RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539490.1

DYRK4-208, Transcript of dual specificity tyrosine phosphorylation regulated kinase 4, human

TSL 2

Gene DYRK4, Length 447 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DYRK4-208	ENST00000539490	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	7.49	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		7.49	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		7.49	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	LYPD8	Q6UX82	237 aa		7.49	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	WWC1	Q8IX03	1113 aa		7.49	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	LRRN4	Q8WUT4	740 aa		7.49	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	MXD3	Q9BW11	206 aa		7.49	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	PLSCR2	Q9NRY7	297 aa		7.49	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		7.48	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	MMP16	P51512	607 aa		7.48	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	GCKR	Q14397	625 aa		7.48	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	PTPRN	Q16849	979 aa		7.48	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	CCDC27	Q2M243	656 aa		7.48	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		7.48	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		7.48	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	MOB2	Q70IA6	237 aa		7.48	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		7.48	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		7.48	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	OGFOD1	Q8N543	542 aa		7.48	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		7.48	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	NUDT12	Q9BQG2	462 aa		7.48	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	COA1	Q9GZY4	146 aa		7.48	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		7.48	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		7.48	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		7.48	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	MED23	Q9ULK4	1368 aa		7.47	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	ZNF609	O15014	1411 aa		7.47	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	WNT10B	O00744	389 aa		7.47	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	ITGA6	P23229	1130 aa		7.47	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	GGCX	P38435	758 aa		7.47	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	FKBP1B	P68106	108 aa		7.47	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	DACT2	Q5SW24	774 aa		7.47	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		7.47	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		7.47	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		7.47	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		7.47	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		7.47	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	HMX1	Q9NP08	348 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	PLA2G2E	Q9NZK7	142 aa		7.47	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	PDE4DIP	Q5VU43	2346 aa		7.47	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		7.47	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		7.46	□□□□□ -1.21
DYRK4-208	ENST00000539490	APBB1	O00213	710 aa		7.46	□□□□□ -1.22
DYRK4-208	ENST00000539490	VAMP4	O75379	141 aa		7.46	□□□□□ -1.22
DYRK4-208	ENST00000539490	CSF1R	P07333	972 aa		7.46	□□□□□ -1.22
DYRK4-208	ENST00000539490	CCNYL3	P0C7X3	344 aa		7.46	□□□□□ -1.22
DYRK4-208	ENST00000539490	KLRK1	P26718	216 aa		7.46	□□□□□ -1.22
DYRK4-208	ENST00000539490	CASP7	P55210	303 aa		7.46	□□□□□ -1.22
DYRK4-208	ENST00000539490	GTF2I	P78347	998 aa		7.46	□□□□□ -1.22
DYRK4-208	ENST00000539490	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.22
DYRK4-208	ENST00000539490	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		7.46	□□□□□ -1.22
DYRK4-208	ENST00000539490	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		7.46	□□□□□ -1.22
DYRK4-208	ENST00000539490	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		7.46	□□□□□ -1.22
DYRK4-208	ENST00000539490	FCF1	Q9Y324	198 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.22
DYRK4-208	ENST00000539490	IL16	Q14005	1332 aa		7.46	□□□□□ -1.22
DYRK4-208	ENST00000539490	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		7.46	□□□□□ -1.22
DYRK4-208	ENST00000539490	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		7.45	□□□□□ -1.22
DYRK4-208	ENST00000539490	SNAP23	O00161	211 aa		7.45	□□□□□ -1.22
DYRK4-208	ENST00000539490	TAF5L	O75529	589 aa		7.45	□□□□□ -1.22
DYRK4-208	ENST00000539490	SASH1	O94885	1247 aa		7.45	□□□□□ -1.22
DYRK4-208	ENST00000539490	TBC1D8	O95759	1140 aa		7.45	□□□□□ -1.22
DYRK4-208	ENST00000539490	CTH	P32929	405 aa		7.45	□□□□□ -1.22
DYRK4-208	ENST00000539490	NF2	P35240	595 aa		7.45	□□□□□ -1.22
DYRK4-208	ENST00000539490	KCNJ4	P48050	445 aa		7.45	□□□□□ -1.22
DYRK4-208	ENST00000539490	MMP14	P50281	582 aa		7.45	□□□□□ -1.22
DYRK4-208	ENST00000539490	CHRND	Q07001	517 aa		7.45	□□□□□ -1.22
DYRK4-208	ENST00000539490	PRKG1	Q13976	671 aa		7.45	□□□□□ -1.22
DYRK4-208	ENST00000539490	PPP1R18	Q6NYC8	613 aa		7.45	□□□□□ -1.22
DYRK4-208	ENST00000539490	LINS1	Q8NG48	757 aa		7.45	□□□□□ -1.22
DYRK4-208	ENST00000539490	CD209	Q9NNX6	404 aa		7.45	□□□□□ -1.22
DYRK4-208	ENST00000539490	RNF223	E7ERA6	249 aa		7.44	□□□□□ -1.22
DYRK4-208	ENST00000539490		F6X3S4	739 aa		7.44	□□□□□ -1.22
DYRK4-208	ENST00000539490	TM4SF4	P48230	202 aa		7.44	□□□□□ -1.22
DYRK4-208	ENST00000539490	FOXO4	P98177	505 aa		7.44	□□□□□ -1.22
DYRK4-208	ENST00000539490	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	7.44	□□□□□ -1.22
DYRK4-208	ENST00000539490	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	7.44	□□□□□ -1.22
DYRK4-208	ENST00000539490	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	7.44	□□□□□ -1.22
DYRK4-208	ENST00000539490	NR6A1	Q15406	480 aa		7.44	□□□□□ -1.22
DYRK4-208	ENST00000539490	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		7.44	□□□□□ -1.22
DYRK4-208	ENST00000539490	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	7.44	□□□□□ -1.22
DYRK4-208	ENST00000539490	WDR63	Q8IWG1	891 aa		7.44	□□□□□ -1.22
DYRK4-208	ENST00000539490	MRS2	Q9HD23	443 aa		7.44	□□□□□ -1.22
DYRK4-208	ENST00000539490	EIF4ENIF1	Q9NRA8	985 aa	Known RBP	7.44	□□□□□ -1.22
DYRK4-208	ENST00000539490	MAP10	Q9P2G4	905 aa		7.44	□□□□□ -1.22
DYRK4-208	ENST00000539490	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		7.44	□□□□□ -1.22
DYRK4-208	ENST00000539490	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		7.44	□□□□□ -1.22
DYRK4-208	ENST00000539490	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		7.43	□□□□□ -1.22
DYRK4-208	ENST00000539490		F8W031	263 aa	Predicted RBP	7.43	□□□□□ -1.22
DYRK4-208	ENST00000539490	PLIN1	O60240	522 aa		7.43	□□□□□ -1.22
DYRK4-208	ENST00000539490	F12	P00748	615 aa	Predicted RBP	7.43	□□□□□ -1.22
DYRK4-208	ENST00000539490	SOX10	P56693	466 aa		7.43	□□□□□ -1.22
DYRK4-208	ENST00000539490	DLGAP5	Q15398	846 aa		7.43	□□□□□ -1.22
DYRK4-208	ENST00000539490	BEND3	Q5T5X7	828 aa		7.43	□□□□□ -1.22
DYRK4-208	ENST00000539490	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		7.43	□□□□□ -1.22
DYRK4-208	ENST00000539490	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22
DYRK4-208	ENST00000539490	CERS5	Q8N5B7	392 aa		7.43	□□□□□ -1.22
DYRK4-208	ENST00000539490	EPS8L1	Q8TE68	723 aa		7.43	□□□□□ -1.22
DYRK4-208	ENST00000539490	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	7.43	□□□□□ -1.22

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