RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531385.1

PTPRU-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRU, Length 737 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-211ENST00000531385 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPRU-211ENST00000531385 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPRU-211ENST00000531385 ATRNL1Q5VV63 1379 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPRU-211ENST00000531385 ENTPD3O75355 529 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRU-211ENST00000531385 DCAF15Q66K64 600 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRU-211ENST00000531385 TNS4Q8IZW8 715 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRU-211ENST00000531385 ZNF341Q9BYN7 854 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRU-211ENST00000531385 DCTPP1Q9H773 170 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRU-211ENST00000531385 CSADQ9Y600 493 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRU-211ENST00000531385 LAMB1P07942 1786 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRU-211ENST00000531385 CYP7A1P22680 504 aa22.85■■□□□ 1.25
PTPRU-211ENST00000531385 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
PTPRU-211ENST00000531385 MAGEB6Q8N7X4 407 aa22.85■■□□□ 1.25
PTPRU-211ENST00000531385 HOOK2Q96ED9 719 aa22.85■■□□□ 1.25
PTPRU-211ENST00000531385 OTUD5Q96G74 571 aa22.85■■□□□ 1.25
PTPRU-211ENST00000531385 UNCXA6NJT0 531 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRU-211ENST00000531385 GOLIM4O00461 696 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRU-211ENST00000531385 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
PTPRU-211ENST00000531385 MIGA1Q8NAN2 632 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRU-211ENST00000531385 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
PTPRU-211ENST00000531385 BOLA2Q9H3K6 86 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRU-211ENST00000531385 SAGE1Q9NXZ1 904 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRU-211ENST00000531385 FAM196BA6NMK8 535 aa22.83■■□□□ 1.25
PTPRU-211ENST00000531385 TM4SF4P48230 202 aa22.83■■□□□ 1.25
PTPRU-211ENST00000531385 SREBF2Q12772 1141 aa22.83■■□□□ 1.25
PTPRU-211ENST00000531385 FOCADQ5VW36 1801 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRU-211ENST00000531385 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
PTPRU-211ENST00000531385 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP22.82■■□□□ 1.24
PTPRU-211ENST00000531385 TBC1D8O95759 1140 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRU-211ENST00000531385 TSHZ3Q63HK5 1081 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRU-211ENST00000531385 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
PTPRU-211ENST00000531385 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
PTPRU-211ENST00000531385 SIPA1L1O43166 1804 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRU-211ENST00000531385 SPDYE5A6NIY4 337 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRU-211ENST00000531385 MAP3K12Q12852 859 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRU-211ENST00000531385 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRU-211ENST00000531385 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP22.81■■□□□ 1.24
PTPRU-211ENST00000531385 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRU-211ENST00000531385 BAG3O95817 575 aa22.8■■□□□ 1.24
PTPRU-211ENST00000531385 ATP5JP18859 108 aa22.8■■□□□ 1.24
PTPRU-211ENST00000531385 PPP4CP60510 307 aa22.8■■□□□ 1.24
PTPRU-211ENST00000531385 SLFNL1Q499Z3 407 aa22.8■■□□□ 1.24
PTPRU-211ENST00000531385 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa22.8■■□□□ 1.24
PTPRU-211ENST00000531385 ZNF112Q9UJU3 913 aa22.8■■□□□ 1.24
PTPRU-211ENST00000531385 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
PTPRU-211ENST00000531385 PDE6AP16499 860 aa22.79■■□□□ 1.24
PTPRU-211ENST00000531385 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa22.79■■□□□ 1.24
PTPRU-211ENST00000531385 IFNL1Q8IU54 200 aa22.79■■□□□ 1.24
PTPRU-211ENST00000531385 MS4A4AQ96JQ5 239 aa22.79■■□□□ 1.24
PTPRU-211ENST00000531385 PAG1Q9NWQ8 432 aa22.79■■□□□ 1.24
PTPRU-211ENST00000531385 FLT1P17948 1338 aa22.79■■□□□ 1.24
PTPRU-211ENST00000531385 PHF20L1A8MW92 1017 aa22.78■■□□□ 1.24
PTPRU-211ENST00000531385 NPM3O75607 178 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
PTPRU-211ENST00000531385 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
PTPRU-211ENST00000531385 CHGBP05060 677 aa22.78■■□□□ 1.24
PTPRU-211ENST00000531385 ERO1BQ86YB8 467 aa22.78■■□□□ 1.24
PTPRU-211ENST00000531385 EXOC6Q8TAG9 804 aa22.78■■□□□ 1.24
PTPRU-211ENST00000531385 BRI3BPQ8WY22 251 aa22.78■■□□□ 1.24
PTPRU-211ENST00000531385 HAUS7Q99871 368 aa22.78■■□□□ 1.24
PTPRU-211ENST00000531385 PTPN18Q99952 460 aa22.78■■□□□ 1.24
PTPRU-211ENST00000531385 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
PTPRU-211ENST00000531385 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
PTPRU-211ENST00000531385 IRF6O14896 467 aa22.77■■□□□ 1.24
PTPRU-211ENST00000531385 PLCG2P16885 1265 aa22.77■■□□□ 1.24
PTPRU-211ENST00000531385 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
PTPRU-211ENST00000531385 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa22.77■■□□□ 1.24
PTPRU-211ENST00000531385 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
PTPRU-211ENST00000531385 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
PTPRU-211ENST00000531385 DOCK1Q14185 1865 aa22.77■■□□□ 1.24
PTPRU-211ENST00000531385 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRU-211ENST00000531385 CCL15Q16663 113 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRU-211ENST00000531385 MYH7P12883 1935 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRU-211ENST00000531385 ZNF532Q9HCE3 1301 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRU-211ENST00000531385 MYH1P12882 1939 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRU-211ENST00000531385 MAP3K10Q02779 954 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRU-211ENST00000531385 PPIL2Q13356 520 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRU-211ENST00000531385 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
PTPRU-211ENST00000531385 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
PTPRU-211ENST00000531385 ECHDC1Q9NTX5 307 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRU-211ENST00000531385 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRU-211ENST00000531385 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
PTPRU-211ENST00000531385 IGSF3O75054 1194 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRU-211ENST00000531385 CAPN15O75808 1086 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRU-211ENST00000531385 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
PTPRU-211ENST00000531385 IFFO2Q5TF58 517 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRU-211ENST00000531385 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
PTPRU-211ENST00000531385 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP22.74■■□□□ 1.23
PTPRU-211ENST00000531385 PALD1Q9ULE6 856 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRU-211ENST00000531385 ATAD5Q96QE3 1844 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRU-211ENST00000531385 NAV1Q8NEY1 1877 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRU-211ENST00000531385 GTF2A2P52657 109 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRU-211ENST00000531385 INHBEP58166 350 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRU-211ENST00000531385 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
PTPRU-211ENST00000531385 SCYL3Q8IZE3 742 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRU-211ENST00000531385 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
PTPRU-211ENST00000531385 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRU-211ENST00000531385 USP5P45974 858 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRU-211ENST00000531385 PPATQ06203 517 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRU-211ENST00000531385 CRHR2Q13324 411 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRU-211ENST00000531385 FAM43AQ8N2R8 423 aa22.72■■□□□ 1.23
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