RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555616.5

ACTN1-215, Transcript of actinin alpha 1, human

TSL 3

Gene ACTN1, Length 919 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACTN1-215	ENST00000555616	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		11.74	□□□□□ -0.53
ACTN1-215	ENST00000555616	WRNIP1	Q96S55	665 aa		11.74	□□□□□ -0.53
ACTN1-215	ENST00000555616	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
ACTN1-215	ENST00000555616	ELP3	Q9H9T3	547 aa		11.74	□□□□□ -0.53
ACTN1-215	ENST00000555616	SNRK	Q9NRH2	765 aa		11.74	□□□□□ -0.53
ACTN1-215	ENST00000555616	RAI14	Q9P0K7	980 aa		11.74	□□□□□ -0.53
ACTN1-215	ENST00000555616	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		11.74	□□□□□ -0.53
ACTN1-215	ENST00000555616	CSAD	Q9Y600	493 aa		11.74	□□□□□ -0.53
ACTN1-215	ENST00000555616	DOCK2	Q92608	1830 aa		11.74	□□□□□ -0.53
ACTN1-215	ENST00000555616	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		11.74	□□□□□ -0.53
ACTN1-215	ENST00000555616	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
ACTN1-215	ENST00000555616	ALDH1A1	P00352	501 aa		11.73	□□□□□ -0.53
ACTN1-215	ENST00000555616	ZAP70	P43403	619 aa		11.73	□□□□□ -0.53
ACTN1-215	ENST00000555616	IFNL1	Q8IU54	200 aa		11.73	□□□□□ -0.53
ACTN1-215	ENST00000555616	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		11.73	□□□□□ -0.53
ACTN1-215	ENST00000555616	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		11.73	□□□□□ -0.53
ACTN1-215	ENST00000555616	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		11.73	□□□□□ -0.53
ACTN1-215	ENST00000555616	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
ACTN1-215	ENST00000555616	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
ACTN1-215	ENST00000555616	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		11.73	□□□□□ -0.53
ACTN1-215	ENST00000555616	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	11.72	□□□□□ -0.53
ACTN1-215	ENST00000555616	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		11.72	□□□□□ -0.53
ACTN1-215	ENST00000555616	ERO1B	Q86YB8	467 aa		11.72	□□□□□ -0.53
ACTN1-215	ENST00000555616	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
ACTN1-215	ENST00000555616	CNKSR2	Q8WXI2	1034 aa		11.72	□□□□□ -0.53
ACTN1-215	ENST00000555616	ABHD8	Q96I13	439 aa		11.72	□□□□□ -0.53
ACTN1-215	ENST00000555616	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		11.72	□□□□□ -0.53
ACTN1-215	ENST00000555616	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		11.72	□□□□□ -0.53
ACTN1-215	ENST00000555616	APBB1	O00213	710 aa		11.71	□□□□□ -0.53
ACTN1-215	ENST00000555616	TBC1D8	O95759	1140 aa		11.71	□□□□□ -0.53
ACTN1-215	ENST00000555616	INPP5B	P32019	993 aa		11.71	□□□□□ -0.53
ACTN1-215	ENST00000555616	RGS19	P49795	217 aa		11.71	□□□□□ -0.53
ACTN1-215	ENST00000555616	MAP3K10	Q02779	954 aa		11.71	□□□□□ -0.53
ACTN1-215	ENST00000555616	NUCB1	Q02818	461 aa		11.71	□□□□□ -0.53
ACTN1-215	ENST00000555616	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
ACTN1-215	ENST00000555616	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		11.71	□□□□□ -0.53
ACTN1-215	ENST00000555616	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
ACTN1-215	ENST00000555616	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
ACTN1-215	ENST00000555616	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		11.71	□□□□□ -0.53
ACTN1-215	ENST00000555616	ADGRA1	Q86SQ6	560 aa		11.71	□□□□□ -0.53
ACTN1-215	ENST00000555616	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
ACTN1-215	ENST00000555616	OTUD5	Q96G74	571 aa		11.71	□□□□□ -0.53
ACTN1-215	ENST00000555616	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
ACTN1-215	ENST00000555616	GTF2A2	P52657	109 aa		11.7	□□□□□ -0.54
ACTN1-215	ENST00000555616	PPP4C	P60510	307 aa		11.7	□□□□□ -0.54
ACTN1-215	ENST00000555616	PPIL2	Q13356	520 aa		11.7	□□□□□ -0.54
ACTN1-215	ENST00000555616	PICALM	Q13492	652 aa		11.7	□□□□□ -0.54
ACTN1-215	ENST00000555616	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		11.7	□□□□□ -0.54
ACTN1-215	ENST00000555616	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	11.7	□□□□□ -0.54
ACTN1-215	ENST00000555616	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		11.7	□□□□□ -0.54
ACTN1-215	ENST00000555616	PTPN18	Q99952	460 aa		11.7	□□□□□ -0.54
ACTN1-215	ENST00000555616	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
ACTN1-215	ENST00000555616	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ACTN1-215	ENST00000555616	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ACTN1-215	ENST00000555616	GPR25	O00155	361 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ACTN1-215	ENST00000555616	BAG3	O95817	575 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ACTN1-215	ENST00000555616	PLCG2	P16885	1265 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ACTN1-215	ENST00000555616	PPAT	Q06203	517 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ACTN1-215	ENST00000555616	CCL15	Q16663	113 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ACTN1-215	ENST00000555616	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
ACTN1-215	ENST00000555616	TEX11	Q8IYF3	940 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ACTN1-215	ENST00000555616	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
ACTN1-215	ENST00000555616	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
ACTN1-215	ENST00000555616	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
ACTN1-215	ENST00000555616	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ACTN1-215	ENST00000555616	OSBPL5	Q9H0X9	879 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
ACTN1-215	ENST00000555616	AATF	Q9NY61	560 aa	Known RBP eCLIP	11.69	□□□□□ -0.54
ACTN1-215	ENST00000555616	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ACTN1-215	ENST00000555616	IRF6	O14896	467 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ACTN1-215	ENST00000555616	TBC1D12	O60347	775 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ACTN1-215	ENST00000555616	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
ACTN1-215	ENST00000555616	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
ACTN1-215	ENST00000555616	CETP	P11597	493 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ACTN1-215	ENST00000555616	SNAPC2	Q13487	334 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ACTN1-215	ENST00000555616	DGKZ	Q13574	1117 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ACTN1-215	ENST00000555616	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ACTN1-215	ENST00000555616	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
ACTN1-215	ENST00000555616	CERS3	Q8IU89	383 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ACTN1-215	ENST00000555616	LNPK	Q9C0E8	428 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ACTN1-215	ENST00000555616	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ACTN1-215	ENST00000555616	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ACTN1-215	ENST00000555616	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
ACTN1-215	ENST00000555616	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ACTN1-215	ENST00000555616	CASP8AP2	Q9UKL3	1982 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ACTN1-215	ENST00000555616	FLT1	P17948	1338 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ACTN1-215	ENST00000555616	SLC34A2	O95436	690 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ACTN1-215	ENST00000555616	CYP7A1	P22680	504 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ACTN1-215	ENST00000555616	MAP3K12	Q12852	859 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ACTN1-215	ENST00000555616	CRHR2	Q13324	411 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ACTN1-215	ENST00000555616	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
ACTN1-215	ENST00000555616	SCYL3	Q8IZE3	742 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ACTN1-215	ENST00000555616	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ACTN1-215	ENST00000555616	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
ACTN1-215	ENST00000555616	DOCK1	Q14185	1865 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ACTN1-215	ENST00000555616	SIPA1L1	O43166	1804 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ACTN1-215	ENST00000555616	FKTN	O75072	461 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ACTN1-215	ENST00000555616	SLURP2	P0DP57	97 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ACTN1-215	ENST00000555616	ATP5J	P18859	108 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ACTN1-215	ENST00000555616	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ACTN1-215	ENST00000555616	MAGEB6	Q8N7X4	407 aa		11.66	□□□□□ -0.54

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