RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545170.5

ATXN3-216, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene ATXN3, Length 6,950 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-216ENST00000545170 HOMER3Q9NSC5 361 aa9.59□□□□□ -0.87
ATXN3-216ENST00000545170 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
ATXN3-216ENST00000545170 NPHP3Q7Z494 1330 aa9.59□□□□□ -0.87
ATXN3-216ENST00000545170 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
ATXN3-216ENST00000545170 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP9.59□□□□□ -0.87
ATXN3-216ENST00000545170 LMNB2Q03252 620 aa9.59□□□□□ -0.87
ATXN3-216ENST00000545170 CCDC89Q8N998 374 aa9.59□□□□□ -0.87
ATXN3-216ENST00000545170 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
ATXN3-216ENST00000545170 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa9.59□□□□□ -0.87
ATXN3-216ENST00000545170 HAUS8Q9BT25 410 aa9.59□□□□□ -0.87
ATXN3-216ENST00000545170 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
ATXN3-216ENST00000545170 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 SLF1Q9BQI6 1058 aa9.58□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 DRC3Q9H069 523 aa9.58□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 TMTC1Q8IUR5 882 aa9.58□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 FLCNQ8NFG4 579 aa9.58□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 DTNBP1Q96EV8 351 aa9.58□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 NCAPGQ9BPX3 1015 aa9.58□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 HDAC9Q9UKV0 1011 aa9.58□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 EVI5O60447 810 aa9.58□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 ASIC2Q16515 512 aa9.58□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 FGD4Q96M96 766 aa9.58□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 ZNF287Q9HBT7 754 aa9.58□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 TSKSQ9UJT2 592 aa9.58□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa9.58□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP9.58□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 FAM13AO94988 1023 aa9.58□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 RASA3Q14644 834 aa9.58□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 HS2ST1Q7LGA3 356 aa9.58□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa9.58□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 LRMPQ12912 555 aa9.58□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 METTL24Q5JXM2 366 aa9.58□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 RAB17Q9H0T7 212 aa9.58□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 LMBRD1Q9NUN5 540 aa9.58□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 PARP2Q9UGN5 583 aa9.58□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 PYCARDQ9ULZ3 195 aa9.58□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 USP37Q86T82 979 aa9.57□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 SCYL3Q8IZE3 742 aa9.57□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 KLHL29Q96CT2 875 aa9.57□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 INTUQ9ULD6 942 aa9.57□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 MKL2Q9ULH7 1088 aa9.57□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 PSMD7P51665 324 aa9.57□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 NEK2P51955 445 aa9.57□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 LRRC8AQ8IWT6 810 aa9.57□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 CCHCR1Q8TD31 782 aa9.57□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 FAM167BQ9BTA0 163 aa9.57□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa9.57□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP9.57□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 NLRP12P59046 1061 aa9.57□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 NBPF20Q3BBV1 942 aa9.57□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 NXNQ6DKJ4 435 aa9.57□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 PPP4R1Q8TF05 950 aa9.57□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 NBPF3Q9H094 633 aa9.57□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa9.57□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 CCDC152Q4G0S7 254 aa9.57□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 VPS37BQ9H9H4 285 aa9.57□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 MIS18AQ9NYP9 233 aa9.57□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa9.57□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 LONRF2Q1L5Z9 754 aa9.57□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 LRGUKQ96M69 825 aa9.57□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 NFE2L2Q16236 605 aa9.57□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 BEND3Q5T5X7 828 aa9.57□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 CEP19Q96LK0 163 aa9.57□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 VAT1LQ9HCJ6 419 aa9.57□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 NLRP2Q9NX02 1062 aa9.57□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 F6X3S4 739 aa9.56□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 KRT75O95678 551 aa9.56□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 S100BP04271 92 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 ADKP55263 362 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 CCDC105Q8IYK2 499 aa9.56□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 EHMT1Q9H9B1 1298 aa9.56□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa9.56□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 BTBD11A6QL63 1104 aa9.56□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 KRT3P12035 628 aa9.56□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 HINFPQ9BQA5 517 aa9.56□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 ENO4A6NNW6 628 aa9.56□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 RCN2Q14257 317 aa9.56□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 SDCCAG3Q96C92 435 aa9.56□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa9.56□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 ECHDC1Q9NTX5 307 aa9.56□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP9.56□□□□□ -0.88
ATXN3-216ENST00000545170 DNAJC6O75061 913 aa9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.5 ms