RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561256.5

USP3-AS1-210, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene USP3-AS1, Length 562 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-210ENST00000561256 GADL1Q6ZQY3 521 aa21.49■■□□□ 1.03
USP3-AS1-210ENST00000561256 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
USP3-AS1-210ENST00000561256 IDI2Q9BXS1 227 aa21.49■■□□□ 1.03
USP3-AS1-210ENST00000561256 SMC4Q9NTJ3 1288 aa21.49■■□□□ 1.03
USP3-AS1-210ENST00000561256 CEP290O15078 2479 aa21.49■■□□□ 1.03
USP3-AS1-210ENST00000561256 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
USP3-AS1-210ENST00000561256 PTPRAP18433 802 aa21.48■■□□□ 1.03
USP3-AS1-210ENST00000561256 IL15P40933 162 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
USP3-AS1-210ENST00000561256 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
USP3-AS1-210ENST00000561256 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
USP3-AS1-210ENST00000561256 GABRQQ9UN88 632 aa21.48■■□□□ 1.03
USP3-AS1-210ENST00000561256 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
USP3-AS1-210ENST00000561256 MGAMO43451 1857 aa21.47■■□□□ 1.03
USP3-AS1-210ENST00000561256 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa21.47■■□□□ 1.03
USP3-AS1-210ENST00000561256 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
USP3-AS1-210ENST00000561256 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
USP3-AS1-210ENST00000561256 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa21.47■■□□□ 1.03
USP3-AS1-210ENST00000561256 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa21.47■■□□□ 1.03
USP3-AS1-210ENST00000561256 GAKO14976 1311 aa21.47■■□□□ 1.03
USP3-AS1-210ENST00000561256 MYH2Q9UKX2 1941 aa21.47■■□□□ 1.03
USP3-AS1-210ENST00000561256 SLFN5Q08AF3 891 aa21.46■■□□□ 1.03
USP3-AS1-210ENST00000561256 CCDC102BQ68D86 513 aa21.46■■□□□ 1.03
USP3-AS1-210ENST00000561256 SLF2Q8IX21 1173 aa21.46■■□□□ 1.03
USP3-AS1-210ENST00000561256 UNC93B1Q9H1C4 597 aa21.46■■□□□ 1.03
USP3-AS1-210ENST00000561256 ABCF2Q9UG63 623 aa21.46■■□□□ 1.03
USP3-AS1-210ENST00000561256 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
USP3-AS1-210ENST00000561256 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa21.46■■□□□ 1.03
USP3-AS1-210ENST00000561256 ADCY3O60266 1144 aa21.45■■□□□ 1.02
USP3-AS1-210ENST00000561256 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
USP3-AS1-210ENST00000561256 ADORA1P30542 326 aa21.45■■□□□ 1.02
USP3-AS1-210ENST00000561256 PICALMQ13492 652 aa21.45■■□□□ 1.02
USP3-AS1-210ENST00000561256 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa21.45■■□□□ 1.02
USP3-AS1-210ENST00000561256 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
USP3-AS1-210ENST00000561256 HDAC5Q9UQL6 1122 aa21.45■■□□□ 1.02
USP3-AS1-210ENST00000561256 NR2E3Q9Y5X4 410 aa21.45■■□□□ 1.02
USP3-AS1-210ENST00000561256 RFX7Q2KHR2 1363 aa21.45■■□□□ 1.02
USP3-AS1-210ENST00000561256 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
USP3-AS1-210ENST00000561256 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
USP3-AS1-210ENST00000561256 FLT3LGP49771 235 aa21.44■■□□□ 1.02
USP3-AS1-210ENST00000561256 TRIM75PA6NK02 468 aa21.43■■□□□ 1.02
USP3-AS1-210ENST00000561256 ZBTB22O15209 634 aa21.43■■□□□ 1.02
USP3-AS1-210ENST00000561256 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
USP3-AS1-210ENST00000561256 SGPL1O95470 568 aa21.43■■□□□ 1.02
USP3-AS1-210ENST00000561256 ELNP15502 786 aa21.43■■□□□ 1.02
USP3-AS1-210ENST00000561256 BTDP43251 543 aa21.43■■□□□ 1.02
USP3-AS1-210ENST00000561256 MAP3K10Q02779 954 aa21.43■■□□□ 1.02
USP3-AS1-210ENST00000561256 RASGRF1Q13972 1273 aa21.43■■□□□ 1.02
USP3-AS1-210ENST00000561256 COPRSQ9NQ92 184 aa21.43■■□□□ 1.02
USP3-AS1-210ENST00000561256 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
USP3-AS1-210ENST00000561256 DOCK1Q14185 1865 aa21.43■■□□□ 1.02
USP3-AS1-210ENST00000561256 INHAP05111 366 aa21.42■■□□□ 1.02
USP3-AS1-210ENST00000561256 SLURP2P0DP57 97 aa21.42■■□□□ 1.02
USP3-AS1-210ENST00000561256 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
USP3-AS1-210ENST00000561256 PXYLP1Q8TE99 480 aa21.42■■□□□ 1.02
USP3-AS1-210ENST00000561256 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
USP3-AS1-210ENST00000561256 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa21.41■■□□□ 1.02
USP3-AS1-210ENST00000561256 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
USP3-AS1-210ENST00000561256 TIMM10P62072 90 aa21.41■■□□□ 1.02
USP3-AS1-210ENST00000561256 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
USP3-AS1-210ENST00000561256 TAOK2Q9UL54 1235 aa21.41■■□□□ 1.02
USP3-AS1-210ENST00000561256 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
USP3-AS1-210ENST00000561256 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa21.41■■□□□ 1.02
USP3-AS1-210ENST00000561256 PTPRFP10586 1907 aa21.41■■□□□ 1.02
USP3-AS1-210ENST00000561256 TFRCP02786 760 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
USP3-AS1-210ENST00000561256 IRF5Q13568 498 aa21.4■■□□□ 1.02
USP3-AS1-210ENST00000561256 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
USP3-AS1-210ENST00000561256 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa21.4■■□□□ 1.02
USP3-AS1-210ENST00000561256 COA7Q96BR5 231 aa21.4■■□□□ 1.02
USP3-AS1-210ENST00000561256 CDCA7LQ96GN5 454 aa21.4■■□□□ 1.02
USP3-AS1-210ENST00000561256 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
USP3-AS1-210ENST00000561256 PHIPQ8WWQ0 1821 aa21.39■■□□□ 1.02
USP3-AS1-210ENST00000561256 A0A1B0GUL7 405 aa21.39■■□□□ 1.01
USP3-AS1-210ENST00000561256 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
USP3-AS1-210ENST00000561256 ERICH6Q7L0X2 663 aa21.39■■□□□ 1.01
USP3-AS1-210ENST00000561256 MIER1Q8N108 512 aa21.39■■□□□ 1.01
USP3-AS1-210ENST00000561256 DEFB118Q96PH6 123 aa21.39■■□□□ 1.01
USP3-AS1-210ENST00000561256 PNMA3Q9UL41 463 aa21.39■■□□□ 1.01
USP3-AS1-210ENST00000561256 EVI5O60447 810 aa21.38■■□□□ 1.01
USP3-AS1-210ENST00000561256 CAPN2P17655 700 aa21.38■■□□□ 1.01
USP3-AS1-210ENST00000561256 MECOMQ03112 1051 aa21.38■■□□□ 1.01
USP3-AS1-210ENST00000561256 MVPQ14764 893 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
USP3-AS1-210ENST00000561256 XAGE2Q96GT9 111 aa21.38■■□□□ 1.01
USP3-AS1-210ENST00000561256 MEIS3Q99687 375 aa21.38■■□□□ 1.01
USP3-AS1-210ENST00000561256 PRO3102Q9H379 93 aa21.38■■□□□ 1.01
USP3-AS1-210ENST00000561256 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP21.38■■□□□ 1.01
USP3-AS1-210ENST00000561256 AKAP2Q9Y2D5 859 aa21.38■■□□□ 1.01
USP3-AS1-210ENST00000561256 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa21.37■■□□□ 1.01
USP3-AS1-210ENST00000561256 TBC1D12O60347 775 aa21.37■■□□□ 1.01
USP3-AS1-210ENST00000561256 RHBDL3P58872 404 aa21.37■■□□□ 1.01
USP3-AS1-210ENST00000561256 TREML2Q5T2D2 321 aa21.37■■□□□ 1.01
USP3-AS1-210ENST00000561256 FAM196BA6NMK8 535 aa21.36■■□□□ 1.01
USP3-AS1-210ENST00000561256 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
USP3-AS1-210ENST00000561256 TFCP2Q12800 502 aa21.36■■□□□ 1.01
USP3-AS1-210ENST00000561256 FAM110CQ1W6H9 321 aa21.36■■□□□ 1.01
USP3-AS1-210ENST00000561256 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
USP3-AS1-210ENST00000561256 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
USP3-AS1-210ENST00000561256 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
USP3-AS1-210ENST00000561256 SRGAP3O43295 1099 aa21.35■■□□□ 1.01
USP3-AS1-210ENST00000561256 NPM3O75607 178 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
USP3-AS1-210ENST00000561256 SPP2Q13103 211 aa21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms