RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531226.5

PACSIN3-208, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 654 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-208ENST00000531226 PDE6AP16499 860 aa23.06■■□□□ 1.28
PACSIN3-208ENST00000531226 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa23.06■■□□□ 1.28
PACSIN3-208ENST00000531226 RASAL3Q86YV0 1011 aa23.06■■□□□ 1.28
PACSIN3-208ENST00000531226 PI4K2BQ8TCG2 481 aa23.06■■□□□ 1.28
PACSIN3-208ENST00000531226 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
PACSIN3-208ENST00000531226 UNCXA6NJT0 531 aa23.05■■□□□ 1.28
PACSIN3-208ENST00000531226 AOC2O75106 756 aa23.05■■□□□ 1.28
PACSIN3-208ENST00000531226 MAP2K2P36507 400 aa23.05■■□□□ 1.28
PACSIN3-208ENST00000531226 NOGQ13253 232 aa23.05■■□□□ 1.28
PACSIN3-208ENST00000531226 DCAF15Q66K64 600 aa23.05■■□□□ 1.28
PACSIN3-208ENST00000531226 CERS3Q8IU89 383 aa23.05■■□□□ 1.28
PACSIN3-208ENST00000531226 LNPKQ9C0E8 428 aa23.05■■□□□ 1.28
PACSIN3-208ENST00000531226 ATAD5Q96QE3 1844 aa23.05■■□□□ 1.28
PACSIN3-208ENST00000531226 ATRNL1Q5VV63 1379 aa23.04■■□□□ 1.28
PACSIN3-208ENST00000531226 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
PACSIN3-208ENST00000531226 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
PACSIN3-208ENST00000531226 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa23.04■■□□□ 1.28
PACSIN3-208ENST00000531226 MIGA1Q8NAN2 632 aa23.04■■□□□ 1.28
PACSIN3-208ENST00000531226 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP23.04■■□□□ 1.28
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF532Q9HCE3 1301 aa23.04■■□□□ 1.28
PACSIN3-208ENST00000531226 DOCK1Q14185 1865 aa23.03■■□□□ 1.28
PACSIN3-208ENST00000531226 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa23.03■■□□□ 1.28
PACSIN3-208ENST00000531226 ADD2P35612 726 aa23.03■■□□□ 1.28
PACSIN3-208ENST00000531226 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa23.03■■□□□ 1.28
PACSIN3-208ENST00000531226 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
PACSIN3-208ENST00000531226 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa23.03■■□□□ 1.28
PACSIN3-208ENST00000531226 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
PACSIN3-208ENST00000531226 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
PACSIN3-208ENST00000531226 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
PACSIN3-208ENST00000531226 NUCB1Q02818 461 aa23.02■■□□□ 1.28
PACSIN3-208ENST00000531226 CHD1LQ86WJ1 897 aa23.02■■□□□ 1.28
PACSIN3-208ENST00000531226 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP23.02■■□□□ 1.28
PACSIN3-208ENST00000531226 CSRNP1Q96S65 589 aa23.02■■□□□ 1.28
PACSIN3-208ENST00000531226 STAP2Q9UGK3 403 aa23.02■■□□□ 1.28
PACSIN3-208ENST00000531226 PDE1AP54750 535 aa23.01■■□□□ 1.27
PACSIN3-208ENST00000531226 MIGA2Q7L4E1 593 aa23.01■■□□□ 1.27
PACSIN3-208ENST00000531226 KBTBD3Q8NAB2 608 aa23.01■■□□□ 1.27
PACSIN3-208ENST00000531226 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa23.01■■□□□ 1.27
PACSIN3-208ENST00000531226 CLMNQ96JQ2 1002 aa23.01■■□□□ 1.27
PACSIN3-208ENST00000531226 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF341Q9BYN7 854 aa23.01■■□□□ 1.27
PACSIN3-208ENST00000531226 FLT1P17948 1338 aa23.01■■□□□ 1.27
PACSIN3-208ENST00000531226 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa23■■□□□ 1.27
PACSIN3-208ENST00000531226 MAP3K9P80192 1104 aa23■■□□□ 1.27
PACSIN3-208ENST00000531226 UBE3CQ15386 1083 aa23■■□□□ 1.27
PACSIN3-208ENST00000531226 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa23■■□□□ 1.27
PACSIN3-208ENST00000531226 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
PACSIN3-208ENST00000531226 ZIC5Q96T25 663 aa23■■□□□ 1.27
PACSIN3-208ENST00000531226 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
PACSIN3-208ENST00000531226 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa22.99■■□□□ 1.27
PACSIN3-208ENST00000531226 SLC10A4Q96EP9 437 aa22.99■■□□□ 1.27
PACSIN3-208ENST00000531226 WRNIP1Q96S55 665 aa22.99■■□□□ 1.27
PACSIN3-208ENST00000531226 MYH8P13535 1937 aa22.99■■□□□ 1.27
PACSIN3-208ENST00000531226 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3-208ENST00000531226 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3-208ENST00000531226 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3-208ENST00000531226 SLFNL1Q499Z3 407 aa22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3-208ENST00000531226 WBP1LQ9NX94 342 aa22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3-208ENST00000531226 CSADQ9Y600 493 aa22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3-208ENST00000531226 PHIPQ8WWQ0 1821 aa22.97■■□□□ 1.27
PACSIN3-208ENST00000531226 CHGBP05060 677 aa22.97■■□□□ 1.27
PACSIN3-208ENST00000531226 MAP3K10Q02779 954 aa22.97■■□□□ 1.27
PACSIN3-208ENST00000531226 VGLL4Q14135 290 aa22.97■■□□□ 1.27
PACSIN3-208ENST00000531226 SPRYD7Q5W111 196 aa22.97■■□□□ 1.27
PACSIN3-208ENST00000531226 WNK4Q96J92 1243 aa22.97■■□□□ 1.27
PACSIN3-208ENST00000531226 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF112Q9UJU3 913 aa22.97■■□□□ 1.27
PACSIN3-208ENST00000531226 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-208ENST00000531226 USP5P45974 858 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-208ENST00000531226 LCORLQ8N3X6 602 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-208ENST00000531226 ELP3Q9H9T3 547 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-208ENST00000531226 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-208ENST00000531226 PCNTO95613 3336 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-208ENST00000531226 PTPRFP10586 1907 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-208ENST00000531226 TBC1D12O60347 775 aa22.95■■□□□ 1.26
PACSIN3-208ENST00000531226 INPP5BP32019 993 aa22.95■■□□□ 1.26
PACSIN3-208ENST00000531226 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
PACSIN3-208ENST00000531226 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
PACSIN3-208ENST00000531226 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa22.95■■□□□ 1.26
PACSIN3-208ENST00000531226 MBD4O95243 580 aa22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-208ENST00000531226 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-208ENST00000531226 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-208ENST00000531226 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-208ENST00000531226 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-208ENST00000531226 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-208ENST00000531226 FSD1Q9BTV5 496 aa22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-208ENST00000531226 OSBPL3Q9H4L5 887 aa22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-208ENST00000531226 ARMT1Q9H993 441 aa22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-208ENST00000531226 PI4KBQ9UBF8 816 aa22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-208ENST00000531226 PHF20L1A8MW92 1017 aa22.93■■□□□ 1.26
PACSIN3-208ENST00000531226 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
PACSIN3-208ENST00000531226 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
PACSIN3-208ENST00000531226 SLURP2P0DP57 97 aa22.93■■□□□ 1.26
PACSIN3-208ENST00000531226 GJA5P36382 358 aa22.93■■□□□ 1.26
PACSIN3-208ENST00000531226 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
PACSIN3-208ENST00000531226 APPBP2Q92624 585 aa22.93■■□□□ 1.26
PACSIN3-208ENST00000531226 AIDAQ96BJ3 306 aa22.93■■□□□ 1.26
PACSIN3-208ENST00000531226 OPTNQ96CV9 577 aa22.93■■□□□ 1.26
PACSIN3-208ENST00000531226 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
PACSIN3-208ENST00000531226 PALD1Q9ULE6 856 aa22.93■■□□□ 1.26
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