RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568829.1

SPNS1-211, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 5

Gene SPNS1, Length 780 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-211ENST00000568829 NBPF11Q86T75 865 aa20.4■□□□□ 0.86
SPNS1-211ENST00000568829 SSH3Q8TE77 659 aa20.4■□□□□ 0.86
SPNS1-211ENST00000568829 CXCL11O14625 94 aa20.39■□□□□ 0.85
SPNS1-211ENST00000568829 BAG3O95817 575 aa20.39■□□□□ 0.85
SPNS1-211ENST00000568829 ANKRD23Q86SG2 305 aa20.39■□□□□ 0.85
SPNS1-211ENST00000568829 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
SPNS1-211ENST00000568829 KCNH4Q9UQ05 1017 aa20.39■□□□□ 0.85
SPNS1-211ENST00000568829 TNNQ9UQP3 1299 aa20.39■□□□□ 0.85
SPNS1-211ENST00000568829 BTBD19C9JJ37 291 aa20.38■□□□□ 0.85
SPNS1-211ENST00000568829 PLCG2P16885 1265 aa20.38■□□□□ 0.85
SPNS1-211ENST00000568829 PICALMQ13492 652 aa20.38■□□□□ 0.85
SPNS1-211ENST00000568829 TNNI3KQ59H18 835 aa20.38■□□□□ 0.85
SPNS1-211ENST00000568829 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
SPNS1-211ENST00000568829 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa20.38■□□□□ 0.85
SPNS1-211ENST00000568829 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
SPNS1-211ENST00000568829 PRMT2P55345 433 aa20.37■□□□□ 0.85
SPNS1-211ENST00000568829 ERC1Q8IUD2 1116 aa20.37■□□□□ 0.85
SPNS1-211ENST00000568829 SCYL3Q8IZE3 742 aa20.37■□□□□ 0.85
SPNS1-211ENST00000568829 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
SPNS1-211ENST00000568829 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
SPNS1-211ENST00000568829 AK9Q5TCS8 1911 aa20.36■□□□□ 0.85
SPNS1-211ENST00000568829 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
SPNS1-211ENST00000568829 HOXD10P28358 340 aa20.36■□□□□ 0.85
SPNS1-211ENST00000568829 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa20.36■□□□□ 0.85
SPNS1-211ENST00000568829 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
SPNS1-211ENST00000568829 PDHXO00330 501 aa20.35■□□□□ 0.85
SPNS1-211ENST00000568829 TBC1D12O60347 775 aa20.35■□□□□ 0.85
SPNS1-211ENST00000568829 MCAMP43121 646 aa20.35■□□□□ 0.85
SPNS1-211ENST00000568829 MAP3K10Q02779 954 aa20.35■□□□□ 0.85
SPNS1-211ENST00000568829 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
SPNS1-211ENST00000568829 TMEM106CQ9BVX2 250 aa20.35■□□□□ 0.85
SPNS1-211ENST00000568829 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SPNS1-211ENST00000568829 MYH2Q9UKX2 1941 aa20.35■□□□□ 0.85
SPNS1-211ENST00000568829 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa20.34■□□□□ 0.85
SPNS1-211ENST00000568829 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
SPNS1-211ENST00000568829 CERS3Q8IU89 383 aa20.34■□□□□ 0.85
SPNS1-211ENST00000568829 ZFPM1Q8IX07 1006 aa20.34■□□□□ 0.85
SPNS1-211ENST00000568829 ARMC5Q96C12 935 aa20.34■□□□□ 0.85
SPNS1-211ENST00000568829 TBC1D2Q9BYX2 928 aa20.34■□□□□ 0.85
SPNS1-211ENST00000568829 ZHX2Q9Y6X8 837 aa20.34■□□□□ 0.85
SPNS1-211ENST00000568829 RFX7Q2KHR2 1363 aa20.34■□□□□ 0.85
SPNS1-211ENST00000568829 PHF20L1A8MW92 1017 aa20.33■□□□□ 0.85
SPNS1-211ENST00000568829 RHBDL3P58872 404 aa20.33■□□□□ 0.85
SPNS1-211ENST00000568829 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
SPNS1-211ENST00000568829 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
SPNS1-211ENST00000568829 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa20.33■□□□□ 0.85
SPNS1-211ENST00000568829 TEX11Q8IYF3 940 aa20.33■□□□□ 0.85
SPNS1-211ENST00000568829 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
SPNS1-211ENST00000568829 C1orf115Q9H7X2 142 aa20.33■□□□□ 0.85
SPNS1-211ENST00000568829 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP20.33■□□□□ 0.85
SPNS1-211ENST00000568829 ATRNL1Q5VV63 1379 aa20.33■□□□□ 0.84
SPNS1-211ENST00000568829 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
SPNS1-211ENST00000568829 PTPRAP18433 802 aa20.32■□□□□ 0.84
SPNS1-211ENST00000568829 PI16Q6UXB8 463 aa20.32■□□□□ 0.84
SPNS1-211ENST00000568829 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
SPNS1-211ENST00000568829 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
SPNS1-211ENST00000568829 C17orf99Q6UX52 265 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS1-211ENST00000568829 DBNDD2Q9BQY9 259 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS1-211ENST00000568829 TRIM34Q9BYJ4 488 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS1-211ENST00000568829 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
SPNS1-211ENST00000568829 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa20.31■□□□□ 0.84
SPNS1-211ENST00000568829 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
SPNS1-211ENST00000568829 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-211ENST00000568829 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-211ENST00000568829 HMMRO75330 724 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-211ENST00000568829 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-211ENST00000568829 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-211ENST00000568829 PI4KBQ9UBF8 816 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-211ENST00000568829 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa20.3■□□□□ 0.84
SPNS1-211ENST00000568829 RLBP1P12271 317 aa20.29■□□□□ 0.84
SPNS1-211ENST00000568829 CEP85Q6P2H3 762 aa20.29■□□□□ 0.84
SPNS1-211ENST00000568829 SNRKQ9NRH2 765 aa20.29■□□□□ 0.84
SPNS1-211ENST00000568829 CPA4Q9UI42 421 aa20.29■□□□□ 0.84
SPNS1-211ENST00000568829 PNMA3Q9UL41 463 aa20.29■□□□□ 0.84
SPNS1-211ENST00000568829 DDX19BQ9UMR2 479 aa20.29■□□□□ 0.84
SPNS1-211ENST00000568829 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
SPNS1-211ENST00000568829 PPP4CP60510 307 aa20.28■□□□□ 0.84
SPNS1-211ENST00000568829 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP20.28■□□□□ 0.842e-8■■■□□ 16.4
SPNS1-211ENST00000568829 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
SPNS1-211ENST00000568829 GADL1Q6ZQY3 521 aa20.28■□□□□ 0.84
SPNS1-211ENST00000568829 AS3MTQ9HBK9 375 aa20.28■□□□□ 0.84
SPNS1-211ENST00000568829 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP20.28■□□□□ 0.84
SPNS1-211ENST00000568829 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa20.28■□□□□ 0.84
SPNS1-211ENST00000568829 DOCK2Q92608 1830 aa20.27■□□□□ 0.84
SPNS1-211ENST00000568829 PSMC4P43686 418 aa20.27■□□□□ 0.84
SPNS1-211ENST00000568829 FCGRTP55899 365 aa20.27■□□□□ 0.84
SPNS1-211ENST00000568829 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa20.27■□□□□ 0.84
SPNS1-211ENST00000568829 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
SPNS1-211ENST00000568829 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
SPNS1-211ENST00000568829 ZNF384Q8TF68 577 aa20.27■□□□□ 0.84
SPNS1-211ENST00000568829 ZNF333Q96JL9 665 aa20.27■□□□□ 0.84
SPNS1-211ENST00000568829 TRIM75PA6NK02 468 aa20.26■□□□□ 0.83
SPNS1-211ENST00000568829 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
SPNS1-211ENST00000568829 HLA-DOAP06340 250 aa20.26■□□□□ 0.83
SPNS1-211ENST00000568829 MAP3K12Q12852 859 aa20.26■□□□□ 0.83
SPNS1-211ENST00000568829 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
SPNS1-211ENST00000568829 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
SPNS1-211ENST00000568829 RAET1EQ8TD07 263 aa20.26■□□□□ 0.83
SPNS1-211ENST00000568829 PANK1Q8TE04 598 aa20.26■□□□□ 0.83
SPNS1-211ENST00000568829 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.7 ms