00000580127 ERICH6Q7L0X2 663 aa22.14■■□□□ 1.13
MKS1-209ENST00000580127 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
MKS1-209ENST00000580127 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa22.14■■□□□ 1.13
MKS1-209ENST00000580127 GAKO14976 1311 aa22.13■■□□□ 1.13
MKS1-209ENST00000580127 PHF20L1A8MW92 1017 aa22.13■■□□□ 1.13
MKS1-209ENST00000580127 SRGAP3O43295 1099 aa22.13■■□□□ 1.13
MKS1-209ENST00000580127 CAPN2P17655 700 aa22.13■■□□□ 1.13
MKS1-209ENST00000580127 PTPRAP18433 802 aa22.13■■□□□ 1.13
MKS1-209ENST00000580127 MAP3K10Q02779 954 aa22.13■■□□□ 1.13
MKS1-209ENST00000580127 GADL1Q6ZQY3 521 aa22.13■■□□□ 1.13
MKS1-209ENST00000580127 ZFPM1Q8IX07 1006 aa22.13■■□□□ 1.13
MKS1-209ENST00000580127 DPF3Q92784 378 aa22.13■■□□□ 1.13
MKS1-209ENST00000580127 NEUROD6Q96NK8 337 aa22.13■■□□□ 1.13
MKS1-209ENST00000580127 MOGSQ13724 837 aa22.12■■□□□ 1.13
MKS1-209ENST00000580127 RNF208Q9H0X6 261 aa22.12■■□□□ 1.13
MKS1-209ENST00000580127 CENPFP49454 3210 aa22.12■■□□□ 1.13
MKS1-209ENST00000580127 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
MKS1-209ENST00000580127 A0A1B0GUL7 405 aa22.11■■□□□ 1.13
MKS1-209ENST00000580127 GJB1P08034 283 aa22.11■■□□□ 1.13
MKS1-209ENST00000580127 ADORA1P30542 326 aa22.11■■□□□ 1.13
MKS1-209ENST00000580127 RASGRF1Q13972 1273 aa22.11■■□□□ 1.13
MKS1-209ENST00000580127 GPAT2Q6NUI2 795 aa22.11■■□□□ 1.13
MKS1-209ENST00000580127 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
MKS1-209ENST00000580127 SLAIN1Q8ND83 568 aa22.11■■□□□ 1.13
MKS1-209ENST00000580127 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
MKS1-209ENST00000580127 XAGE2Q96GT9 111 aa22.11■■□□□ 1.13
MKS1-209ENST00000580127 MEIS3Q99687 375 aa22.11■■□□□ 1.13
MKS1-209ENST00000580127 HTATIP2Q9BUP3 242 aa22.11■■□□□ 1.13
MKS1-209ENST00000580127 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa22.11■■□□□ 1.13
MKS1-209ENST00000580127 ADGRA2Q96PE1 1338 aa22.1■■□□□ 1.13
MKS1-209ENST00000580127 NPM3O75607 178 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
MKS1-209ENST00000580127 CYP2C8P10632 490 aa22.1■■□□□ 1.13
MKS1-209ENST00000580127 BCRP11274 1271 aa22.1■■□□□ 1.13
MKS1-209ENST00000580127 BTDP43251 543 aa22.1■■□□□ 1.13
MKS1-209ENST00000580127 PICALMQ13492 652 aa22.1■■□□□ 1.13
MKS1-209ENST00000580127 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa22.09■■□□□ 1.13
MKS1-209ENST00000580127 TBC1D12O60347 775 aa22.09■■□□□ 1.13
MKS1-209ENST00000580127 CCL5P13501 91 aa22.09■■□□□ 1.13
MKS1-209ENST00000580127 GJA8P48165 433 aa22.09■■□□□ 1.13
MKS1-209ENST00000580127 TFCP2Q12800 502 aa22.09■■□□□ 1.13
MKS1-209ENST00000580127 MTFR1Q15390 333 aa22.09■■□□□ 1.13
MKS1-209ENST00000580127 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
MKS1-209ENST00000580127 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
MKS1-209ENST00000580127 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa22.08■■□□□ 1.13
MKS1-209ENST00000580127 H0YGN5 161 aa22.08■■□□□ 1.13
MKS1-209ENST00000580127 CTGFP29279 349 aa22.08■■□□□ 1.13
MKS1-209ENST00000580127 RARSP54136 660 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
MKS1-209ENST00000580127 MECOMQ03112 1051 aa22.08■■□□□ 1.13
MKS1-209ENST00000580127 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP22.08■■□□□ 1.13
MKS1-209ENST00000580127 TBC1D2Q9BYX2 928 aa22.08■■□□□ 1.13
MKS1-209ENST00000580127 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP22.08■■□□□ 1.13
MKS1-209ENST00000580127 PNMA3Q9UL41 463 aa22.08■■□□□ 1.13
MKS1-209ENST00000580127 NR2E3Q9Y5X4 410 aa22.08■■□□□ 1.13
MKS1-209ENST00000580127 CEP290O15078 2479 aa22.08■■□□□ 1.13
MKS1-209ENST00000580127 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
MKS1-209ENST00000580127 PRKCZQ05513 592 aa22.07■■□□□ 1.12
MKS1-209ENST00000580127 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP22.07■■□□□ 1.12
MKS1-209ENST00000580127 MTX1Q13505 466 aa22.07■■□□□ 1.12
MKS1-209ENST00000580127 COA7Q96BR5 231 aa22.07■■□□□ 1.12
MKS1-209ENST00000580127 DOCK2Q92608 1830 aa22.06■■□□□ 1.12
MKS1-209ENST00000580127 TRIM75PA6NK02 468 aa22.06■■□□□ 1.12
MKS1-209ENST00000580127 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
MKS1-209ENST00000580127 ADCY3O60266 1144 aa22.06■■□□□ 1.12
MKS1-209ENST00000580127 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa22.06■■□□□ 1.12
MKS1-209ENST00000580127 SPATA5Q8NB90 893 aa22.06■■□□□ 1.12
MKS1-209ENST00000580127 PXYLP1Q8TE99 480 aa22.06■■□□□ 1.12
MKS1-209ENST00000580127 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
MKS1-209ENST00000580127 RAI14Q9P0K7 980 aa22.06■■□□□ 1.12
MKS1-209ENST00000580127 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa22.06■■□□□ 1.12
MKS1-209ENST00000580127 ATRNL1Q5VV63 1379 aa22.05■■□□□ 1.12
MKS1-209ENST00000580127 GNAI2P04899 355 aa22.05■■□□□ 1.12
MKS1-209ENST00000580127 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa22.05■■□□□ 1.12
MKS1-209ENST00000580127 LRP2BPQ9P2M1 347 aa22.05■■□□□ 1.12
MKS1-209ENST00000580127 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa22.05■■□□□ 1.12
MKS1-209ENST00000580127 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
MKS1-209ENST00000580127 FLT3LGP49771 235 aa22.04■■□□□ 1.12
MKS1-209ENST00000580127 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP22.04■■□□□ 1.12
MKS1-209ENST00000580127 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
MKS1-209ENST00000580127 MGAMO43451 1857 aa22.04■■□□□ 1.12
MKS1-209ENST00000580127 BAG3O95817 575 aa22.03■■□□□ 1.12
MKS1-209ENST00000580127 TFRCP02786 760 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
MKS1-209ENST00000580127 IRF5Q13568 498 aa22.03■■□□□ 1.12
MKS1-209ENST00000580127 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
MKS1-209ENST00000580127 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
MKS1-209ENST00000580127 HMG20BQ9P0W2 317 aa22.03■■□□□ 1.12
MKS1-209ENST00000580127 SGPL1O95470 568 aa22.02■■□□□ 1.12
MKS1-209ENST00000580127 PLCG2P16885 1265 aa22.02■■□□□ 1.12
MKS1-209ENST00000580127 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
MKS1-209ENST00000580127 RHBDL3P58872 404 aa22.02■■□□□ 1.12
MKS1-209ENST00000580127 ZNF280CQ8ND82 737 aa22.02■■□□□ 1.12
MKS1-209ENST00000580127 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
MKS1-209ENST00000580127 AS3MTQ9HBK9 375 aa22.02■■□□□ 1.12
MKS1-209ENST00000580127 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
MKS1-209ENST00000580127 GABRQQ9UN88 632 aa22.02■■□□□ 1.12
MKS1-209ENST00000580127 SPP2Q13103 211 aa22.01■■□□□ 1.11
MKS1-209ENST00000580127 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
MKS1-209ENST00000580127 SHISA4Q96DD7 197 aa22.01■■□□□ 1.11
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