RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557115.5

CIPC-208, Transcript of CLOCK interacting pacemaker, humanhuman

TSL 4

Gene CIPC, Length 882 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPC-208ENST00000557115 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa26.7■■□□□ 1.86
CIPC-208ENST00000557115 AK9Q5TCS8 1911 aa26.69■■□□□ 1.86
CIPC-208ENST00000557115 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa26.69■■□□□ 1.86
CIPC-208ENST00000557115 MCAMP43121 646 aa26.69■■□□□ 1.86
CIPC-208ENST00000557115 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
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CIPC-208ENST00000557115 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
CIPC-208ENST00000557115 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
CIPC-208ENST00000557115 MYH2Q9UKX2 1941 aa26.68■■□□□ 1.86
CIPC-208ENST00000557115 DBNDD2Q9BQY9 259 aa26.67■■□□□ 1.86
CIPC-208ENST00000557115 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
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CIPC-208ENST00000557115 SNRKQ9NRH2 765 aa26.67■■□□□ 1.86
CIPC-208ENST00000557115 PTPN22Q9Y2R2 807 aa26.67■■□□□ 1.86
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CIPC-208ENST00000557115 KIF22Q14807 665 aa26.65■■□□□ 1.86
CIPC-208ENST00000557115 SCYL3Q8IZE3 742 aa26.65■■□□□ 1.86
CIPC-208ENST00000557115 ZNF384Q8TF68 577 aa26.65■■□□□ 1.86
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CIPC-208ENST00000557115 RFX7Q2KHR2 1363 aa26.65■■□□□ 1.86
CIPC-208ENST00000557115 PHF20L1A8MW92 1017 aa26.64■■□□□ 1.86
CIPC-208ENST00000557115 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
CIPC-208ENST00000557115 MS4A1P11836 297 aa26.64■■□□□ 1.86
CIPC-208ENST00000557115 ANKRD23Q86SG2 305 aa26.64■■□□□ 1.86
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CIPC-208ENST00000557115 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
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CIPC-208ENST00000557115 BAG3O95817 575 aa26.61■■□□□ 1.85
CIPC-208ENST00000557115 TEX11Q8IYF3 940 aa26.61■■□□□ 1.85
CIPC-208ENST00000557115 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
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CIPC-208ENST00000557115 SLURP2P0DP57 97 aa26.6■■□□□ 1.85
CIPC-208ENST00000557115 PTPRAP18433 802 aa26.6■■□□□ 1.85
CIPC-208ENST00000557115 CAP1Q01518 475 aa26.6■■□□□ 1.85
CIPC-208ENST00000557115 MAP3K10Q02779 954 aa26.6■■□□□ 1.85
CIPC-208ENST00000557115 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP26.6■■□□□ 1.85
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CIPC-208ENST00000557115 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
CIPC-208ENST00000557115 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP26.59■■□□□ 1.85
CIPC-208ENST00000557115 CPA4Q9UI42 421 aa26.59■■□□□ 1.85
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CIPC-208ENST00000557115 PLCG2P16885 1265 aa26.58■■□□□ 1.85
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CIPC-208ENST00000557115 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
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CIPC-208ENST00000557115 DOCK2Q92608 1830 aa26.56■■□□□ 1.84
CIPC-208ENST00000557115 FAM196BA6NMK8 535 aa26.56■■□□□ 1.84
CIPC-208ENST00000557115 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa26.56■■□□□ 1.84
CIPC-208ENST00000557115 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa26.56■■□□□ 1.84
CIPC-208ENST00000557115 C17orf99Q6UX52 265 aa26.56■■□□□ 1.84
CIPC-208ENST00000557115 NBPF11Q86T75 865 aa26.56■■□□□ 1.84
CIPC-208ENST00000557115 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa26.56■■□□□ 1.84
CIPC-208ENST00000557115 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa26.56■■□□□ 1.84
CIPC-208ENST00000557115 TRIM75PA6NK02 468 aa26.55■■□□□ 1.84
CIPC-208ENST00000557115 MOGSQ13724 837 aa26.55■■□□□ 1.84
CIPC-208ENST00000557115 AACSQ86V21 672 aa26.55■■□□□ 1.84
CIPC-208ENST00000557115 ARMC5Q96C12 935 aa26.55■■□□□ 1.84
CIPC-208ENST00000557115 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
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CIPC-208ENST00000557115 GPAT2Q6NUI2 795 aa26.54■■□□□ 1.84
CIPC-208ENST00000557115 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
CIPC-208ENST00000557115 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
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CIPC-208ENST00000557115 IDH1O75874 414 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
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CIPC-208ENST00000557115 TMEM106CQ9BVX2 250 aa26.53■■□□□ 1.84
CIPC-208ENST00000557115 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
CIPC-208ENST00000557115 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
CIPC-208ENST00000557115 DDX19BQ9UMR2 479 aa26.53■■□□□ 1.84
CIPC-208ENST00000557115 COG6Q9Y2V7 657 aa26.53■■□□□ 1.84
CIPC-208ENST00000557115 POTEFA5A3E0 1075 aa26.52■■□□□ 1.84
CIPC-208ENST00000557115 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
CIPC-208ENST00000557115 CYP2C8P10632 490 aa26.52■■□□□ 1.84
CIPC-208ENST00000557115 PSMC4P43686 418 aa26.52■■□□□ 1.84
CIPC-208ENST00000557115 PPP4CP60510 307 aa26.52■■□□□ 1.84
CIPC-208ENST00000557115 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
CIPC-208ENST00000557115 PI4KBQ9UBF8 816 aa26.52■■□□□ 1.84
CIPC-208ENST00000557115 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
CIPC-208ENST00000557115 RCAN3Q9UKA8 241 aa26.52■■□□□ 1.84
CIPC-208ENST00000557115 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
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