RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543190.5

LTBR-211, Transcript of lymphotoxin beta receptor, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LTBR, Length 785 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBR-211ENST00000543190 ZFPM1Q8IX07 1006 aa23.05■■□□□ 1.28
LTBR-211ENST00000543190 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
LTBR-211ENST00000543190 ZNF384Q8TF68 577 aa23.05■■□□□ 1.28
LTBR-211ENST00000543190 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa23.05■■□□□ 1.28
LTBR-211ENST00000543190 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
LTBR-211ENST00000543190 MAST2Q6P0Q8 1798 aa23.04■■□□□ 1.28
LTBR-211ENST00000543190 CEP290O15078 2479 aa23.04■■□□□ 1.28
LTBR-211ENST00000543190 FOCADQ5VW36 1801 aa23.04■■□□□ 1.28
LTBR-211ENST00000543190 POTEFA5A3E0 1075 aa23.04■■□□□ 1.28
LTBR-211ENST00000543190 BCAR3O75815 825 aa23.04■■□□□ 1.28
LTBR-211ENST00000543190 RHBDL3P58872 404 aa23.04■■□□□ 1.28
LTBR-211ENST00000543190 MECOMQ03112 1051 aa23.04■■□□□ 1.28
LTBR-211ENST00000543190 POLA2Q14181 598 aa23.04■■□□□ 1.28
LTBR-211ENST00000543190 KIF22Q14807 665 aa23.04■■□□□ 1.28
LTBR-211ENST00000543190 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa23.04■■□□□ 1.28
LTBR-211ENST00000543190 SCYL3Q8IZE3 742 aa23.04■■□□□ 1.28
LTBR-211ENST00000543190 HMG20BQ9P0W2 317 aa23.04■■□□□ 1.28
LTBR-211ENST00000543190 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa23.04■■□□□ 1.28
LTBR-211ENST00000543190 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa23.03■■□□□ 1.28
LTBR-211ENST00000543190 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
LTBR-211ENST00000543190 ERICH6Q7L0X2 663 aa23.03■■□□□ 1.28
LTBR-211ENST00000543190 SPATA5Q8NB90 893 aa23.03■■□□□ 1.28
LTBR-211ENST00000543190 SSH3Q8TE77 659 aa23.03■■□□□ 1.28
LTBR-211ENST00000543190 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
LTBR-211ENST00000543190 ABCF2Q9UG63 623 aa23.03■■□□□ 1.28
LTBR-211ENST00000543190 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
LTBR-211ENST00000543190 PDHXO00330 501 aa23.02■■□□□ 1.28
LTBR-211ENST00000543190 LDHCP07864 332 aa23.02■■□□□ 1.28
LTBR-211ENST00000543190 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa23.02■■□□□ 1.28
LTBR-211ENST00000543190 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa23.02■■□□□ 1.28
LTBR-211ENST00000543190 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
LTBR-211ENST00000543190 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
LTBR-211ENST00000543190 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
LTBR-211ENST00000543190 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa23.02■■□□□ 1.28
LTBR-211ENST00000543190 ATAD5Q96QE3 1844 aa23.02■■□□□ 1.28
LTBR-211ENST00000543190 PTPRAP18433 802 aa23.01■■□□□ 1.27
LTBR-211ENST00000543190 BTDP43251 543 aa23.01■■□□□ 1.27
LTBR-211ENST00000543190 GSTO1P78417 241 aa23.01■■□□□ 1.27
LTBR-211ENST00000543190 GPAT2Q6NUI2 795 aa23.01■■□□□ 1.27
LTBR-211ENST00000543190 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
LTBR-211ENST00000543190 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa23.01■■□□□ 1.27
LTBR-211ENST00000543190 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
LTBR-211ENST00000543190 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa23■■□□□ 1.27
LTBR-211ENST00000543190 BCRP11274 1271 aa23■■□□□ 1.27
LTBR-211ENST00000543190 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP23■■□□□ 1.27
LTBR-211ENST00000543190 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
LTBR-211ENST00000543190 LOC285556D6RIA3 1793 aa22.99■■□□□ 1.27
LTBR-211ENST00000543190 NEUROD6Q96NK8 337 aa22.99■■□□□ 1.27
LTBR-211ENST00000543190 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
LTBR-211ENST00000543190 TMEM106CQ9BVX2 250 aa22.99■■□□□ 1.27
LTBR-211ENST00000543190 TNNQ9UQP3 1299 aa22.99■■□□□ 1.27
LTBR-211ENST00000543190 DOCK3Q8IZD9 2030 aa22.99■■□□□ 1.27
LTBR-211ENST00000543190 MCAMP43121 646 aa22.98■■□□□ 1.27
LTBR-211ENST00000543190 TMEM57Q8N5G2 664 aa22.98■■□□□ 1.27
LTBR-211ENST00000543190 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
LTBR-211ENST00000543190 TBC1D2Q9BYX2 928 aa22.98■■□□□ 1.27
LTBR-211ENST00000543190 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa22.98■■□□□ 1.27
LTBR-211ENST00000543190 PICK1Q9NRD5 415 aa22.98■■□□□ 1.27
LTBR-211ENST00000543190 SRRDQ9UH36 339 aa22.98■■□□□ 1.27
LTBR-211ENST00000543190 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
LTBR-211ENST00000543190 ZHX2Q9Y6X8 837 aa22.98■■□□□ 1.27
LTBR-211ENST00000543190 SIPA1L1O43166 1804 aa22.97■■□□□ 1.27
LTBR-211ENST00000543190 HOXD10P28358 340 aa22.97■■□□□ 1.27
LTBR-211ENST00000543190 ATP8B2P98198 1209 aa22.97■■□□□ 1.27
LTBR-211ENST00000543190 GCC1Q96CN9 775 aa22.97■■□□□ 1.27
LTBR-211ENST00000543190 TRIM47Q96LD4 638 aa22.97■■□□□ 1.27
LTBR-211ENST00000543190 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
LTBR-211ENST00000543190 PCDH10Q9P2E7 1040 aa22.97■■□□□ 1.27
LTBR-211ENST00000543190 CTGFP29279 349 aa22.96■■□□□ 1.27
LTBR-211ENST00000543190 GORABQ5T7V8 394 aa22.96■■□□□ 1.27
LTBR-211ENST00000543190 CLUAP1Q96AJ1 413 aa22.96■■□□□ 1.27
LTBR-211ENST00000543190 PPP4CP60510 307 aa22.95■■□□□ 1.26
LTBR-211ENST00000543190 PI16Q6UXB8 463 aa22.95■■□□□ 1.26
LTBR-211ENST00000543190 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
LTBR-211ENST00000543190 CPA4Q9UI42 421 aa22.95■■□□□ 1.26
LTBR-211ENST00000543190 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
LTBR-211ENST00000543190 EN2P19622 333 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
LTBR-211ENST00000543190 PSMC4P43686 418 aa22.94■■□□□ 1.26
LTBR-211ENST00000543190 TNNI3KQ59H18 835 aa22.94■■□□□ 1.26
LTBR-211ENST00000543190 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
LTBR-211ENST00000543190 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
LTBR-211ENST00000543190 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
LTBR-211ENST00000543190 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa22.94■■□□□ 1.26
LTBR-211ENST00000543190 CAPN2P17655 700 aa22.93■■□□□ 1.26
LTBR-211ENST00000543190 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa22.93■■□□□ 1.26
LTBR-211ENST00000543190 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
LTBR-211ENST00000543190 PLCG2P16885 1265 aa22.92■■□□□ 1.26
LTBR-211ENST00000543190 OSBPP22059 807 aa22.92■■□□□ 1.26
LTBR-211ENST00000543190 CCDC158Q5M9N0 1113 aa22.92■■□□□ 1.26
LTBR-211ENST00000543190 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
LTBR-211ENST00000543190 PICALMQ13492 652 aa22.91■■□□□ 1.26
LTBR-211ENST00000543190 LRP2BPQ9P2M1 347 aa22.91■■□□□ 1.26
LTBR-211ENST00000543190 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa22.91■■□□□ 1.26
LTBR-211ENST00000543190 CAP2P40123 477 aa22.9■■□□□ 1.26
LTBR-211ENST00000543190 FCGRTP55899 365 aa22.9■■□□□ 1.26
LTBR-211ENST00000543190 GINM1Q9NU53 330 aa22.9■■□□□ 1.26
LTBR-211ENST00000543190 RAI14Q9P0K7 980 aa22.9■■□□□ 1.26
LTBR-211ENST00000543190 ZBED9Q6R2W3 1325 aa22.89■■□□□ 1.26
LTBR-211ENST00000543190 BAG3O95817 575 aa22.89■■□□□ 1.25
LTBR-211ENST00000543190 CYP2C8P10632 490 aa22.89■■□□□ 1.25
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