RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568258.5

KIAA0556-207, Transcript of KIAA0556, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene KIAA0556, Length 746 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556-207ENST00000568258 SMTNP53814 917 aa6.35□□□□□ -1.39
KIAA0556-207ENST00000568258 EPHA4P54764 986 aa6.35□□□□□ -1.39
KIAA0556-207ENST00000568258 MTFR1Q15390 333 aa6.35□□□□□ -1.39
KIAA0556-207ENST00000568258 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
KIAA0556-207ENST00000568258 PLEKHG6Q3KR16 790 aa6.35□□□□□ -1.39
KIAA0556-207ENST00000568258 PKDCCQ504Y2 493 aa6.35□□□□□ -1.39
KIAA0556-207ENST00000568258 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
KIAA0556-207ENST00000568258 TEX2Q8IWB9 1127 aa6.35□□□□□ -1.39
KIAA0556-207ENST00000568258 WDR63Q8IWG1 891 aa6.35□□□□□ -1.39
KIAA0556-207ENST00000568258 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
KIAA0556-207ENST00000568258 SMC5Q8IY18 1101 aa6.35□□□□□ -1.39
KIAA0556-207ENST00000568258 CRIPAKQ8N1N5 446 aa6.35□□□□□ -1.39
KIAA0556-207ENST00000568258 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
KIAA0556-207ENST00000568258 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
KIAA0556-207ENST00000568258 NLRP3Q96P20 1036 aa6.35□□□□□ -1.39
KIAA0556-207ENST00000568258 HINFPQ9BQA5 517 aa6.35□□□□□ -1.39
KIAA0556-207ENST00000568258 SLC52A2Q9HAB3 445 aa6.35□□□□□ -1.39
KIAA0556-207ENST00000568258 GABBR1Q9UBS5 961 aa6.35□□□□□ -1.39
KIAA0556-207ENST00000568258 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
KIAA0556-207ENST00000568258 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
KIAA0556-207ENST00000568258 TNS2Q63HR2 1409 aa6.34□□□□□ -1.39
KIAA0556-207ENST00000568258 A6NJY4 79 aa6.34□□□□□ -1.39
KIAA0556-207ENST00000568258 CDK2AP1O14519 115 aa6.34□□□□□ -1.39
KIAA0556-207ENST00000568258 SPINT1O43278 529 aa6.34□□□□□ -1.39
KIAA0556-207ENST00000568258 DNAJC6O75061 913 aa6.34□□□□□ -1.39
KIAA0556-207ENST00000568258 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
KIAA0556-207ENST00000568258 FAM13AO94988 1023 aa6.34□□□□□ -1.39
KIAA0556-207ENST00000568258 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
KIAA0556-207ENST00000568258 CABP4P57796 275 aa6.34□□□□□ -1.39
KIAA0556-207ENST00000568258 DAB2P98082 770 aa6.34□□□□□ -1.39
KIAA0556-207ENST00000568258 ATP2B2Q01814 1243 aa6.34□□□□□ -1.39
KIAA0556-207ENST00000568258 SLFN5Q08AF3 891 aa6.34□□□□□ -1.39
KIAA0556-207ENST00000568258 SLC39A6Q13433 755 aa6.34□□□□□ -1.39
KIAA0556-207ENST00000568258 FAM196AQ6ZSG2 479 aa6.34□□□□□ -1.39
KIAA0556-207ENST00000568258 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
KIAA0556-207ENST00000568258 LINC00528Q8N1L1 170 aa6.34□□□□□ -1.39
KIAA0556-207ENST00000568258 NGEFQ8N5V2 710 aa6.34□□□□□ -1.39
KIAA0556-207ENST00000568258 NBPF15Q8N660 670 aa6.34□□□□□ -1.39
KIAA0556-207ENST00000568258 CCDC136Q96JN2 1154 aa6.34□□□□□ -1.39
KIAA0556-207ENST00000568258 AGBL1Q96MI9 1066 aa6.34□□□□□ -1.39
KIAA0556-207ENST00000568258 RAB6BQ9NRW1 208 aa6.34□□□□□ -1.39
KIAA0556-207ENST00000568258 ATG3Q9NT62 314 aa6.34□□□□□ -1.39
KIAA0556-207ENST00000568258 ASAP1Q9ULH1 1129 aa6.34□□□□□ -1.39
KIAA0556-207ENST00000568258 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
KIAA0556-207ENST00000568258 LRP5O75197 1615 aa6.34□□□□□ -1.39
KIAA0556-207ENST00000568258 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa6.33□□□□□ -1.4
KIAA0556-207ENST00000568258 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
KIAA0556-207ENST00000568258 LGR5O75473 907 aa6.33□□□□□ -1.4
KIAA0556-207ENST00000568258 TRIM37O94972 964 aa6.33□□□□□ -1.4
KIAA0556-207ENST00000568258 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
KIAA0556-207ENST00000568258 IGFBP4P22692 258 aa6.33□□□□□ -1.4
KIAA0556-207ENST00000568258 FOXK2Q01167 660 aa6.33□□□□□ -1.4
KIAA0556-207ENST00000568258 RELBQ01201 579 aa6.33□□□□□ -1.4
KIAA0556-207ENST00000568258 PLCB3Q01970 1234 aa6.33□□□□□ -1.4
KIAA0556-207ENST00000568258 LMOD3Q0VAK6 560 aa6.33□□□□□ -1.4
KIAA0556-207ENST00000568258 ZNF654Q8IZM8 581 aa6.33□□□□□ -1.4
KIAA0556-207ENST00000568258 STAG2Q8N3U4 1231 aa6.33□□□□□ -1.4
KIAA0556-207ENST00000568258 PMM1Q92871 262 aa6.33□□□□□ -1.4
KIAA0556-207ENST00000568258 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
KIAA0556-207ENST00000568258 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa6.33□□□□□ -1.4
KIAA0556-207ENST00000568258 SPC25Q9HBM1 224 aa6.33□□□□□ -1.4
KIAA0556-207ENST00000568258 MBIPQ9NS73 344 aa6.33□□□□□ -1.4
KIAA0556-207ENST00000568258 RNF19AQ9NV58 838 aa6.33□□□□□ -1.4
KIAA0556-207ENST00000568258 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
KIAA0556-207ENST00000568258 SERTAD1Q9UHV2 236 aa6.33□□□□□ -1.4
KIAA0556-207ENST00000568258 BCL9O00512 1426 aa6.33□□□□□ -1.4
KIAA0556-207ENST00000568258 ZBED9Q6R2W3 1325 aa6.32□□□□□ -1.4
KIAA0556-207ENST00000568258 BTBD11A6QL63 1104 aa6.32□□□□□ -1.4
KIAA0556-207ENST00000568258 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
KIAA0556-207ENST00000568258 MEN1O00255 615 aa6.32□□□□□ -1.4
KIAA0556-207ENST00000568258 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
KIAA0556-207ENST00000568258 CREB3O43889 395 aa6.32□□□□□ -1.4
KIAA0556-207ENST00000568258 STAU1O95793 577 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
KIAA0556-207ENST00000568258 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
KIAA0556-207ENST00000568258 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
KIAA0556-207ENST00000568258 GNAI1P63096 354 aa6.32□□□□□ -1.4
KIAA0556-207ENST00000568258 CENPCQ03188 943 aa6.32□□□□□ -1.4
KIAA0556-207ENST00000568258 TEFQ10587 303 aa6.32□□□□□ -1.4
KIAA0556-207ENST00000568258 TLR1Q15399 786 aa6.32□□□□□ -1.4
KIAA0556-207ENST00000568258 KRT24Q2M2I5 525 aa6.32□□□□□ -1.4
KIAA0556-207ENST00000568258 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
KIAA0556-207ENST00000568258 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
KIAA0556-207ENST00000568258 MCF2L2Q86YR7 1114 aa6.32□□□□□ -1.4
KIAA0556-207ENST00000568258 TNS4Q8IZW8 715 aa6.32□□□□□ -1.4
KIAA0556-207ENST00000568258 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
KIAA0556-207ENST00000568258 SPOCK3Q9BQ16 436 aa6.32□□□□□ -1.4
KIAA0556-207ENST00000568258 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP6.32□□□□□ -1.45e-8■□□□□ 8.8
KIAA0556-207ENST00000568258 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
KIAA0556-207ENST00000568258 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
KIAA0556-207ENST00000568258 TMOD3Q9NYL9 352 aa6.32□□□□□ -1.4
KIAA0556-207ENST00000568258 IL16Q14005 1332 aa6.31□□□□□ -1.4
KIAA0556-207ENST00000568258 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
KIAA0556-207ENST00000568258 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa6.31□□□□□ -1.4
KIAA0556-207ENST00000568258 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
KIAA0556-207ENST00000568258 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
KIAA0556-207ENST00000568258 EHHADHQ08426 723 aa6.31□□□□□ -1.4
KIAA0556-207ENST00000568258 SCARF1Q14162 830 aa6.31□□□□□ -1.4
KIAA0556-207ENST00000568258 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
KIAA0556-207ENST00000568258 ZNF394Q53GI3 561 aa6.31□□□□□ -1.4
KIAA0556-207ENST00000568258 DUSP27Q5VZP5 1158 aa6.31□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms