RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550996.1

CS-222, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-222ENST00000550996 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
CS-222ENST00000550996 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa25.5■■□□□ 1.67
CS-222ENST00000550996 ZNF112Q9UJU3 913 aa25.5■■□□□ 1.67
CS-222ENST00000550996 CSADQ9Y600 493 aa25.5■■□□□ 1.67
CS-222ENST00000550996 MAST2Q6P0Q8 1798 aa25.49■■□□□ 1.67
CS-222ENST00000550996 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
CS-222ENST00000550996 TBC1D8O95759 1140 aa25.49■■□□□ 1.67
CS-222ENST00000550996 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
CS-222ENST00000550996 MS4A4AQ96JQ5 239 aa25.49■■□□□ 1.67
CS-222ENST00000550996 CRBNQ96SW2 442 aa25.49■■□□□ 1.67
CS-222ENST00000550996 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP25.49■■□□□ 1.67
CS-222ENST00000550996 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
CS-222ENST00000550996 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa25.48■■□□□ 1.67
CS-222ENST00000550996 SPDYE5A6NIY4 337 aa25.48■■□□□ 1.67
CS-222ENST00000550996 NPM3O75607 178 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
CS-222ENST00000550996 IDH1O75874 414 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
CS-222ENST00000550996 IFNL1Q8IU54 200 aa25.48■■□□□ 1.67
CS-222ENST00000550996 OTUD5Q96G74 571 aa25.48■■□□□ 1.67
CS-222ENST00000550996 PTPN18Q99952 460 aa25.48■■□□□ 1.67
CS-222ENST00000550996 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
CS-222ENST00000550996 PPP4CP60510 307 aa25.47■■□□□ 1.67
CS-222ENST00000550996 TEX11Q8IYF3 940 aa25.47■■□□□ 1.67
CS-222ENST00000550996 DCTPP1Q9H773 170 aa25.47■■□□□ 1.67
CS-222ENST00000550996 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
CS-222ENST00000550996 PHF20L1A8MW92 1017 aa25.46■■□□□ 1.67
CS-222ENST00000550996 MAP3K10Q02779 954 aa25.46■■□□□ 1.67
CS-222ENST00000550996 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
CS-222ENST00000550996 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP25.46■■□□□ 1.67
CS-222ENST00000550996 LRRCC1Q9C099 1032 aa25.46■■□□□ 1.67
CS-222ENST00000550996 LAMB1P07942 1786 aa25.46■■□□□ 1.67
CS-222ENST00000550996 CYP7A1P22680 504 aa25.45■■□□□ 1.66
CS-222ENST00000550996 INHBEP58166 350 aa25.45■■□□□ 1.66
CS-222ENST00000550996 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
CS-222ENST00000550996 ERO1BQ86YB8 467 aa25.45■■□□□ 1.66
CS-222ENST00000550996 MAGEB6Q8N7X4 407 aa25.45■■□□□ 1.66
CS-222ENST00000550996 BRI3BPQ8WY22 251 aa25.45■■□□□ 1.66
CS-222ENST00000550996 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
CS-222ENST00000550996 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
CS-222ENST00000550996 IGSF3O75054 1194 aa25.44■■□□□ 1.66
CS-222ENST00000550996 CFHR5Q9BXR6 569 aa25.44■■□□□ 1.66
CS-222ENST00000550996 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
CS-222ENST00000550996 IRF6O14896 467 aa25.43■■□□□ 1.66
CS-222ENST00000550996 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
CS-222ENST00000550996 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
CS-222ENST00000550996 DOCK2Q92608 1830 aa25.42■■□□□ 1.66
CS-222ENST00000550996 FAM196BA6NMK8 535 aa25.42■■□□□ 1.66
CS-222ENST00000550996 GOLIM4O00461 696 aa25.42■■□□□ 1.66
CS-222ENST00000550996 BAG3O95817 575 aa25.42■■□□□ 1.66
CS-222ENST00000550996 PPIL2Q13356 520 aa25.42■■□□□ 1.66
CS-222ENST00000550996 MIGA1Q8NAN2 632 aa25.42■■□□□ 1.66
CS-222ENST00000550996 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
CS-222ENST00000550996 AK9Q5TCS8 1911 aa25.41■■□□□ 1.66
CS-222ENST00000550996 ATP5JP18859 108 aa25.41■■□□□ 1.66
CS-222ENST00000550996 MAP3K12Q12852 859 aa25.41■■□□□ 1.66
CS-222ENST00000550996 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa25.41■■□□□ 1.66
CS-222ENST00000550996 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa25.41■■□□□ 1.66
CS-222ENST00000550996 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
CS-222ENST00000550996 BOLA2Q9H3K6 86 aa25.41■■□□□ 1.66
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CS-222ENST00000550996 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa25.4■■□□□ 1.66
CS-222ENST00000550996 ALDH1A1P00352 501 aa25.4■■□□□ 1.66
CS-222ENST00000550996 PLCG2P16885 1265 aa25.4■■□□□ 1.66
CS-222ENST00000550996 GTF2A2P52657 109 aa25.4■■□□□ 1.66
CS-222ENST00000550996 CCL15Q16663 113 aa25.4■■□□□ 1.66
CS-222ENST00000550996 GPR25O00155 361 aa25.39■■□□□ 1.66
CS-222ENST00000550996 PDE6AP16499 860 aa25.39■■□□□ 1.66
CS-222ENST00000550996 PPATQ06203 517 aa25.39■■□□□ 1.66
CS-222ENST00000550996 MCOLN1Q9GZU1 580 aa25.39■■□□□ 1.66
CS-222ENST00000550996 TBC1D12O60347 775 aa25.38■■□□□ 1.65
CS-222ENST00000550996 CAPN15O75808 1086 aa25.38■■□□□ 1.65
CS-222ENST00000550996 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
CS-222ENST00000550996 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
CS-222ENST00000550996 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
CS-222ENST00000550996 FAM43AQ8N2R8 423 aa25.38■■□□□ 1.65
CS-222ENST00000550996 HAUS7Q99871 368 aa25.38■■□□□ 1.65
CS-222ENST00000550996 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
CS-222ENST00000550996 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa25.37■■□□□ 1.65
CS-222ENST00000550996 CRHR2Q13324 411 aa25.37■■□□□ 1.65
CS-222ENST00000550996 SLFNL1Q499Z3 407 aa25.37■■□□□ 1.65
CS-222ENST00000550996 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa25.37■■□□□ 1.65
CS-222ENST00000550996 SCYL3Q8IZE3 742 aa25.37■■□□□ 1.65
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CS-222ENST00000550996 PAG1Q9NWQ8 432 aa25.37■■□□□ 1.65
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CS-222ENST00000550996 SNAPC2Q13487 334 aa25.36■■□□□ 1.65
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CS-222ENST00000550996 TSHZ3Q63HK5 1081 aa25.36■■□□□ 1.65
CS-222ENST00000550996 ABHD8Q96I13 439 aa25.36■■□□□ 1.65
CS-222ENST00000550996 CHGBP05060 677 aa25.35■■□□□ 1.65
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CS-222ENST00000550996 PTPRAP18433 802 aa25.35■■□□□ 1.65
CS-222ENST00000550996 MOGSQ13724 837 aa25.35■■□□□ 1.65
CS-222ENST00000550996 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
CS-222ENST00000550996 DNAJC18Q9H819 358 aa25.35■■□□□ 1.65
CS-222ENST00000550996 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP25.35■■□□□ 1.65
CS-222ENST00000550996 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
CS-222ENST00000550996 PALD1Q9ULE6 856 aa25.35■■□□□ 1.65
CS-222ENST00000550996 SIPA1L1O43166 1804 aa25.35■■□□□ 1.65
CS-222ENST00000550996 ZNF532Q9HCE3 1301 aa25.35■■□□□ 1.65
CS-222ENST00000550996 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa25.34■■□□□ 1.65
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