RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551137.5

CS-223, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-223	ENST00000551137	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		14.08	□□□□□ -0.16
CS-223	ENST00000551137	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	14.08	□□□□□ -0.16
CS-223	ENST00000551137	RAI14	Q9P0K7	980 aa		14.08	□□□□□ -0.16
CS-223	ENST00000551137	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		14.08	□□□□□ -0.16
CS-223	ENST00000551137	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	14.07	□□□□□ -0.16
CS-223	ENST00000551137	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		14.07	□□□□□ -0.16
CS-223	ENST00000551137	TBC1D12	O60347	775 aa		14.07	□□□□□ -0.16
CS-223	ENST00000551137	FKTN	O75072	461 aa		14.07	□□□□□ -0.16
CS-223	ENST00000551137	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	14.07	□□□□□ -0.16
CS-223	ENST00000551137	PPIL2	Q13356	520 aa		14.07	□□□□□ -0.16
CS-223	ENST00000551137	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		14.07	□□□□□ -0.16
CS-223	ENST00000551137	CNKSR2	Q8WXI2	1034 aa		14.07	□□□□□ -0.16
CS-223	ENST00000551137	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		14.07	□□□□□ -0.16
CS-223	ENST00000551137	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	14.07	□□□□□ -0.16
CS-223	ENST00000551137	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		14.07	□□□□□ -0.16
CS-223	ENST00000551137	AK9	Q5TCS8	1911 aa		14.06	□□□□□ -0.16
CS-223	ENST00000551137	IRF6	O14896	467 aa		14.06	□□□□□ -0.16
CS-223	ENST00000551137	CETP	P11597	493 aa		14.06	□□□□□ -0.16
CS-223	ENST00000551137	INPP5B	P32019	993 aa		14.06	□□□□□ -0.16
CS-223	ENST00000551137	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		14.06	□□□□□ -0.16
CS-223	ENST00000551137	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		14.06	□□□□□ -0.16
CS-223	ENST00000551137	OTUD5	Q96G74	571 aa		14.06	□□□□□ -0.16
CS-223	ENST00000551137	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	14.06	□□□□□ -0.16
CS-223	ENST00000551137	SNRK	Q9NRH2	765 aa		14.06	□□□□□ -0.16
CS-223	ENST00000551137	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	14.06	□□□□□ -0.16
CS-223	ENST00000551137	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		14.06	□□□□□ -0.16
CS-223	ENST00000551137	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		14.05	□□□□□ -0.16
CS-223	ENST00000551137	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	14.05	□□□□□ -0.16
CS-223	ENST00000551137	RAB11FIP3	O75154	756 aa		14.05	□□□□□ -0.16
CS-223	ENST00000551137	PLCG2	P16885	1265 aa		14.05	□□□□□ -0.16
CS-223	ENST00000551137	ZAP70	P43403	619 aa		14.05	□□□□□ -0.16
CS-223	ENST00000551137	RGS19	P49795	217 aa		14.05	□□□□□ -0.16
CS-223	ENST00000551137	SNAPC2	Q13487	334 aa		14.05	□□□□□ -0.16
CS-223	ENST00000551137	CCL15	Q16663	113 aa		14.05	□□□□□ -0.16
CS-223	ENST00000551137	BAG3	O95817	575 aa		14.04	□□□□□ -0.16
CS-223	ENST00000551137	CRHR2	Q13324	411 aa		14.04	□□□□□ -0.16
CS-223	ENST00000551137	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		14.04	□□□□□ -0.16
CS-223	ENST00000551137	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	14.04	□□□□□ -0.16
CS-223	ENST00000551137	AACS	Q86V21	672 aa		14.04	□□□□□ -0.16
CS-223	ENST00000551137	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	14.04	□□□□□ -0.16
CS-223	ENST00000551137	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	14.04	□□□□□ -0.16
CS-223	ENST00000551137	CXCL11	O14625	94 aa		14.03	□□□□□ -0.16
CS-223	ENST00000551137	CTNND1	O60716	968 aa	Known RBP	14.03	□□□□□ -0.16
CS-223	ENST00000551137	CERS3	Q8IU89	383 aa		14.03	□□□□□ -0.16
CS-223	ENST00000551137	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	14.03	□□□□□ -0.16
CS-223	ENST00000551137	SCYL3	Q8IZE3	742 aa		14.03	□□□□□ -0.16
CS-223	ENST00000551137	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	14.03	□□□□□ -0.16
CS-223	ENST00000551137	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		14.03	□□□□□ -0.16
CS-223	ENST00000551137	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	14.03	□□□□□ -0.16
CS-223	ENST00000551137	OSBPL5	Q9H0X9	879 aa	Predicted RBP	14.03	□□□□□ -0.16
CS-223	ENST00000551137	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	14.03	□□□□□ -0.16
CS-223	ENST00000551137	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	14.03	□□□□□ -0.16
CS-223	ENST00000551137	MAST2	Q6P0Q8	1798 aa		14.03	□□□□□ -0.16
CS-223	ENST00000551137	DOCK2	Q92608	1830 aa		14.03	□□□□□ -0.16
CS-223	ENST00000551137	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	14.02	□□□□□ -0.17
CS-223	ENST00000551137	ADGRA1	Q86SQ6	560 aa		14.02	□□□□□ -0.17
CS-223	ENST00000551137	METTL16	Q86W50	562 aa	Known RBP	14.02	□□□□□ -0.17
CS-223	ENST00000551137	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		14.02	□□□□□ -0.17
CS-223	ENST00000551137	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		14.02	□□□□□ -0.17
CS-223	ENST00000551137	HTT	P42858	3142 aa		14.02	□□□□□ -0.17
CS-223	ENST00000551137	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	14.01	□□□□□ -0.17
CS-223	ENST00000551137	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		14.01	□□□□□ -0.17
CS-223	ENST00000551137	BTBD19	C9JJ37	291 aa		14.01	□□□□□ -0.17
CS-223	ENST00000551137	PTPRA	P18433	802 aa		14.01	□□□□□ -0.17
CS-223	ENST00000551137	SP3	Q02447	781 aa		14.01	□□□□□ -0.17
CS-223	ENST00000551137	PICALM	Q13492	652 aa		14.01	□□□□□ -0.17
CS-223	ENST00000551137	MOGS	Q13724	837 aa		14.01	□□□□□ -0.17
CS-223	ENST00000551137	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	14.01	□□□□□ -0.17
CS-223	ENST00000551137	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		14.01	□□□□□ -0.17
CS-223	ENST00000551137	TEX11	Q8IYF3	940 aa		14.01	□□□□□ -0.17
CS-223	ENST00000551137	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	14.01	□□□□□ -0.17
CS-223	ENST00000551137	ERO1A	Q96HE7	468 aa		14.01	□□□□□ -0.17
CS-223	ENST00000551137	AATF	Q9NY61	560 aa	Known RBP eCLIP	14.01	□□□□□ -0.17
CS-223	ENST00000551137	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	14.01	□□□□□ -0.17
CS-223	ENST00000551137	TLR2	O60603	784 aa		14	□□□□□ -0.17
CS-223	ENST00000551137	MAP3K12	Q12852	859 aa		14	□□□□□ -0.17
CS-223	ENST00000551137	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	14	□□□□□ -0.17
CS-223	ENST00000551137	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		14	□□□□□ -0.17
CS-223	ENST00000551137	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		14	□□□□□ -0.17
CS-223	ENST00000551137	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		14	□□□□□ -0.17
CS-223	ENST00000551137		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	13.99	□□□□□ -0.17
CS-223	ENST00000551137	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	13.99	□□□□□ -0.17
CS-223	ENST00000551137	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		13.99	□□□□□ -0.17
CS-223	ENST00000551137	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	13.99	□□□□□ -0.17
CS-223	ENST00000551137	FOXP4	Q8IVH2	680 aa	Predicted RBP	13.99	□□□□□ -0.17
CS-223	ENST00000551137	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		13.99	□□□□□ -0.17
CS-223	ENST00000551137	PICK1	Q9NRD5	415 aa		13.99	□□□□□ -0.17
CS-223	ENST00000551137	ZHX2	Q9Y6X8	837 aa		13.99	□□□□□ -0.17
CS-223	ENST00000551137	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		13.99	□□□□□ -0.17
CS-223	ENST00000551137	FLT1	P17948	1338 aa		13.98	□□□□□ -0.17
CS-223	ENST00000551137	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
CS-223	ENST00000551137	ATP5J	P18859	108 aa		13.98	□□□□□ -0.17
CS-223	ENST00000551137	CYP7A1	P22680	504 aa		13.98	□□□□□ -0.17
CS-223	ENST00000551137	ARHGEF6	Q15052	776 aa		13.98	□□□□□ -0.17
CS-223	ENST00000551137	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
CS-223	ENST00000551137	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		13.98	□□□□□ -0.17
CS-223	ENST00000551137	DCTPP1	Q9H773	170 aa		13.98	□□□□□ -0.17
CS-223	ENST00000551137	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	13.98	□□□□□ -0.17
CS-223	ENST00000551137	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		13.98	□□□□□ -0.17
CS-223	ENST00000551137	CDK5RAP2	Q96SN8	1893 aa		13.97	□□□□□ -0.17

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